More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2243 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2243  aminotransferase class V  100 
 
 		 380 aa  778    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2808  aminotransferase, class V  62.37 
 
 		 379 aa  470  1.0000000000000001e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2179  cysteine desulfurase  52.39 
 
 		 373 aa  408  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  50.13 
 
 		 392 aa  392  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  50.92 
 
 		 394 aa  390  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  51.33 
 
 		 379 aa  382  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  48.8 
 
 		 384 aa  379  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  50.13 
 
 		 382 aa  378  1e-104  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  49.34 
 
 		 394 aa  380  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  48.53 
 
 		 384 aa  375  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  50.26 
 
 		 392 aa  378  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  49.6 
 
 		 400 aa  376  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0624  aminotransferase, class V  51.06 
 
 		 385 aa  372  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292698 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  49.34 
 
 		 382 aa  374  1e-102  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  49.87 
 
 		 396 aa  370  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  48.4 
 
 		 394 aa  366  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  48.95 
 
 		 399 aa  366  1e-100  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2865  cysteine desulfurase  51.74 
 
 		 373 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0379  cysteine desulfurase  51.74 
 
 		 373 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1225  cysteine desulfurase  51.74 
 
 		 414 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.738138  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1755  cysteine desulfurase  51.74 
 
 		 373 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.983783  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0422  cysteine desulfurase  51.74 
 
 		 373 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  47.91 
 
 		 398 aa  368  1e-100  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1568  cysteine desulfurase  51.74 
 
 		 373 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  48.27 
 
 		 396 aa  363  2e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  47.89 
 
 		 398 aa  364  2e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  48.28 
 
 		 414 aa  359  4e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  47.88 
 
 		 402 aa  357  9.999999999999999e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1551  aminotransferase class V  49.21 
 
 		 383 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  47.49 
 
 		 398 aa  355  1e-96  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  46.95 
 
 		 404 aa  351  1e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  45.87 
 
 		 393 aa  351  1e-95  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  48.28 
 
 		 396 aa  351  1e-95  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  46.7 
 
 		 389 aa  350  2e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  46.28 
 
 		 403 aa  350  2e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  46.05 
 
 		 396 aa  351  2e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  48.15 
 
 		 400 aa  350  3e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  46.84 
 
 		 398 aa  348  1e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  46.84 
 
 		 398 aa  348  1e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0188  aminotransferase class V  49.07 
 
 		 382 aa  346  4e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.431625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2805  cysteine desulfurase  47.26 
 
 		 404 aa  345  6e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2698  cysteine desulfurase  47.26 
 
 		 404 aa  345  6e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.016381  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2917  cysteine desulfurase  47.26 
 
 		 404 aa  345  6e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2742  cysteine desulfurase  47.26 
 
 		 404 aa  345  6e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.46384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2751  cysteine desulfurase  46.61 
 
 		 404 aa  344  1e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.173578  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02422  cysteine desulfurase  47.26 
 
 		 404 aa  344  1e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1138  cysteine desulfurase IscS  47.26 
 
 		 404 aa  344  1e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  47 
 
 		 404 aa  344  1e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3762  cysteine desulfurase  47.26 
 
 		 404 aa  344  1e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00149492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2905  cysteine desulfurase  47.26 
 
 		 404 aa  344  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0404853  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02386  hypothetical protein  47.26 
 
 		 404 aa  344  1e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730969  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2683  cysteine desulfurase  47.26 
 
 		 404 aa  344  1e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.980146  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1147  cysteine desulfurase  47.26 
 
 		 404 aa  344  1e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0105086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2681  cysteine desulfurase  47.26 
 
 		 404 aa  344  1e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174524  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2815  cysteine desulfurase  47.26 
 
 		 404 aa  344  1e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00976282  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2558  cysteine desulfurase NifS  46.24 
 
 		 388 aa  344  2e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.947611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2783  cysteine desulfurase  47 
 
 		 404 aa  343  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0158517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3627  cysteine desulfurase  46.74 
 
 		 404 aa  343  2.9999999999999997e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0168495  normal  0.888851 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1104  cysteine desulfurase  46.48 
 
 		 404 aa  342  5e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.013649  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  46.54 
 
 		 404 aa  342  5e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  48 
 
 		 400 aa  342  8e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  48.95 
 
 		 392 aa  342  9e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16873  predicted protein  48.86 
 
 		 405 aa  341  1e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0124247  normal  0.537362 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1244  cysteine desulfurase  47 
 
 		 404 aa  341  1e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  46.68 
 
 		 384 aa  341  2e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  46.81 
 
 		 394 aa  339  4e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  45.36 
 
 		 393 aa  339  5e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  45.36 
 
 		 388 aa  339  5e-92  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3027  cysteine desulfurase  46.48 
 
 		 404 aa  338  9.999999999999999e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0576674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  47.48 
 
 		 398 aa  337  9.999999999999999e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  45.67 
 
 		 388 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0822  cysteine desulfurase IscS  45.79 
 
 		 421 aa  337  2.9999999999999997e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.02372  normal  0.880264 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0673  cysteine desulfurase IscS  45.79 
 
 		 407 aa  337  2.9999999999999997e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0872  cysteine desulfurase  49.33 
 
 		 380 aa  335  5e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0149083 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  46.8 
 
 		 409 aa  335  7.999999999999999e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  45.26 
 
 		 391 aa  333  2e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  48.28 
 
 		 390 aa  334  2e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  45.79 
 
 		 400 aa  334  2e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3062  cysteine desulfurase IscS  43.46 
 
 		 403 aa  332  6e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.635367  unclonable  0.000000859331 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  45.87 
 
 		 402 aa  330  2e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  44.18 
 
 		 389 aa  330  2e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  44.18 
 
 		 389 aa  330  2e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1297  aminotransferase class V  44.94 
 
 		 403 aa  330  2e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.216598  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3416  aminotransferase class V  47 
 
 		 399 aa  330  3e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.425221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  44.59 
 
 		 399 aa  330  3e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  43.92 
 
 		 389 aa  328  9e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2264  cysteine desulfurase  44.79 
 
 		 404 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  47.23 
 
 		 401 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  44.18 
 
 		 407 aa  327  3e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  45.26 
 
 		 383 aa  327  3e-88  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  43.92 
 
 		 407 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1063  aminotransferase class V  44.01 
 
 		 388 aa  326  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  45.87 
 
 		 381 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0281  cysteine desulfurase  44.13 
 
 		 404 aa  325  6e-88  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.910551  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  43.92 
 
 		 407 aa  325  7e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  44.18 
 
 		 407 aa  325  9e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  44.18 
 
 		 407 aa  325  9e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0437  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  44.88 
 
 		 388 aa  325  9e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00696357  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  44.18 
 
 		 407 aa  325  9e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  44.18 
 
 		 407 aa  325  9e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>