More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1956 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1956  hypothetical protein  100 
 
 		 286 aa  586  1e-166  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000369208  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1303  hypothetical protein  57.71 
 
 		 291 aa  309  4e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00503997  normal  0.276922 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3613  ParA family protein  55.24 
 
 		 292 aa  297  1e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0375479 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1408  ParA family protein  51.1 
 
 		 295 aa  288  5.0000000000000004e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.738873  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1191  Mrp protein  53.49 
 
 		 304 aa  278  9e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00197237  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1920  ATPase-like, ParA/MinD  47.52 
 
 		 296 aa  277  1e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1929  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.19 
 
 		 295 aa  277  1e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.72469  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0745  MRP family ATPase  52.16 
 
 		 285 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1128  hypothetical protein  54.59 
 
 		 302 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1946  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.64 
 
 		 288 aa  271  6e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3202  hypothetical protein  49.01 
 
 		 415 aa  271  1e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.560297  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0440  ATPase-like, ParA/MinD  47.74 
 
 		 416 aa  268  5.9999999999999995e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1315  hypothetical protein  49.03 
 
 		 297 aa  263  2e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00797735  hitchhiker  0.00521275 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2075  hypothetical protein  50.2 
 
 		 298 aa  263  3e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.010662  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0410  Mrp protein  48.44 
 
 		 298 aa  260  2e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0473573 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1689  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.11 
 
 		 308 aa  258  7e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0337  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.39 
 
 		 300 aa  257  1e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  unclonable  0.0000000110722  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2141  chromosome partitioning ATPase protein  46.13 
 
 		 278 aa  258  1e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1122  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  44.88 
 
 		 471 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.998483  normal  0.257216 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2300  cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.1 
 
 		 303 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.8116  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0907  ATP-binding protein  47.62 
 
 		 293 aa  253  3e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.124437  normal  0.543626 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3164  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.76 
 
 		 317 aa  251  1e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0294641 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1306  hypothetical protein  46.53 
 
 		 401 aa  251  1e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0319756  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0522  ATPase-like, ParA/MinD  47.89 
 
 		 278 aa  248  8e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0621  Mrp protein  42.47 
 
 		 301 aa  248  1e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2027  Mrp protein  48.21 
 
 		 285 aa  245  6e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.251832 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0268  ATP-binding protein  43.68 
 
 		 284 aa  245  6e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.54861  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0533  Mrp protein  44.36 
 
 		 272 aa  244  9.999999999999999e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3361  hypothetical protein  51.5 
 
 		 265 aa  242  3.9999999999999997e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.124821  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0267  hypothetical protein  47.58 
 
 		 288 aa  242  5e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.950713  normal  0.311122 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1967  ATP-binding protein  49.6 
 
 		 297 aa  241  7.999999999999999e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.847936 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0928  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.66 
 
 		 293 aa  241  1e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.229297 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2165  ATP-binding protein  43.07 
 
 		 269 aa  238  9e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0731  hypothetical protein  41.67 
 
 		 290 aa  237  2e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1282  ATP-binding protein  46.4 
 
 		 297 aa  236  3e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.240384  normal  0.0376424 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0488  cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.91 
 
 		 287 aa  236  4e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0834  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.4 
 
 		 270 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.677394  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0872  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.55 
 
 		 289 aa  231  8.000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.439579  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03090  NBP35, putative  43.89 
 
 		 336 aa  231  1e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.820324  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1731  cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.55 
 
 		 289 aa  230  2e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.826727 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.99 
 
 		 289 aa  229  4e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.388921  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2615  chromosome partitioning ATPase protein  44.31 
 
 		 280 aa  228  7e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566826  normal  0.821672 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0180  cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.18 
 
 		 289 aa  228  9e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1590  chromosome partitioning ATPase  43.43 
 
 		 347 aa  226  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2173  chromosome partitioning ATPase  43.97 
 
 		 302 aa  226  4e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000394872 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02155  Cytosolic Fe-S cluster assembling factor nbp35 (Nucleotide-binding protein 35) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BBC5]  44.32 
 
 		 341 aa  225  5.0000000000000005e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.271817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.85 
 
 		 266 aa  226  5.0000000000000005e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.73193  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0634  chromosome partitioning ATPase protein  48.43 
 
 		 280 aa  225  6e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.556056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1215  chromosome partitioning ATPase protein  41.01 
 
 		 379 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.747251 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38325  nuclear ATPase  46.59 
 
 		 330 aa  220  1.9999999999999999e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.879743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1472  chromosome partitioning ATPase protein  40 
 
 		 394 aa  219  5e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.95165  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1438  ATPase-like, ParA/MinD  44.12 
 
 		 296 aa  218  7.999999999999999e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.702727  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0557  MRP/NBP35 family ATP-binding protein  44.62 
 
 		 281 aa  218  8.999999999999998e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.172221  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5025  Mrp protein  41.85 
 
 		 375 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.27935 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3465  MinD/MRP family ATPase  39.86 
 
 		 376 aa  214  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.626376 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1432  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.36 
 
 		 269 aa  214  9.999999999999999e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4565  MRP protein-like protein  42.75 
 
 		 378 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1066  nucleotide-binding protein-like protein  41.51 
 
 		 364 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0514785 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1138  hypothetical protein  44.72 
 
 		 368 aa  213  1.9999999999999998e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5082  MRP protein-like protein  41.77 
 
 		 373 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1824  hypothetical protein  41.28 
 
 		 389 aa  212  4.9999999999999996e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.824017  normal  0.196606 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3327  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  46.22 
 
 		 415 aa  212  4.9999999999999996e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0721864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2037  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.05 
 
 		 358 aa  211  1e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000910104  hitchhiker  0.00000144662 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2528  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.56 
 
 		 348 aa  211  1e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0638219  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1786  nucleotide-binding protein-like protein  44.21 
 
 		 361 aa  211  1e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.506851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3393  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  40.59 
 
 		 372 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2197  ATPase-like, ParA/MinD  45.42 
 
 		 368 aa  211  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427821  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0507  MRP-like protein  45.04 
 
 		 348 aa  211  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2287  chromosome partitioning ATPase protein  43.78 
 
 		 358 aa  211  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0968  protein of unknown function DUF59  45.78 
 
 		 371 aa  211  1e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2661  Mrp protein  43.78 
 
 		 358 aa  211  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0908  MRP protein-like  40.75 
 
 		 291 aa  211  2e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.382595  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0691  hypothetical protein  40.15 
 
 		 357 aa  209  5e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0228073  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2145  MRP protein-like protein  42.45 
 
 		 382 aa  208  9e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1878  NifH/FrxC domain-containing protein  42.29 
 
 		 306 aa  208  1e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2187  putative multidrug-resistance related protein  41.22 
 
 		 370 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0964076  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_36005  predicted protein  43.5 
 
 		 296 aa  207  2e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.275469 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3344  ATPase-like, ParA/MinD  43.35 
 
 		 358 aa  206  3e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.312419  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1256  cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.18 
 
 		 247 aa  206  3e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0942514  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3248  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.83 
 
 		 282 aa  206  5e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0557135 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1652  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  43.2 
 
 		 305 aa  205  6e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.491623  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2048  MRP ATP/GTP-binding protein  39.85 
 
 		 372 aa  205  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.224977 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2325  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.45 
 
 		 367 aa  205  7e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1200  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.49 
 
 		 247 aa  204  1e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000474173  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2066  MRP ATP/GTP-binding protein  42.62 
 
 		 373 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0228594  normal  0.0543779 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1718  hypothetical protein  40.32 
 
 		 310 aa  204  1e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5982  MRP protein-like protein  42.74 
 
 		 374 aa  204  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.141343  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1702  MRP ATP/GTP-binding protein  40.39 
 
 		 287 aa  204  2e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1575  ATPase-like, ParA/MinD  42.59 
 
 		 358 aa  204  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0064  hypothetical protein  39.11 
 
 		 389 aa  203  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2357  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.86 
 
 		 298 aa  202  6e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2587  protein of unknown function DUF59  45.78 
 
 		 351 aa  202  7e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.600696  normal  0.426631 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0057  mrp-related protein  42.26 
 
 		 394 aa  201  8e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0740397  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0057  mrp-related protein  42.26 
 
 		 387 aa  201  9.999999999999999e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1105  MRP protein-like  40.86 
 
 		 361 aa  201  9.999999999999999e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0052  mrP protein  43.09 
 
 		 361 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4074  hypothetical protein  40.08 
 
 		 336 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1565  protein of unknown function DUF59  42.11 
 
 		 354 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.226796  normal  0.517405 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7302  MRP protein-like protein  40.16 
 
 		 374 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.145804  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01241  hypothetical protein  43.28 
 
 		 285 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>