More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2231 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2231  sun protein  100 
 
 		 468 aa  952    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0150  sun protein  41.59 
 
 		 449 aa  332  8e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.958214  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  41.2 
 
 		 448 aa  329  7e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000593735  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  40.62 
 
 		 448 aa  327  3e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  37.05 
 
 		 443 aa  320  3e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  39.6 
 
 		 451 aa  318  1e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  38.14 
 
 		 452 aa  317  3e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  41.98 
 
 		 446 aa  316  7e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0571  sun protein  35.96 
 
 		 455 aa  315  8e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0809795  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  36.59 
 
 		 449 aa  311  2e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0241  Sun protein  38.72 
 
 		 451 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3528  sun protein  39.06 
 
 		 448 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  36 
 
 		 446 aa  305  1.0000000000000001e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0672  sun protein  37.89 
 
 		 451 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0363723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0652  sun protein  37.67 
 
 		 451 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3594  sun protein  38.84 
 
 		 448 aa  303  5.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  40.18 
 
 		 452 aa  301  2e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  38.89 
 
 		 452 aa  300  5e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  36.83 
 
 		 453 aa  293  3e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2311  sun protein  37.39 
 
 		 452 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.362668  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1954  sun protein  37.98 
 
 		 444 aa  286  8e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3851  sun protein  37.77 
 
 		 453 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0744  sun protein  33.48 
 
 		 443 aa  283  4.0000000000000003e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.323768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1532  sun protein  35.2 
 
 		 449 aa  283  6.000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3612  sun protein  36.74 
 
 		 464 aa  281  2e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09930  sun protein  35.86 
 
 		 440 aa  279  6e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1752  sun protein  33.04 
 
 		 444 aa  272  1e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.731166  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0900  sun protein  36.91 
 
 		 457 aa  270  2.9999999999999997e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1064  sun protein  34.96 
 
 		 447 aa  270  5e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3688  sun protein  33.7 
 
 		 444 aa  270  5e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.66831  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3964  sun protein  33.7 
 
 		 444 aa  264  3e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0859  sun protein  35.1 
 
 		 452 aa  263  3e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1279  sun protein  33.26 
 
 		 444 aa  262  1e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.19762 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2517  sun protein  33.48 
 
 		 444 aa  262  1e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000512112  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1826  sun protein  35.53 
 
 		 451 aa  261  2e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1768  sun protein  35.67 
 
 		 444 aa  261  2e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3913  sun protein  33.48 
 
 		 444 aa  259  9e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0159883  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3907  sun protein  33.33 
 
 		 444 aa  259  1e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3716  sun protein  33.26 
 
 		 444 aa  258  1e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0992207  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3606  sun protein  33.26 
 
 		 444 aa  258  1e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3624  sun protein  33.26 
 
 		 444 aa  258  1e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0232202  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4003  sun protein  33.26 
 
 		 444 aa  258  1e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3879  sun protein  33.26 
 
 		 444 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26957e-17 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0928  sun protein  35.46 
 
 		 445 aa  258  2e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1994  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  34.06 
 
 		 442 aa  258  2e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1712  sun protein  33.09 
 
 		 442 aa  255  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.212482  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0818  sun protein  36.11 
 
 		 447 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.320678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1337  sun protein  31.9 
 
 		 462 aa  253  4.0000000000000004e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0524507  normal  0.361587 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0728  sun protein  32.68 
 
 		 449 aa  249  5e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.738755 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2489  sun protein  31.58 
 
 		 453 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.968037  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3668  sun protein  35.46 
 
 		 452 aa  239  9e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1228  hypothetical protein  30.29 
 
 		 456 aa  239  1e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.13972  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2583  sun protein  37.61 
 
 		 501 aa  237  3e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0446199  normal  0.0296322 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0804  sun protein  35.68 
 
 		 445 aa  235  2.0000000000000002e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0103148 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0918  sun protein  34.22 
 
 		 453 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04881  Sun protein (Fmu protein)  30.56 
 
 		 437 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.929228  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1575  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  34.95 
 
 		 445 aa  229  6e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0191  sun protein  33.71 
 
 		 436 aa  226  8e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1119  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  35.56 
 
 		 429 aa  225  2e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0783  sun protein  30.83 
 
 		 435 aa  222  9.999999999999999e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04801  Sun protein (Fmu protein)  33.17 
 
 		 448 aa  222  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.273951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2321  sun protein  34.73 
 
 		 429 aa  219  1e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0104634  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1042  Fmu (Sun) domain protein  30.4 
 
 		 406 aa  218  2e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0448  NusB/RsmB/TIM44  36.08 
 
 		 439 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.455606  normal  0.168542 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1107  sun protein  32.55 
 
 		 471 aa  217  2.9999999999999998e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0591  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  35.89 
 
 		 442 aa  216  5.9999999999999996e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1322  sun protein  34.19 
 
 		 451 aa  216  8e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04501  Sun protein (Fmu protein)  29.18 
 
 		 438 aa  215  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0347  Fmu (Sun) domain protein  36.69 
 
 		 434 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1280  sun protein  31.02 
 
 		 431 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000185655  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1758  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  31.88 
 
 		 438 aa  214  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1406  sun protein  31.8 
 
 		 431 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3970  NusB/RsmB/TIM44 family protein  35.36 
 
 		 455 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.110123  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0425  sun protein  28.05 
 
 		 438 aa  214  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4081  NusB/RsmB/TIM44  35.84 
 
 		 455 aa  213  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.468028  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04811  Sun protein (Fmu protein)  28.93 
 
 		 438 aa  212  1e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1301  sun protein  29.23 
 
 		 435 aa  210  3e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1276  sun protein  29.23 
 
 		 435 aa  210  3e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20681  Sun protein (Fmu protein)  33.26 
 
 		 450 aa  209  8e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4229  sun protein  34.72 
 
 		 432 aa  209  8e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.494405 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04221  Sun protein (Fmu protein)  30.49 
 
 		 432 aa  209  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4114  NusB/RsmB/TIM44  35.62 
 
 		 455 aa  209  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155532  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0080  sun protein  32.29 
 
 		 436 aa  206  5e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1437  sun protein  30.22 
 
 		 430 aa  206  6e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3159  Fmu (Sun)/ nucleolar NOL1/Nop2p  38.87 
 
 		 420 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0041  sun protein  32.96 
 
 		 433 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0810  NOL1/NOP2/Sun family protein  34.22 
 
 		 419 aa  201  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2475  sun protein  34.14 
 
 		 434 aa  200  3.9999999999999996e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1171  sun protein  31.22 
 
 		 449 aa  200  5e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1513  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  29.93 
 
 		 448 aa  199  9e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2845  sun protein  34.66 
 
 		 431 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.677129  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0073  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  30.86 
 
 		 444 aa  196  1e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0577  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.21 
 
 		 419 aa  194  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.124221 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0041  sun protein  34.38 
 
 		 427 aa  194  3e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0033  sun protein  32.51 
 
 		 426 aa  194  3e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0617271 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3771  16S rRNA methyltransferase B  32.04 
 
 		 429 aa  193  5e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.075284  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3584  16S rRNA methyltransferase B  32.04 
 
 		 429 aa  193  5e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.287379  normal  0.154829 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0425  sun protein  31.8 
 
 		 429 aa  192  9e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0425  16S rRNA methyltransferase B  31.8 
 
 		 429 aa  192  9e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.53016  hitchhiker  0.000468253 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3482  16S rRNA methyltransferase B  31.8 
 
 		 429 aa  192  9e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066221  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>