More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2213 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2213  Tol-Pal system TolQ  100 
 
 		 240 aa  486  1e-137  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000350133  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.77 
 
 		 268 aa  225  5.0000000000000005e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00339966  normal  0.664237 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0136  protein TolQ  48.46 
 
 		 232 aa  217  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2978  TolQ protein  50 
 
 		 223 aa  210  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0206  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.54 
 
 		 224 aa  208  7e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366729  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.44 
 
 		 224 aa  205  7e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.22 
 
 		 223 aa  204  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.22 
 
 		 223 aa  203  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.589276  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0662  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.02 
 
 		 247 aa  202  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391375  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0697  protein TolQ  48.02 
 
 		 257 aa  202  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.553708  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0696  protein TolQ  48.02 
 
 		 257 aa  202  3e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0706  Tol-Pal system TolQ  49.55 
 
 		 245 aa  202  4e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.199813  normal  0.496524 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0028  tolQ protein  50.5 
 
 		 225 aa  201  9e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0957491  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0856  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.49 
 
 		 225 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.339673  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3473  protein TolQ  47.8 
 
 		 227 aa  193  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3579  protein TolQ  48.02 
 
 		 224 aa  187  9e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3510  protein TolQ  48.02 
 
 		 224 aa  187  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0310094  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2364  protein TolQ  44.25 
 
 		 231 aa  186  3e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.501441 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3629  tolQ protein  42.49 
 
 		 228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1219  biopolymer transport protein TolQ  45.61 
 
 		 231 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.712744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3996  protein TolQ  45.61 
 
 		 231 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1248  Tol-Pal system, TolQ  45.61 
 
 		 231 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4199  protein TolQ  45.61 
 
 		 231 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.40323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0245  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.09 
 
 		 235 aa  182  4.0000000000000006e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3975  tolQ protein  44.3 
 
 		 231 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0234616  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1412  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.3 
 
 		 231 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0108204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0595  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.81 
 
 		 235 aa  180  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4405  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.74 
 
 		 221 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0344768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1274  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.3 
 
 		 231 aa  179  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232758  normal  0.304845 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0471  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.34 
 
 		 230 aa  179  4.999999999999999e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564154  normal  0.664917 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1226  tolQ protein  41.81 
 
 		 225 aa  177  2e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.369592  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4539  TolQ protein  44.64 
 
 		 231 aa  176  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51750  TolQ protein  44.64 
 
 		 231 aa  176  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.438505  hitchhiker  0.0000223597 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0862  protein TolQ  44.14 
 
 		 231 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000829474  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2191  Tol-Pal system TolQ  40.17 
 
 		 226 aa  172  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000779627  normal  0.358656 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0282  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.64 
 
 		 230 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.235807  hitchhiker  0.000672493 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2541  protein TolQ  39.91 
 
 		 228 aa  170  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000245733  hitchhiker  0.00000309411 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1739  Tol-Pal system TolQ  39.91 
 
 		 228 aa  170  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000243293  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1782  protein TolQ  39.91 
 
 		 228 aa  170  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000921899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1524  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.17 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0123133  normal  0.884869 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1728  tolQ protein  38.53 
 
 		 228 aa  169  3e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1588  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.14 
 
 		 243 aa  169  3e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.16518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2214  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.4 
 
 		 232 aa  169  3e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.48 
 
 		 228 aa  169  5e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000915639  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2532  peptidase A8, signal peptidase II  40.43 
 
 		 231 aa  169  5e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00489789  normal  0.411252 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.48 
 
 		 228 aa  168  8e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00156809  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2534  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.48 
 
 		 228 aa  168  8e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101898  normal  0.114902 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2734  protein TolQ  38.36 
 
 		 229 aa  168  8e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.252045  hitchhiker  0.000106629 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.48 
 
 		 228 aa  168  8e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000858501  normal  0.237078 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1702  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.77 
 
 		 229 aa  168  9e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0354123  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2371  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.39 
 
 		 228 aa  167  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00211275  normal  0.155674 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.82 
 
 		 229 aa  167  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00757308  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0895  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.5 
 
 		 229 aa  166  2e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000627927  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2567  Tol-Pal system TolQ  37.5 
 
 		 229 aa  166  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576197  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1854  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.36 
 
 		 229 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0235502  normal  0.794171 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01607  hypothetical protein  37.83 
 
 		 232 aa  166  4e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0585  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.63 
 
 		 263 aa  165  5e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.127539  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0563  protein TolQ  38.1 
 
 		 230 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.533269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1391  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.4 
 
 		 229 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000787618  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2751  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  38.2 
 
 		 228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2209  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  40.69 
 
 		 231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714084 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1895  TolQ protein, inner membrane component  41.49 
 
 		 228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2164  protein TolQ  46.85 
 
 		 219 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.23408  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2232  TolQ protein  38.43 
 
 		 228 aa  162  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1907  ExbB/TolQ family protein  45.16 
 
 		 220 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0744  protein TolQ  49.32 
 
 		 225 aa  162  6e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00108567  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0611  ExbB/TolQ family protein  46.98 
 
 		 222 aa  161  9e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0725  protein TolQ  40.53 
 
 		 230 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.750364  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2342  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.47 
 
 		 224 aa  160  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.348836  normal  0.105576 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0785  protein TolQ  41.15 
 
 		 222 aa  160  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0555571  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0681  protein TolQ  40.09 
 
 		 230 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.458824  normal  0.677661 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36670  TolQ proton channel  42.72 
 
 		 231 aa  159  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0994349  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2717  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.47 
 
 		 228 aa  158  8e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.169266  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1276  colicin uptake protein TolQ  37.72 
 
 		 224 aa  158  9e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000244479  hitchhiker  0.000166082 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1432  tolQ protein  38.53 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000136252  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3253  tolQ protein  40.34 
 
 		 262 aa  156  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0142  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.09 
 
 		 225 aa  157  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0830  tolQ protein  40.17 
 
 		 225 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2078  tolQ protein  40.17 
 
 		 225 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2905  colicin uptake protein TolQ  37.72 
 
 		 228 aa  156  3e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.045905  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2664  tolQ protein  40.17 
 
 		 225 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1946  tolQ protein  40.17 
 
 		 225 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3238  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  40.17 
 
 		 225 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.923457  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3200  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  40.17 
 
 		 225 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.949255  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0732  TOLQ-like transport transmembrane protein  40.53 
 
 		 230 aa  155  4e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.682761 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0724  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.83 
 
 		 227 aa  155  4e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.49682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2871  colicin uptake protein TolQ  38.26 
 
 		 228 aa  155  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018196  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1394  colicin uptake protein TolQ  38.26 
 
 		 228 aa  155  4e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00123539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2119  Tol-Pal system TolQ  40.72 
 
 		 241 aa  155  5.0000000000000005e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.145493  normal  0.278172 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0683  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.84 
 
 		 231 aa  155  5.0000000000000005e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.303112  normal  0.112554 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1235  colicin uptake protein TolQ  36.84 
 
 		 227 aa  155  5.0000000000000005e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0719257  normal  0.246715 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1376  tolQ protein  39.74 
 
 		 225 aa  155  7e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0482994  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1246  colicin uptake protein TolQ  36.28 
 
 		 228 aa  155  7e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0152271  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1532  hypothetical protein  37.39 
 
 		 224 aa  155  8e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1451  hypothetical protein  37.39 
 
 		 224 aa  155  8e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3090  colicin uptake protein TolQ  36.28 
 
 		 228 aa  155  8e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0237739  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1153  colicin uptake protein TolQ  36.56 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2959  colicin uptake protein TolQ  38.16 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0410151  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1214  protein TolQ  39.83 
 
 		 238 aa  153  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1566  Tol-Pal system, TolQ  36.36 
 
 		 263 aa  153  2e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000967145 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>