245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2137 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2137  hypothetical protein  100 
 
 
293 aa  600  1.0000000000000001e-171  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000999013  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2907  hypothetical protein  61.92 
 
 
293 aa  369  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2080  protein of unknown function DUF849  50.89 
 
 
453 aa  293  2e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.550211 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0981  hypothetical protein  48.23 
 
 
449 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0265293  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0209  hypothetical protein  41.61 
 
 
275 aa  209  6e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1884  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  38.18 
 
 
289 aa  204  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0818534 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1080  hypothetical protein  39.93 
 
 
281 aa  203  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.431343  normal  0.325295 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5036  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  40.36 
 
 
280 aa  199  6e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3885  hypothetical protein  41.88 
 
 
273 aa  196  3e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1078  hypothetical protein  38.91 
 
 
273 aa  196  6e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1903  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  39.19 
 
 
271 aa  190  2.9999999999999997e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0190  hypothetical protein  39.78 
 
 
272 aa  189  5e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.881715  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1068  hypothetical protein  36 
 
 
273 aa  182  5.0000000000000004e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.567235 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4165  hypothetical protein  39.27 
 
 
283 aa  176  3e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6352  protein of unknown function DUF849  38.18 
 
 
274 aa  177  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1372  protein of unknown function DUF849  38.04 
 
 
282 aa  176  4e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2345  hypothetical protein  38.18 
 
 
272 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117765  normal  0.494816 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2380  protein of unknown function DUF849  37.55 
 
 
272 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.625502  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1631  hypothetical protein  37.09 
 
 
274 aa  170  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0344  protein of unknown function DUF849  34.83 
 
 
290 aa  170  3e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4391  protein of unknown function DUF849  36.39 
 
 
321 aa  169  4e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2468  protein of unknown function DUF849  37.59 
 
 
272 aa  168  8e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0635  hypothetical protein  37.68 
 
 
281 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3475  protein of unknown function DUF849  37.18 
 
 
279 aa  168  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1487  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  37.55 
 
 
272 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2376  protein of unknown function DUF849  36.07 
 
 
280 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.515693  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2085  protein of unknown function DUF849  36.07 
 
 
281 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359333  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0074  protein of unknown function DUF849  36.77 
 
 
308 aa  163  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3412  hypothetical protein  34.17 
 
 
277 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.717243  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2423  hypothetical protein  38.32 
 
 
272 aa  160  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1332  hypothetical protein  35.46 
 
 
279 aa  157  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235755  normal  0.103944 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0921  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  35.62 
 
 
305 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0368988 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0556  hypothetical protein  35.29 
 
 
277 aa  157  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.103036  normal  0.316329 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3495  hypothetical protein  36.36 
 
 
281 aa  157  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0599737  normal  0.192843 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5231  hypothetical protein  36.9 
 
 
295 aa  156  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.225304  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2917  hypothetical protein  37.24 
 
 
295 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.041062  normal  0.0930195 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4653  hypothetical protein  35.36 
 
 
283 aa  154  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5318  hypothetical protein  35.38 
 
 
280 aa  153  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2346  protein of unknown function DUF849  37.23 
 
 
280 aa  152  8e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.457877  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1538  hypothetical protein  32.68 
 
 
310 aa  152  8.999999999999999e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.724625  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2297  hypothetical protein  32.03 
 
 
310 aa  151  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.843148  normal  0.307686 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0303  hypothetical protein  34.14 
 
 
294 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00075505 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0327  hypothetical protein  34.14 
 
 
294 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4905  hypothetical protein  34.48 
 
 
294 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0922631 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2623  protein of unknown function DUF849  34.15 
 
 
287 aa  149  6e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1340  protein of unknown function DUF849  35.93 
 
 
299 aa  149  6e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0383  hypothetical protein  33.33 
 
 
297 aa  149  7e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0323  hypothetical protein  33.79 
 
 
294 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.198912 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2990  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  35.74 
 
 
305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0496376  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4226  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  34.86 
 
 
303 aa  147  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4921  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  35.05 
 
 
296 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.197144  normal  0.584863 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1958  hypothetical protein  32.76 
 
 
309 aa  145  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0986  hypothetical protein  32.76 
 
 
309 aa  145  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2128  hypothetical protein  33.11 
 
 
309 aa  145  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1848  hypothetical protein  33.79 
 
 
309 aa  145  6e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0851  hypothetical protein  33.11 
 
 
309 aa  145  6e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6459  protein of unknown function DUF849  34.14 
 
 
299 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0491  hypothetical protein  32.76 
 
 
309 aa  145  9e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0690  hypothetical protein  32.76 
 
 
309 aa  145  9e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0359  hypothetical protein  30.03 
 
 
292 aa  144  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.639489 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3174  hypothetical protein  32.76 
 
 
293 aa  145  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4741  hypothetical protein  32.88 
 
 
304 aa  145  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3968  hypothetical protein  33.68 
 
 
312 aa  145  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0761  hypothetical protein  32.76 
 
 
309 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.470234  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3589  hypothetical protein  33.45 
 
 
309 aa  143  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.72078  normal  0.726481 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3316  hypothetical protein  34.02 
 
 
309 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0677839  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5051  hypothetical protein  34.02 
 
 
309 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.5247  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5233  hypothetical protein  34.02 
 
 
309 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.782218 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0612  hypothetical protein  34.02 
 
 
309 aa  142  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3285  hypothetical protein  32.99 
 
 
309 aa  142  6e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113084  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4509  protein of unknown function DUF849  32.99 
 
 
309 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0771  hypothetical protein  32.29 
 
 
297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2002  hypothetical protein  34.32 
 
 
326 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0827  hypothetical protein  32.65 
 
 
309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.519946 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11733  hypothetical protein  32.23 
 
 
272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3295  hypothetical protein  33.56 
 
 
305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71150  hypothetical protein  32.76 
 
 
294 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.185944  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2922  hypothetical protein  31.21 
 
 
301 aa  139  4.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.565171  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0314  hypothetical protein  32.49 
 
 
280 aa  139  6e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1594  protein of unknown function DUF849  31.94 
 
 
296 aa  139  7e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0377  hypothetical protein  31.77 
 
 
280 aa  139  7.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5229  protein of unknown function DUF849  34.52 
 
 
274 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850912  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1780  hypothetical protein  31.72 
 
 
291 aa  138  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0176081  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4979  hypothetical protein  33.68 
 
 
309 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483188  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2188  hypothetical protein  32.21 
 
 
305 aa  137  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.390095  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4459  hypothetical protein  33.68 
 
 
309 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0689248  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6173  hypothetical protein  32.42 
 
 
294 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0229  protein of unknown function DUF849  34.69 
 
 
293 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.747002  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16260  hypothetical protein  34.13 
 
 
295 aa  137  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5853  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  33.68 
 
 
294 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.493531  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1354  hypothetical protein  32.62 
 
 
278 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.291809  normal  0.536847 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3825  hypothetical protein  31.91 
 
 
303 aa  136  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3176  hypothetical protein  34.13 
 
 
311 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1554  protein of unknown function DUF849  32.62 
 
 
278 aa  135  8e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2173  hypothetical protein  31.88 
 
 
300 aa  134  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.414156  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0500  hypothetical protein  33.33 
 
 
294 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0658  protein of unknown function DUF849  32.13 
 
 
276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0673  hypothetical protein  35.86 
 
 
288 aa  133  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.144097 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4531  hypothetical protein  31.37 
 
 
312 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1937  hypothetical protein  32.64 
 
 
295 aa  132  9e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.642383  normal  0.0127736 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>