30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1965 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1965  cephalosporin hydroxylase  100 
 
 		 260 aa  542  1e-153  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3055  cephalosporin hydroxylase  62.02 
 
 		 259 aa  344  7e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.52398  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27730  cephalosporin hydroxylase  67.73 
 
 		 229 aa  333  2e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0597  cephalosporin hydroxylase  65.4 
 
 		 256 aa  325  6e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.451787  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4414  cephalosporin hydroxylase  60.89 
 
 		 259 aa  308  4e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.244366 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0632  cephalosporin protein  53.73 
 
 		 270 aa  300  1e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3713  cephalosporin hydroxylase  53.46 
 
 		 244 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1516  cephalosporin hydroxylase  58.08 
 
 		 242 aa  278  5e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.894097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0054  hypothetical protein  52.97 
 
 		 255 aa  258  5.0000000000000005e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000070397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4184  Cephalosporin hydroxylase  46.78 
 
 		 250 aa  208  7e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4503  Cephalosporin hydroxylase  48.17 
 
 		 252 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0207174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4212  Cephalosporin hydroxylase  47.71 
 
 		 252 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6315  cephalosporin hydroxylase  42.62 
 
 		 229 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1764  cephalosporin hydroxylase  42.62 
 
 		 229 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5062  cephalosporin hydroxylase  41.77 
 
 		 229 aa  199  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1777  cephalosporin hydroxylase  42.13 
 
 		 221 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.836048 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1699  cephalosporin hydroxylase  41.1 
 
 		 221 aa  193  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0146092  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4505  Cephalosporin hydroxylase  45.05 
 
 		 250 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0280491  normal  0.539468 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3346  cephalosporin hydroxylase  40.1 
 
 		 254 aa  162  4.0000000000000004e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.190282  normal  0.507049 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3111  hypothetical protein  37.61 
 
 		 210 aa  122  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0541974  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3085  hypothetical protein  37.61 
 
 		 210 aa  122  6e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.342117  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2870  hypothetical protein  37.61 
 
 		 210 aa  122  6e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.597368  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2800  cephalosporin hydroxylase  37.61 
 
 		 210 aa  119  7e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2840  cephalosporin hydroxylase  38.25 
 
 		 191 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000812769  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3078  hypothetical protein  38.31 
 
 		 170 aa  104  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.875114  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2157  hypothetical protein  37.31 
 
 		 170 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2862  cephalosporin hydroxylase  37.31 
 
 		 170 aa  102  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.341322  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3091  hypothetical protein  36.73 
 
 		 166 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3110  hypothetical protein  36.73 
 
 		 166 aa  98.6  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.215479  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12973  methyltransferase  27.27 
 
 		 245 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>