More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2153 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  100 
 
 		 613 aa  1261    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  37.36 
 
 		 587 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  39.34 
 
 		 587 aa  388  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  37.87 
 
 		 588 aa  381  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  38 
 
 		 582 aa  367  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  35.32 
 
 		 599 aa  365  2e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  37.28 
 
 		 583 aa  363  6e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  34.83 
 
 		 600 aa  352  1e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 604 aa  348  2e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  34.32 
 
 		 598 aa  347  3e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  40.95 
 
 		 604 aa  347  3e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  34.32 
 
 		 598 aa  347  3e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  34.32 
 
 		 598 aa  347  5e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  34.32 
 
 		 598 aa  347  5e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  34.32 
 
 		 598 aa  347  5e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  34.32 
 
 		 571 aa  346  7e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  34.32 
 
 		 598 aa  345  2e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  42.3 
 
 		 660 aa  343  5e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  42.3 
 
 		 660 aa  343  5.999999999999999e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  42.26 
 
 		 660 aa  342  2e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  41.57 
 
 		 663 aa  341  2e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  34.14 
 
 		 598 aa  341  2e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  34.14 
 
 		 598 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  41.94 
 
 		 651 aa  340  4e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  35.87 
 
 		 593 aa  340  4e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  42.3 
 
 		 652 aa  340  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  34.77 
 
 		 600 aa  340  5.9999999999999996e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  42.52 
 
 		 664 aa  339  7e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  40.77 
 
 		 604 aa  339  8e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  41.2 
 
 		 614 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  33.7 
 
 		 598 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  41.2 
 
 		 655 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1699  DNA primase  35.83 
 
 		 645 aa  337  5e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3096  DNA primase  40.71 
 
 		 660 aa  337  5e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  41.84 
 
 		 660 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  43.59 
 
 		 619 aa  334  2e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  36.41 
 
 		 584 aa  334  3e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  42.19 
 
 		 605 aa  333  4e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  46.37 
 
 		 638 aa  332  1e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  40.16 
 
 		 613 aa  331  2e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  34.9 
 
 		 626 aa  332  2e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  41.65 
 
 		 663 aa  331  3e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  42.24 
 
 		 656 aa  328  1.0000000000000001e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1605  DNA primase  39.12 
 
 		 676 aa  329  1.0000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  35.21 
 
 		 588 aa  327  5e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0602  DNA primase  38.74 
 
 		 636 aa  325  1e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3785  DNA primase  39.44 
 
 		 646 aa  325  2e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3836  DNA primase  39.44 
 
 		 646 aa  325  2e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0564656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  40.97 
 
 		 595 aa  323  4e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  33.22 
 
 		 599 aa  323  5e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2995  DNA primase  41.76 
 
 		 575 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0193814  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  40.97 
 
 		 595 aa  321  3e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  32.95 
 
 		 601 aa  320  5e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.140428 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1042  DNA primase  39.73 
 
 		 666 aa  320  6e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118792  normal  0.884554 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1427  DNA primase  40.71 
 
 		 602 aa  318  2e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0410677  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1763  DNA primase  40.61 
 
 		 659 aa  318  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.586276  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1073  DNA primase  39.72 
 
 		 573 aa  318  2e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.096623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  37.16 
 
 		 601 aa  318  2e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1154  DNA primase  40.14 
 
 		 575 aa  316  8e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000263916  normal  0.0506591 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1114  DNA primase  33.39 
 
 		 606 aa  316  9e-85  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000152449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1417  DNA primase  42.66 
 
 		 652 aa  315  9.999999999999999e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1105  DNA primase  39.49 
 
 		 574 aa  312  1e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000782839  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0997  DNA primase  39.3 
 
 		 601 aa  312  1e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.941593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  36.96 
 
 		 598 aa  311  2e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  39.08 
 
 		 617 aa  311  2.9999999999999997e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0959  DNA primase  39.71 
 
 		 576 aa  310  4e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000094448  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1286  DNA primase  39.25 
 
 		 574 aa  310  5e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1189  DNA primase  39.25 
 
 		 574 aa  310  5.9999999999999995e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0497692  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  34.78 
 
 		 599 aa  310  5.9999999999999995e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1145  DNA primase  38.9 
 
 		 574 aa  310  6.999999999999999e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000553498  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0735  DNA primase  40.67 
 
 		 675 aa  309  8e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1222  DNA primase  38.9 
 
 		 574 aa  309  9e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0573251  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1589  DNA primase  38.69 
 
 		 633 aa  309  9e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.567407  normal  0.0206676 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3168  DNA primase  38.9 
 
 		 574 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00053583  normal  0.343709 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2203  DNA primase  40.13 
 
 		 625 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.198077  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2989  DNA primase  39.21 
 
 		 574 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00884135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0276  DNA primase  36.99 
 
 		 660 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2561  DNA primase  41.45 
 
 		 598 aa  308  2.0000000000000002e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00296311 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3522  DNA primase  38 
 
 		 596 aa  308  2.0000000000000002e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884792  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3790  DNA primase  39.18 
 
 		 640 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3086  DNA primase  39.21 
 
 		 574 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000597352  hitchhiker  0.000480435 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2993  DNA primase  40.47 
 
 		 571 aa  308  3e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5044  DNA primase  38.6 
 
 		 677 aa  307  5.0000000000000004e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.764772  normal  0.79995 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1128  DNA primase  34.22 
 
 		 598 aa  306  5.0000000000000004e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012752  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5107  DNA primase  35.67 
 
 		 634 aa  306  8.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2907  DNA primase  38.98 
 
 		 574 aa  306  9.000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000550507  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3137  DNA primase  41.05 
 
 		 653 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0256  DNA primase  34.57 
 
 		 652 aa  306  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230248  normal  0.131007 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2833  DNA primase  38.79 
 
 		 574 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0310817  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4299  DNA primase  39.91 
 
 		 582 aa  306  1.0000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00849  DNA primase  38.5 
 
 		 586 aa  305  2.0000000000000002e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1807  DNA primase  37.95 
 
 		 576 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000348842  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  32.84 
 
 		 595 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2490  putative DNA primase protein  43.05 
 
 		 606 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.951822  normal  0.8529 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2484  DNA primase  41.05 
 
 		 658 aa  304  3.0000000000000004e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.11513  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2323  DNA primase  41.29 
 
 		 576 aa  304  4.0000000000000003e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0128644  hitchhiker  0.00849609 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0912  hypothetical protein  36.59 
 
 		 640 aa  304  4.0000000000000003e-81  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.121689 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  38.1 
 
 		 601 aa  304  4.0000000000000003e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5973  DNA primase  36.27 
 
 		 703 aa  303  5.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0323  DNA primase  39.05 
 
 		 579 aa  303  6.000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.119133 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>