More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2292 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2292  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
637 aa  1270    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.042334  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5185  sodium/hydrogen exchanger  45.25 
 
 
660 aa  435  1e-121  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3229  sodium/hydrogen exchanger  37.54 
 
 
652 aa  358  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2891  sodium/hydrogen exchanger  37.54 
 
 
652 aa  358  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1446  sodium/hydrogen exchanger  36.51 
 
 
641 aa  357  5e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2740  Sodium/hydrogen exchanger  36.88 
 
 
629 aa  350  6e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0888  sodium/hydrogen exchanger  36.02 
 
 
628 aa  330  5.0000000000000004e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.043911 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0956  sodium/hydrogen exchanger  36.74 
 
 
639 aa  329  1.0000000000000001e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0859  sodium/hydrogen exchanger  35.8 
 
 
640 aa  329  1.0000000000000001e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0511  sodium/hydrogen exchanger  35.84 
 
 
622 aa  277  4e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0220  hypothetical protein  37.47 
 
 
598 aa  274  3e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1363  sodium/hydrogen exchanger  32.78 
 
 
610 aa  268  2e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00040523  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4262  sodium/hydrogen exchanger  36.18 
 
 
741 aa  262  1e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.387435  normal  0.153793 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2318  sodium/hydrogen exchanger  38.7 
 
 
599 aa  262  1e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0395796  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3265  hypothetical protein  31.58 
 
 
612 aa  258  2e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.769883  normal  0.438481 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0127  sodium/hydrogen exchanger  34.49 
 
 
760 aa  258  2e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.302904  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1211  Sodium/hydrogen exchanger  35.64 
 
 
611 aa  258  3e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04922  Na+/K+/H+ antiporter  34.17 
 
 
597 aa  254  3e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2394  Na+/H+ antiporter  42.06 
 
 
593 aa  253  5.000000000000001e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00954713  hitchhiker  0.00302602 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16030  putative sodium/hydrogen antiporter  36.18 
 
 
611 aa  253  9.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0707  sodium/hydrogen exchanger  37.78 
 
 
651 aa  251  2e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1380  putative sodium/hydrogen antiporter  36.18 
 
 
611 aa  251  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00463957  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0521  Sodium/hydrogen exchanger  32.19 
 
 
604 aa  250  5e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2605  sodium/hydrogen exchanger  37.33 
 
 
637 aa  249  8e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00858761  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1072  sodium/hydrogen exchanger  37.3 
 
 
601 aa  249  9e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.558941  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0146  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  33.81 
 
 
763 aa  249  1e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000269507 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4478  sodium/hydrogen exchanger  36.32 
 
 
602 aa  248  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0850  sodium/hydrogen exchanger  32.11 
 
 
617 aa  248  3e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000727  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  33.82 
 
 
599 aa  247  6e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4152  sodium/hydrogen exchanger  37.53 
 
 
608 aa  247  6e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.561792 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2109  sodium/hydrogen exchanger  38.57 
 
 
643 aa  246  9e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235083  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1998  sodium/hydrogen exchanger  37.02 
 
 
616 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000112153 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1871  sodium/hydrogen exchanger family protein  36.88 
 
 
666 aa  244  3e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4254  sodium/hydrogen exchanger  37.99 
 
 
601 aa  243  7e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0156  sodium/hydrogen exchanger  33.54 
 
 
764 aa  243  7.999999999999999e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2537  sodium/hydrogen exchanger family protein  37.7 
 
 
669 aa  243  9e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1024  Sodium/hydrogen exchanger  35.76 
 
 
602 aa  241  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30796  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2324  sodium/hydrogen exchanger  37.11 
 
 
670 aa  242  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.339898  normal  0.580137 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1467  sodium/hydrogen exchanger  37.53 
 
 
601 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.236845 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3909  Na+/H+ antiporter  32.78 
 
 
607 aa  240  5e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1861  sodium/hydrogen exchanger  36.94 
 
 
719 aa  239  8e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.182882  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2147  sodium/hydrogen exchanger  36.59 
 
 
670 aa  239  1e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251145  normal  0.368531 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2224  sodium/hydrogen exchanger  36.59 
 
 
673 aa  239  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00760493  normal  0.0969988 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2400  sodium/hydrogen exchanger  37.22 
 
 
625 aa  238  3e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000130765  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2065  sodium/hydrogen exchanger  38.01 
 
 
660 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000562767  hitchhiker  0.000963897 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2017  sodium/hydrogen exchanger  37.78 
 
 
660 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000155921  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2308  sodium/hydrogen exchanger  37.78 
 
 
660 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2321  sodium/hydrogen exchanger  37.78 
 
 
660 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.545125  hitchhiker  0.000203679 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03225  Na(+):H(+) antiporter, CPA1 family protein  31.96 
 
 
625 aa  234  5e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1982  sodium/hydrogen exchanger  32.15 
 
 
619 aa  233  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00461  Na+/H+ antiporter  32.43 
 
 
569 aa  232  2e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0477  sodium/hydrogen exchanger  36.34 
 
 
616 aa  231  4e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0802705  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0424  sodium/hydrogen exchanger  37.39 
 
 
852 aa  227  5.0000000000000005e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0868  Na(+):H(+) antiporter  34.13 
 
 
606 aa  226  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3722  TrkA-N domain protein  32.02 
 
 
617 aa  221  1.9999999999999999e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4286  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.92 
 
 
596 aa  217  5e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0381852  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4369  sodium/hydrogen exchanger  29.71 
 
 
596 aa  217  5.9999999999999996e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4667  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.92 
 
 
596 aa  217  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4275  Na+/H+ exchanger (Na+/H+ antiporter)  29.71 
 
 
596 aa  216  7e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4654  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.71 
 
 
596 aa  216  8e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4781  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.71 
 
 
596 aa  216  8e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4436  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.71 
 
 
596 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00005477  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1732  sodium/hydrogen exchanger  37.24 
 
 
702 aa  213  1e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2869  sodium/hydrogen exchanger  33.15 
 
 
623 aa  212  2e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.824474  normal  0.920346 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0759  sodium/hydrogen exchanger  35.99 
 
 
584 aa  209  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135673  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0112  TrkA-N domain protein  32.49 
 
 
617 aa  205  2e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  31.96 
 
 
630 aa  202  9.999999999999999e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0042  sodium/hydrogen exchanger  31.71 
 
 
607 aa  197  4.0000000000000005e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126585  normal  0.101979 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0472  CPA1 family Na+/H+ antiporter  37.43 
 
 
399 aa  193  7e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0494569  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05361  CPA1 family Na+/H+ antiporter  36.03 
 
 
399 aa  192  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06781  putative Na+/H+ antiporter, CPA1 family  37.02 
 
 
421 aa  192  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4282  sodium/hydrogen exchanger  35.44 
 
 
609 aa  190  7e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2077  Na+/H+ antiporter, putative  28.25 
 
 
595 aa  190  9e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  31.28 
 
 
626 aa  184  5.0000000000000004e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04971  CPA1 family Na+/H+ antiporter  37.43 
 
 
401 aa  182  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  31.7 
 
 
628 aa  182  2e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05271  CPA1 family Na+/H+ antiporter  37.28 
 
 
401 aa  179  1e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0377759  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1720  CPA1 family Na+/H+ antiporter  38.83 
 
 
414 aa  179  2e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04731  CPA1 family Na+/H+ antiporter  36.9 
 
 
402 aa  177  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.281963  normal  0.831051 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19170  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  32.6 
 
 
640 aa  175  1.9999999999999998e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.490991  normal  0.0684118 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05281  CPA1 family Na+/H+ antiporter  36.59 
 
 
414 aa  170  8e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0626531  normal  0.0646135 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1805  CPA1 family Na+/H+ antiporter  36.59 
 
 
414 aa  169  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.781588  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3821  sodium/hydrogen exchanger  37.85 
 
 
407 aa  155  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0640  CPA1 family Na+/H+ antiporter  36.41 
 
 
421 aa  150  8e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7379  potassium/proton antiporter  30.38 
 
 
597 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1590  potassium/proton antiporter  24.7 
 
 
498 aa  111  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.609323  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0580  potassium/proton antiporter  29.44 
 
 
598 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316248  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0337  potassium/proton antiporter  31.69 
 
 
597 aa  108  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3728  sodium/hydrogen exchanger  29.28 
 
 
496 aa  108  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0432  potassium/proton antiporter  31.69 
 
 
597 aa  107  6e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0056  potassium/proton antiporter  30 
 
 
597 aa  107  7e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  28.99 
 
 
596 aa  106  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0222  potassium/proton antiporter  26.71 
 
 
499 aa  106  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0921  sodium/hydrogen exchanger  31.67 
 
 
574 aa  105  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0538395  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0657  potassium/proton antiporter  27.82 
 
 
597 aa  103  8e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0833853 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3335  sodium/hydrogen exchanger  42.21 
 
 
620 aa  100  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002210  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  24.49 
 
 
581 aa  99.8  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.90325  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0393  potassium/proton antiporter  29.6 
 
 
597 aa  99.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2255  sodium/hydrogen exchanger  30.34 
 
 
573 aa  97.4  6e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272655  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0869  sodium/hydrogen exchanger  27.33 
 
 
417 aa  96.7  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>