18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2021 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2021  hypothetical protein  100 
 
 
232 aa  467  1.0000000000000001e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000158905  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0757  hypothetical protein  35.91 
 
 
205 aa  109  3e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.321867  normal  0.794251 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1191  hypothetical protein  33.03 
 
 
215 aa  102  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000156419  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1472  hypothetical protein  33.79 
 
 
266 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3137  hypothetical protein  36.76 
 
 
202 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1922  hypothetical protein  32.52 
 
 
220 aa  82  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0722012 
 
 
-
 
NC_004310  BR1366  hypothetical protein  30.19 
 
 
208 aa  68.9  0.00000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2094  hypothetical protein  28.84 
 
 
186 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0202879  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1322  hypothetical protein  28.04 
 
 
210 aa  66.2  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0895  hypothetical protein  30.48 
 
 
289 aa  66.2  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00169761 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3110  hypothetical protein  32.63 
 
 
112 aa  56.2  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000231374  normal  0.507258 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3948  putative CbiL protein  32.16 
 
 
197 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3208  putative CbiL protein  31.63 
 
 
197 aa  53.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.487085  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1132  hypothetical protein  32.39 
 
 
148 aa  52  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.553572 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1347  hypothetical protein  28.12 
 
 
150 aa  48.1  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0331737  hitchhiker  0.0000160464 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3499  hypothetical protein  24.49 
 
 
175 aa  46.2  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.128517  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1640  hypothetical protein  29.17 
 
 
154 aa  43.1  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1950  hypothetical protein  28.9 
 
 
212 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>