More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2135 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2135  diaminopimelate decarboxylase  100 
 
 		 418 aa  854    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000329469  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1355  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  65.47 
 
 		 421 aa  578  1e-164  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.146910000000001e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2859  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  64.51 
 
 		 421 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000208534  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4876  diaminopimelate decarboxylase  56.44 
 
 		 416 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000066198  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1641  diaminopimelate decarboxylase  55.33 
 
 		 420 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0628  diaminopimelate decarboxylase  54.52 
 
 		 420 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00760  diaminopimelate decarboxylase  50.36 
 
 		 445 aa  393  1e-108  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1225  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  48.01 
 
 		 413 aa  381  1e-104  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0302  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  46.57 
 
 		 419 aa  376  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3249  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  46.41 
 
 		 421 aa  378  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28180  diaminopimelate decarboxylase  48.04 
 
 		 432 aa  374  1e-102  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000200142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0299  diaminopimelate decarboxylase  46.42 
 
 		 417 aa  368  1e-100  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000126182  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0514  Diaminopimelate decarboxylase  45.65 
 
 		 434 aa  361  1e-98  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00534186 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1405  diaminopimelate decarboxylase  44.33 
 
 		 419 aa  351  2e-95  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000283018  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0523  diaminopimelate decarboxylase  36.79 
 
 		 402 aa  233  7.000000000000001e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2136  diaminopimelate decarboxylase  32.83 
 
 		 398 aa  208  1e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.509779  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2159  diaminopimelate decarboxylase  33.08 
 
 		 407 aa  201  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1409  diaminopimelate decarboxylase  30.56 
 
 		 406 aa  194  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1595  diaminopimelate decarboxylase  33.25 
 
 		 425 aa  193  4e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000335873  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0038  diaminopimelate decarboxylase  33.42 
 
 		 429 aa  191  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2967  diaminopimelate decarboxylase  31.75 
 
 		 409 aa  191  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1411  diaminopimelate decarboxylase  33.91 
 
 		 386 aa  188  1e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0507581  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08531  diaminopimelate decarboxylase  31.57 
 
 		 406 aa  186  6e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1275  diaminopimelate decarboxylase  33 
 
 		 386 aa  186  8e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000162613  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3289  diaminopimelate decarboxylase  30.89 
 
 		 410 aa  183  6e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.721852 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1916  diaminopimelate decarboxylase  32.67 
 
 		 430 aa  182  7e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2664  diaminopimelate decarboxylase  32.24 
 
 		 434 aa  181  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.287942  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0681  diaminopimelate decarboxylase  33.93 
 
 		 421 aa  180  4e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.238588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0227  diaminopimelate decarboxylase  32.25 
 
 		 424 aa  180  4.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.690316  normal  0.715181 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2534  diaminopimelate decarboxylase  30.64 
 
 		 416 aa  179  9e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2942  diaminopimelate decarboxylase  31.87 
 
 		 430 aa  179  1e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000269013  normal  0.385916 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0359  diaminopimelate decarboxylase  32.37 
 
 		 402 aa  176  5e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.604138  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0336  diaminopimelate decarboxylase  32.37 
 
 		 402 aa  176  9e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1651  diaminopimelate decarboxylase  32.37 
 
 		 402 aa  175  9.999999999999999e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000231454  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0834  diaminopimelate decarboxylase  33.58 
 
 		 418 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0075  diaminopimelate decarboxylase  33.42 
 
 		 416 aa  172  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1665  diaminopimelate decarboxylase  31.84 
 
 		 399 aa  171  2e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0214  diaminopimelate decarboxylase  32.35 
 
 		 401 aa  170  5e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1010  diaminopimelate decarboxylase  32.35 
 
 		 421 aa  169  7e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.905477 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2097  diaminopimelate decarboxylase  30.86 
 
 		 430 aa  169  1e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1422  diaminopimelate decarboxylase  30.94 
 
 		 441 aa  168  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000179827  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1978  diaminopimelate decarboxylase  31.31 
 
 		 415 aa  166  9e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00280212  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0634  diaminopimelate decarboxylase  29.6 
 
 		 433 aa  166  9e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1301  diaminopimelate decarboxylase  30.22 
 
 		 412 aa  165  1.0000000000000001e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0425  diaminopimelate decarboxylase  29.95 
 
 		 393 aa  164  3e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1109  diaminopimelate decarboxylase  28.25 
 
 		 418 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1553  diaminopimelate decarboxylase  30.2 
 
 		 417 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144272  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3415  diaminopimelate decarboxylase  32.59 
 
 		 444 aa  162  9e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.656066  normal  0.0355245 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0318  diaminopimelate decarboxylase  30.07 
 
 		 394 aa  162  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.833211 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3725  diaminopimelate decarboxylase  31.19 
 
 		 412 aa  161  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0209  diaminopimelate decarboxylase  31.99 
 
 		 412 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158356  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0353  diaminopimelate decarboxylase  32.76 
 
 		 422 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0554  diaminopimelate decarboxylase  31.89 
 
 		 419 aa  161  2e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0233  diaminopimelate decarboxylase  29.25 
 
 		 417 aa  160  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.601671  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1775  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  31.23 
 
 		 859 aa  160  4e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3257  diaminopimelate decarboxylase  31.58 
 
 		 423 aa  160  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.314031  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1774  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  31.38 
 
 		 859 aa  160  5e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1043  diaminopimelate decarboxylase  29.93 
 
 		 382 aa  159  6e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.504589  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0225  diaminopimelate decarboxylase  31.76 
 
 		 415 aa  159  7e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.895635  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2910  diaminopimelate decarboxylase  31.83 
 
 		 423 aa  159  7e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334908 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1588  diaminopimelate decarboxylase  31.27 
 
 		 407 aa  159  8e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1656  aspartate kinase  32.89 
 
 		 878 aa  159  8e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2979  diaminopimelate decarboxylase protein  31.33 
 
 		 451 aa  158  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.492096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0182  diaminopimelate decarboxylase  32.18 
 
 		 415 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4218  diaminopimelate decarboxylase  32.34 
 
 		 427 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15741  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1499  diaminopimelate decarboxylase  28.93 
 
 		 416 aa  158  2e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000178536  normal  0.848919 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5726  diaminopimelate decarboxylase  33.41 
 
 		 416 aa  157  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4193  diaminopimelate decarboxylase  32.09 
 
 		 427 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3279  diaminopimelate decarboxylase  34.56 
 
 		 419 aa  157  5.0000000000000005e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0670  diaminopimelate decarboxylase  31.03 
 
 		 453 aa  156  5.0000000000000005e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00590114 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2877  diaminopimelate decarboxylase  34.56 
 
 		 419 aa  157  5.0000000000000005e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.926631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3483  diaminopimelate decarboxylase  30.48 
 
 		 412 aa  156  6e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0522  diaminopimelate decarboxylase  31.33 
 
 		 420 aa  156  6e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000495897  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4883  diaminopimelate decarboxylase  30.48 
 
 		 412 aa  156  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0837  diaminopimelate decarboxylase  30.24 
 
 		 412 aa  156  7e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0041  diaminopimelate decarboxylase  32.26 
 
 		 414 aa  156  7e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07140  diaminopimelate decarboxylase  32.16 
 
 		 448 aa  156  7e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.993125  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0745  diaminopimelate decarboxylase  32.51 
 
 		 440 aa  156  8e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.300133  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4070  diaminopimelate decarboxylase  31.59 
 
 		 427 aa  155  9e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1204  diaminopimelate decarboxylase  31.91 
 
 		 440 aa  155  9e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.313013  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3740  diaminopimelate decarboxylase  31.58 
 
 		 419 aa  155  9e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000793006 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1588  diaminopimelate decarboxylase  31.1 
 
 		 410 aa  155  9e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.220702 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0207  diaminopimelate decarboxylase  31.72 
 
 		 435 aa  155  1e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.235177  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5403  diaminopimelate decarboxylase  30.48 
 
 		 412 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0353  diaminopimelate decarboxylase  30.5 
 
 		 416 aa  155  1e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00862567 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0382  diaminopimelate decarboxylase  31.78 
 
 		 439 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4246  diaminopimelate decarboxylase  30.55 
 
 		 412 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1362  diaminopimelate decarboxylase  30.96 
 
 		 401 aa  154  2e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.884156  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2242  diaminopimelate decarboxylase  30.52 
 
 		 439 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0241935  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3229  diaminopimelate decarboxylase  32.53 
 
 		 420 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000136805 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0406  diaminopimelate decarboxylase  32.71 
 
 		 445 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3663  diaminopimelate decarboxylase  30.14 
 
 		 410 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.555835  normal  0.514134 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4771  diaminopimelate decarboxylase  30.66 
 
 		 417 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1011  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  32.76 
 
 		 864 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.834007  normal  0.825142 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3588  diaminopimelate decarboxylase  31.03 
 
 		 417 aa  154  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.776676  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1775  diaminopimelate decarboxylase  30.92 
 
 		 447 aa  154  2.9999999999999998e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1348  diaminopimelate decarboxylase  29.25 
 
 		 416 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000478718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3345  diaminopimelate decarboxylase  32.29 
 
 		 420 aa  154  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0295344 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3244  diaminopimelate decarboxylase  32.29 
 
 		 420 aa  154  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000310406 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3163  diaminopimelate decarboxylase  32.29 
 
 		 420 aa  154  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>