More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1907 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 279 aa  569  1e-161  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  38.15 
 
 		 242 aa  167  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  36.4 
 
 		 238 aa  151  8.999999999999999e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  35.69 
 
 		 238 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  41.78 
 
 		 247 aa  145  6e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  41.86 
 
 		 259 aa  142  6e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  40.3 
 
 		 243 aa  140  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  39.53 
 
 		 239 aa  139  3.9999999999999997e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  37.04 
 
 		 245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  36.19 
 
 		 255 aa  130  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0737  phosphoribosyltransferase  35.82 
 
 		 246 aa  129  6e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  37.68 
 
 		 253 aa  129  6e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  37.55 
 
 		 255 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2183  competence protein F  35.91 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0808644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3855  phosphoribosyltransferase  37.55 
 
 		 239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00709027 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  34.31 
 
 		 271 aa  124  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  33.57 
 
 		 255 aa  124  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0559  phosphoribosyltransferase  40.55 
 
 		 248 aa  122  7e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3771  phosphoribosyltransferase  35.57 
 
 		 239 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3527  competence protein F, putative  32.61 
 
 		 244 aa  120  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.343371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  31.02 
 
 		 233 aa  120  3e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  36.07 
 
 		 233 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1495  phosphoribosyltransferase  38.36 
 
 		 217 aa  119  6e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  35.16 
 
 		 233 aa  119  7.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  37.67 
 
 		 270 aa  118  9e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0569  competence protein F, putative  36.12 
 
 		 249 aa  118  9.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  37.5 
 
 		 237 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1736  phosphoribosyltransferase  35.29 
 
 		 258 aa  117  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  40.84 
 
 		 213 aa  116  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  35.32 
 
 		 251 aa  115  6e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0351  competence protein F  33.92 
 
 		 255 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  35.51 
 
 		 229 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  31.8 
 
 		 220 aa  112  7.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1028  competence protein F, putative  31.88 
 
 		 262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  32.2 
 
 		 233 aa  110  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05970  amidophosphoribosyltransferase  39.73 
 
 		 238 aa  109  6e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.096525  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1140  phosphoribosyltransferase  37.1 
 
 		 264 aa  108  7.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0794906  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  26.37 
 
 		 245 aa  108  7.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2863  phosphoribosyltransferase  36.24 
 
 		 242 aa  108  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  35.81 
 
 		 239 aa  107  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3540  ComF family protein  35.78 
 
 		 242 aa  107  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  31.02 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  30.66 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3184  putative phosphoribosyl transferase  35.16 
 
 		 230 aa  107  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.392419 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  34.26 
 
 		 247 aa  107  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2264  phosphoribosyltransferase  37.26 
 
 		 255 aa  107  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.200709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1808  putative competence protein F  36.48 
 
 		 262 aa  106  5e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3970  competence protein F  31.94 
 
 		 236 aa  105  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4090  amidophosphoribosyltransferase-like protein  35.32 
 
 		 246 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2971  phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 268 aa  105  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.566762 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  37.61 
 
 		 215 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0090  phosphoribosyltransferase  30.66 
 
 		 220 aa  104  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0126  putative phosphoribosyltransferase  37.89 
 
 		 260 aa  103  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0837099  normal  0.0454325 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  32.75 
 
 		 247 aa  102  6e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000228235  hitchhiker  0.000000230998 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0225  phosphoribosyltransferase  36.9 
 
 		 222 aa  102  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000513263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  28.84 
 
 		 230 aa  102  6e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  38.25 
 
 		 227 aa  102  6e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2183  phosphoribosyltransferase  35.34 
 
 		 230 aa  102  8e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000715358  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0317  gluconate periplasmic binding protein  36.44 
 
 		 233 aa  100  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2082  phosphoribosyltransferase  38.29 
 
 		 214 aa  100  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0714276  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7594  putative competence protein F (COMF)  34.98 
 
 		 267 aa  100  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3826  gluconate periplasmic binding protein  36.24 
 
 		 227 aa  98.2  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  29.09 
 
 		 232 aa  98.6  1e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5516  phosphoribosyltransferase  30.42 
 
 		 239 aa  97.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0107  phosphoribosyltransferase  36.09 
 
 		 272 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0877  phosphoribosyltransferase  35.29 
 
 		 232 aa  97.8  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1678  ComF family protein  34.38 
 
 		 230 aa  97.1  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.591029  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3500  competence protein F  31.16 
 
 		 258 aa  96.7  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0248  amidophosphoribosyltransferase  28.51 
 
 		 224 aa  97.1  3e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0493  competence protein ComF, putative  36.02 
 
 		 244 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4814  phosphoribosyltransferase  34.53 
 
 		 279 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.727604  decreased coverage  0.0000849043 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0247  phosphoribosyltransferase  39.05 
 
 		 228 aa  95.9  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3856  phosphoribosyltransferase  37.01 
 
 		 232 aa  95.9  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0026  phosphoribosyltransferase  36.09 
 
 		 254 aa  95.9  6e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  25.19 
 
 		 230 aa  95.5  8e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4754  phosphoribosyltransferase  33.94 
 
 		 276 aa  95.5  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000245098  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4395  ComF family protein  33.48 
 
 		 238 aa  95.5  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136408  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1878  competence protein F, putative  36.05 
 
 		 262 aa  95.1  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  30.69 
 
 		 246 aa  95.1  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3495  amidophosphoribosyltransferase  27.21 
 
 		 236 aa  95.1  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.552167 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  31.09 
 
 		 223 aa  94  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  32.79 
 
 		 234 aa  93.6  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1242  hypothetical protein  31.3 
 
 		 271 aa  93.6  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1314  hypothetical protein  33.97 
 
 		 226 aa  93.6  3e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  32.79 
 
 		 234 aa  93.6  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0158  competence protein F-related protein  35.45 
 
 		 246 aa  92.8  5e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  35.26 
 
 		 246 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16480  amidophosphoribosyltransferase  28.25 
 
 		 243 aa  92.8  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.58809e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3925  gluconate periplasmic binding protein  33.78 
 
 		 233 aa  92.4  7e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2181  hypothetical protein  30.56 
 
 		 227 aa  92.4  7e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0939  phosphoribosyltransferase  37.16 
 
 		 215 aa  92.4  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.430972 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0152  amidophosphoribosyltransferase-like protein  24.8 
 
 		 238 aa  92  9e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0150126  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0423  ComF family protein  33.33 
 
 		 255 aa  92  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0236  phosphoribosyltransferase  38.32 
 
 		 228 aa  91.3  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.269652  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3458  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  29.36 
 
 		 250 aa  90.9  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000183907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0258  phosphoribosyltransferase  38.32 
 
 		 228 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0200  competence protein  30.43 
 
 		 269 aa  91.3  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2108  phosphoribosyltransferase  32.73 
 
 		 269 aa  91.3  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.227962  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1708  phosphoribosyltransferase  35.29 
 
 		 264 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0852956  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4118  gluconate periplasmic binding protein  31.56 
 
 		 233 aa  90.5  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>