More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2072 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 210 aa  432  1e-120  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  50.49 
 
 		 251 aa  227  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  50.97 
 
 		 208 aa  225  4e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  53.88 
 
 		 207 aa  225  4e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  50.98 
 
 		 205 aa  219  3e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  53.66 
 
 		 207 aa  216  2e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  49.03 
 
 		 209 aa  215  2.9999999999999998e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  53.17 
 
 		 207 aa  216  2.9999999999999998e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  51.27 
 
 		 213 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  48.54 
 
 		 209 aa  209  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  51.49 
 
 		 205 aa  209  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  48.06 
 
 		 209 aa  209  3e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  48.54 
 
 		 209 aa  207  7e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  46.12 
 
 		 210 aa  202  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  48.04 
 
 		 206 aa  194  7e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  46.6 
 
 		 213 aa  194  1e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  47.03 
 
 		 210 aa  192  3e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  45.63 
 
 		 209 aa  192  3e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  48.97 
 
 		 213 aa  190  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0890  glyoxylase II family protein  44.55 
 
 		 218 aa  190  1e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389063  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  48.97 
 
 		 213 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  46.12 
 
 		 218 aa  187  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  46.12 
 
 		 218 aa  185  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003129  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.94 
 
 		 216 aa  185  5e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000730462  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  46.6 
 
 		 217 aa  184  7e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1782  Metallo-beta-lactamase  43.33 
 
 		 217 aa  184  7e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02708  hypothetical protein  45.41 
 
 		 218 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0451  beta-lactamase domain protein  47.18 
 
 		 213 aa  181  7e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  45.24 
 
 		 215 aa  180  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  45.1 
 
 		 205 aa  180  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0841  Beta-lactamase-like  46.46 
 
 		 213 aa  179  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0225813 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3016  beta-lactamase domain protein  45.45 
 
 		 219 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1634  beta-lactamase domain protein  47.45 
 
 		 211 aa  180  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0717617  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2524  beta-lactamase domain-containing protein  44.02 
 
 		 215 aa  178  4e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0571  beta-lactamase domain protein  45.88 
 
 		 221 aa  177  7e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.695514  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0394  putative metallo-beta-lactamase family protein  46.04 
 
 		 215 aa  177  7e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2240  beta-lactamase domain-containing protein  46.67 
 
 		 213 aa  177  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2753  beta-lactamase domain protein  44.98 
 
 		 217 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0134  beta-lactamase-like  45.36 
 
 		 222 aa  175  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3631  beta-lactamase domain protein  46.12 
 
 		 218 aa  174  9e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0092  putative metallo-beta-lactamase family protein  43.41 
 
 		 215 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.76232 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  44.17 
 
 		 211 aa  174  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  45.27 
 
 		 201 aa  172  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2184  beta-lactamase domain-containing protein  41.75 
 
 		 215 aa  172  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0861591  normal  0.0986326 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0167  beta-lactamase-like  43.3 
 
 		 212 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0715  Beta-lactamase-like  45.36 
 
 		 222 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1782  beta-lactamase domain protein  44.85 
 
 		 215 aa  172  5e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00356762  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  43.3 
 
 		 215 aa  171  9e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  43.3 
 
 		 215 aa  171  9e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  43.3 
 
 		 215 aa  171  9e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  43.3 
 
 		 215 aa  170  1e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2652  beta-lactamase domain-containing protein  43.88 
 
 		 215 aa  170  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0560187  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3159  hydrolase  42.58 
 
 		 215 aa  170  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  45.1 
 
 		 212 aa  171  1e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2561  metallo-beta-lactamase family protein  43.88 
 
 		 215 aa  170  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000219407  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1975  metallo-beta-lactamase superfamily protein  43.37 
 
 		 215 aa  169  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0642346  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1662  beta-lactamase domain protein  44.9 
 
 		 212 aa  169  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  43.3 
 
 		 215 aa  170  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1522  Beta-lactamase-like  42.57 
 
 		 214 aa  170  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  43.69 
 
 		 209 aa  170  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7673  metallo-hydrolase/oxidoreductase domain-containing protein  44.85 
 
 		 222 aa  169  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0374  beta-lactamase-like  42.08 
 
 		 222 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.834872 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  42.78 
 
 		 215 aa  169  4e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  42.78 
 
 		 215 aa  169  4e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  42.78 
 
 		 215 aa  169  4e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  42.78 
 
 		 215 aa  168  5e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  42.27 
 
 		 215 aa  168  6e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  42.93 
 
 		 206 aa  167  9e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0317  beta-lactamase domain-containing protein  42.86 
 
 		 214 aa  167  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0233  beta-lactamase-like  43.81 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  42.93 
 
 		 206 aa  167  1e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0228  beta-lactamase domain-containing protein  43.3 
 
 		 212 aa  167  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0406  metallo-beta-lactamase superfamily protein  43.65 
 
 		 209 aa  166  2e-40  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.735657  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1728  beta-lactamase domain-containing protein  43.37 
 
 		 215 aa  166  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1713  metallo-beta-lactamase family protein  41.55 
 
 		 212 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1493  beta-lactamase domain-containing protein  41.58 
 
 		 214 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1588  beta-lactamase domain-containing protein  43.65 
 
 		 237 aa  165  5e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2269  beta-lactamase domain-containing protein  44.85 
 
 		 214 aa  165  5e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.289735 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2138  beta-lactamase-like  48.22 
 
 		 215 aa  165  5e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0796003  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1500  beta-lactamase domain-containing protein  41.58 
 
 		 214 aa  165  5e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1435  beta-lactamase domain-containing protein  41.58 
 
 		 214 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4053  beta-lactamase domain-containing protein  42.29 
 
 		 212 aa  163  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000967513 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0068  metallo-beta-lactamase superfamily protein  43.84 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0554126  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.24 
 
 		 215 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.24 
 
 		 215 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0334  beta-lactamase domain-containing protein  40.1 
 
 		 212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2054  beta-lactamase domain protein  42.78 
 
 		 215 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.128768  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2508  beta-lactamase domain protein  41.84 
 
 		 214 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523411 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.24 
 
 		 215 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.24 
 
 		 215 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.24 
 
 		 215 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1635  beta-lactamase domain-containing protein  42.57 
 
 		 214 aa  162  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.702342  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  43.2 
 
 		 216 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0630  hypothetical protein  40.28 
 
 		 214 aa  162  5.0000000000000005e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2827  beta-lactamase domain-containing protein  42.08 
 
 		 214 aa  161  6e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0208272 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2142  metallo-beta-lactamase family protein  42.78 
 
 		 214 aa  161  6e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.84321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2954  beta-lactamase domain-containing protein  41.58 
 
 		 214 aa  161  7e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2576  beta-lactamase domain-containing protein  41.33 
 
 		 214 aa  161  8.000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.835238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2799  beta-lactamase domain protein  41.33 
 
 		 214 aa  161  8.000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130329  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3054  metallo-beta-lactamase family protein  40.1 
 
 		 214 aa  161  9e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>