More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2236 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2236  N-6 DNA methylase  100 
 
 		 528 aa  1091    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1303  N-6 DNA methylase  60.57 
 
 		 529 aa  642    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.529987 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2666  type I restriction-modification system specificity subunit  63.72 
 
 		 508 aa  681    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.289078  normal  0.157244 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1221  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  66.05 
 
 		 533 aa  717    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0004  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  62.38 
 
 		 517 aa  665    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2329  N-6 DNA methylase  59.25 
 
 		 538 aa  625  1e-178  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0022  N-6 DNA methylase  61.72 
 
 		 495 aa  594  1e-168  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.204705  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0030  N-6 DNA methylase  61.72 
 
 		 495 aa  594  1e-168  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0191758 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1712  N-6 DNA methylase  62.88 
 
 		 662 aa  569  1e-161  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.857909  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2469  N-6 DNA methylase  57.38 
 
 		 772 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2365  N-6 DNA methylase  45.54 
 
 		 526 aa  447  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.725173  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3498  N-6 DNA methylase  50.33 
 
 		 694 aa  432  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.100632 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4352  N-6 DNA methylase  48.07 
 
 		 565 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0332  N-6 DNA methylase  45.66 
 
 		 709 aa  383  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2453  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  40.07 
 
 		 538 aa  381  1e-104  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.53896  normal  0.845275 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3006  N-6 DNA methylase  41.39 
 
 		 520 aa  378  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.809429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2743  type I restriction system adenine methylase  41.08 
 
 		 518 aa  369  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2017  N-6 DNA methylase  42.44 
 
 		 517 aa  371  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.54323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0034  N-6 DNA methylase  39.85 
 
 		 544 aa  366  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966218 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0019  N-6 DNA methylase  39.77 
 
 		 501 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00151011 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12769  type I restriction/modification system DNA methylase hsdM  40.22 
 
 		 540 aa  362  9e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2418  N-6 DNA methylase  38.51 
 
 		 525 aa  362  1e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.572428  normal  0.0719197 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2793  type I restriction-modification system, M subunit  38.51 
 
 		 525 aa  362  1e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0039  N-6 DNA methylase  39.58 
 
 		 501 aa  361  2e-98  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.250679  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3128  N-6 DNA methylase  38.95 
 
 		 518 aa  357  1.9999999999999998e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.465456  decreased coverage  0.00982418 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4931  type I restriction-modification system, M subunit  39.48 
 
 		 539 aa  353  2.9999999999999997e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.748503  normal  0.593383 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2789  N-6 DNA methylase  38.4 
 
 		 532 aa  353  5.9999999999999994e-96  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3758  N-6 DNA methylase  39.05 
 
 		 511 aa  353  5.9999999999999994e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.921564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1359  N-6 DNA methylase  38.99 
 
 		 529 aa  352  1e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.315285 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1222  N-6 DNA methylase  37.29 
 
 		 519 aa  347  2e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0869  N-6 DNA methylase  36.24 
 
 		 510 aa  348  2e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0877  putative type I restriction-modification system, M subunit  38.42 
 
 		 529 aa  343  4e-93  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.528701 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4006  N-6 DNA methylase  37.36 
 
 		 514 aa  343  5.999999999999999e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3915  N-6 DNA methylase  39.37 
 
 		 541 aa  340  4e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2909  N4/N6-methyltransferase family protein  37.48 
 
 		 515 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1644  N-6 DNA methylase  37.64 
 
 		 498 aa  336  5e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0286  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  36.95 
 
 		 497 aa  335  1e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1858  N-6 DNA methylase  36.91 
 
 		 540 aa  335  1e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2908  N-6 DNA methylase  36.61 
 
 		 523 aa  333  5e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  37.21 
 
 		 503 aa  333  6e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2509  site-specific DNA-methyltransferase  38.95 
 
 		 540 aa  331  2e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.642426 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0224  Type I restriction-modification system, M subunit  36.43 
 
 		 519 aa  330  3e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1102  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  39 
 
 		 548 aa  331  3e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.358797  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1086  type I restriction-modification system, M subunit  36.58 
 
 		 576 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3148  N-6 DNA methylase  36.94 
 
 		 540 aa  327  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.303766 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2248  N-6 DNA methylase  38.01 
 
 		 521 aa  322  1.9999999999999998e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0522014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4777  N-6 DNA methylase  35.88 
 
 		 517 aa  320  3.9999999999999996e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.797401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1940  N-6 DNA methylase  35.53 
 
 		 535 aa  319  6e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0625168  normal  0.0625802 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3910  N-6 DNA methylase  48.65 
 
 		 356 aa  314  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1096  N-6 DNA methylase  38.62 
 
 		 543 aa  313  3.9999999999999997e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0005  type I restriction-modification system, M subunit  35.42 
 
 		 528 aa  310  5.9999999999999995e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1539  type I restriction-modification system, M subunit  35.17 
 
 		 500 aa  308  2.0000000000000002e-82  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000154488  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4473  N-6 DNA methylase  34.45 
 
 		 567 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.844286 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3767  N-6 DNA methylase  34.99 
 
 		 564 aa  308  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0988  N-6 DNA methylase  37.34 
 
 		 527 aa  307  3e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1120  type I restriction-modification system specificity subunit  35.67 
 
 		 527 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7556  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  37.78 
 
 		 544 aa  304  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3080  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  36.43 
 
 		 549 aa  302  8.000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.801077 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3300  N-6 DNA methylase  36.02 
 
 		 537 aa  302  1e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000500405 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0032  N-6 DNA methylase  35.93 
 
 		 544 aa  300  5e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.885751  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4240  N-6 DNA methylase  35.14 
 
 		 567 aa  293  4e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.386659  hitchhiker  0.00142847 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0286  N4/N6-methyltransferase family protein  32.99 
 
 		 569 aa  281  2e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0483  N-6 DNA methylase  32.3 
 
 		 568 aa  278  2e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0283562  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0036  type I restriction enzyme  32.96 
 
 		 510 aa  278  2e-73  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.27058  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3380  N-6 DNA methylase  33.56 
 
 		 570 aa  276  9e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.368642  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1809  hypothetical protein  32.02 
 
 		 849 aa  229  1e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  34.76 
 
 		 574 aa  209  1e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3794  type I restriction-modification system, M subunit  30.54 
 
 		 574 aa  206  8e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  30.14 
 
 		 574 aa  204  4e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04440  type I restriction-modification system, M subunit  28.77 
 
 		 495 aa  204  4e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  34.23 
 
 		 585 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  30.75 
 
 		 505 aa  199  9e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  27.94 
 
 		 498 aa  194  3e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  32.57 
 
 		 587 aa  191  4e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  30.02 
 
 		 504 aa  191  4e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3178  N-6 DNA methylase  27.61 
 
 		 498 aa  189  7e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0125713  hitchhiker  0.0000000000157011 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  31.61 
 
 		 633 aa  189  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3981  N-6 DNA methylase  28.54 
 
 		 499 aa  189  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3610  N-6 DNA methylase  28.18 
 
 		 500 aa  187  5e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0942  Type I restriction-modification system M subunit  27.94 
 
 		 495 aa  186  9e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  27.19 
 
 		 496 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4014  N-6 DNA methylase  30.48 
 
 		 816 aa  184  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0563  type I restriction-modification system, M subunit  28.71 
 
 		 908 aa  183  7e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0170311  hitchhiker  0.0000000000000803096 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0990  type I restriction-modification system, M subunit  27.57 
 
 		 501 aa  182  1e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.555022  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4819  N-6 DNA methylase  29.27 
 
 		 499 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5009  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  29.05 
 
 		 860 aa  179  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235997 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4043  N-6 DNA methylase  28.92 
 
 		 824 aa  178  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1211  N-6 DNA methylase  28.9 
 
 		 522 aa  179  2e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  28.51 
 
 		 505 aa  177  5e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0614  type I restriction-modification system, M subunit  27.18 
 
 		 494 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0763672  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0508  type I restriction-modification system, M subunit  27.49 
 
 		 814 aa  175  1.9999999999999998e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1089  N-6 DNA methylase  28.6 
 
 		 527 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05613  type I restriction-modification system specificity subunit  29.84 
 
 		 873 aa  174  5e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1672  N-6 DNA methylase  27.99 
 
 		 516 aa  172  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.179457  hitchhiker  0.001187 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  28.09 
 
 		 508 aa  171  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  28.09 
 
 		 523 aa  171  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1896  N-6 DNA methylase  27.31 
 
 		 511 aa  172  2e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.836046  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1072  type I restriction-modification system, M subunit  27.89 
 
 		 815 aa  172  2e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1097  N-6 DNA methylase  31.47 
 
 		 513 aa  171  4e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0964  N-6 DNA methylase  28.48 
 
 		 520 aa  167  5e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.311438  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>