More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1905 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  100 
 
 
179 aa  367  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
177 aa  153  1e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  42.6 
 
 
180 aa  147  7e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0414  NTP pyrophosphohydrolase  42.77 
 
 
171 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136585  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3624  NUDIX hydrolase  43.02 
 
 
173 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3558  NUDIX hydrolase  43.93 
 
 
173 aa  138  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  41.21 
 
 
172 aa  135  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  40.83 
 
 
186 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  37.36 
 
 
194 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0048  NUDIX hydrolase  42.26 
 
 
173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.642128 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  36.47 
 
 
180 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  38.6 
 
 
199 aa  128  4.0000000000000003e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 
178 aa  128  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  36.2 
 
 
176 aa  127  9.000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  39.41 
 
 
186 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  40.59 
 
 
281 aa  126  2.0000000000000002e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  35.76 
 
 
184 aa  124  8.000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  37.06 
 
 
185 aa  123  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3241  NUDIX hydrolase  39.77 
 
 
200 aa  122  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.021012  normal  0.962326 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2011  NUDIX hydrolase  38.98 
 
 
192 aa  122  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252009  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  34.76 
 
 
177 aa  122  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  35.93 
 
 
180 aa  122  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  37.95 
 
 
183 aa  121  5e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1652  NUDIX hydrolase  41.14 
 
 
186 aa  120  7e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.568517  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03121  NUDIX hydrolase  44.23 
 
 
189 aa  121  7e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
179 aa  120  8e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1912  NUDIX hydrolase  41.28 
 
 
201 aa  120  8e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255381  hitchhiker  0.000304952 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1439  NUDIX hydrolase  39.18 
 
 
204 aa  120  8e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3464  NUDIX hydrolase  38.41 
 
 
190 aa  120  9e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.36556  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  36.81 
 
 
178 aa  120  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03661  NUDIX hydrolase  40.57 
 
 
186 aa  120  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  36.16 
 
 
179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03091  NUDIX hydrolase  36.87 
 
 
187 aa  119  3e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0558584  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0288  NUDIX hydrolase  36.31 
 
 
187 aa  118  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.919876  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1757  NUDIX hydrolase  38.64 
 
 
189 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335075  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5434  NUDIX hydrolase  42.42 
 
 
213 aa  117  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000494994  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0176  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 
173 aa  118  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0982781  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05669  ADP-ribose pyrophosphatase  40 
 
 
171 aa  117  6e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1927  NUDIX hydrolase  41.03 
 
 
184 aa  117  9e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00211801  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0705  MutT/nudix family protein  40.76 
 
 
185 aa  116  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03101  NUDIX hydrolase  35.36 
 
 
187 aa  117  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  34.13 
 
 
177 aa  117  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0268  NUDIX hydrolase  40.25 
 
 
165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.880251  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2271  ADP-ribose pyrophosphatase  41.42 
 
 
183 aa  116  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1124  NUDIX hydrolase  37.64 
 
 
195 aa  116  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244763 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1673  NUDIX hydrolase  35.58 
 
 
175 aa  115  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542994 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1024  NUDIX hydrolase  38.18 
 
 
180 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00585419  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0238  NUDIX hydrolase  43.83 
 
 
186 aa  114  5e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000047  ADP-ribose pyrophosphatase  40.13 
 
 
214 aa  115  5e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.911513  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3495  NUDIX hydrolase  36.69 
 
 
204 aa  114  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25410  NTP pyrophosphohydrolase  38.41 
 
 
210 aa  113  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  35.37 
 
 
176 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0285  NUDIX hydrolase  40 
 
 
164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0963  NUDIX hydrolase  40.72 
 
 
180 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000383094  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  34.76 
 
 
176 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0076  NUDIX hydrolase  37.65 
 
 
184 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.655363 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2211  NUDIX hydrolase  40.25 
 
 
164 aa  112  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0213  NUDIX hydrolase  40.12 
 
 
178 aa  112  3e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0378357  normal  0.391369 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1994  NUDIX hydrolase  33.15 
 
 
196 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0156913  normal  0.284552 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3199  ADP-ribose phosphorylase  37.28 
 
 
194 aa  111  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000680603  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1043  NUDIX hydrolase  36.69 
 
 
196 aa  111  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603681  normal  0.391418 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1194  NUDIX family hydrolase  32.95 
 
 
187 aa  110  7.000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25181  NUDIX hydrolase  40.12 
 
 
189 aa  111  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0948  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 
182 aa  110  8.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0212  NUDIX hydrolase  43.21 
 
 
186 aa  110  8.000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.465676  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  35.98 
 
 
179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  30.23 
 
 
182 aa  109  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1358  NUDIX hydrolase  35.39 
 
 
194 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573417  hitchhiker  0.00856079 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03191  NUDIX hydrolase  35.36 
 
 
186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.798424  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3354  mutT/nudix family protein  40.12 
 
 
173 aa  108  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2376  NUDIX hydrolase  34.52 
 
 
215 aa  109  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2151  NUDIX hydrolase  36.09 
 
 
196 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.401781 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1921  NUDIX hydrolase  39.16 
 
 
201 aa  109  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.137486 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  35.98 
 
 
179 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0976  NUDIX hydrolase  35.96 
 
 
204 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.82021  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2272  NUDIX hydrolase  36.09 
 
 
196 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4700  NUDIX hydrolase  36.78 
 
 
184 aa  108  4.0000000000000004e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0724  NUDIX hydrolase  32.32 
 
 
169 aa  107  1e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.983328  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0835  NUDIX hydrolase  35.5 
 
 
199 aa  107  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.773833  normal  0.937872 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2595  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 
176 aa  107  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000152881  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2943  NUDIX hydrolase  34.97 
 
 
209 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1037  NUDIX hydrolase  36.42 
 
 
199 aa  107  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2987  NUDIX hydrolase  34.97 
 
 
209 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  31.36 
 
 
176 aa  107  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  35.76 
 
 
179 aa  106  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  35.76 
 
 
179 aa  106  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  35.76 
 
 
179 aa  106  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  35.76 
 
 
179 aa  106  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  35.76 
 
 
179 aa  106  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1076  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.5 
 
 
196 aa  106  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  35.76 
 
 
179 aa  106  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1466  NUDIX hydrolase  36.26 
 
 
183 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  35.37 
 
 
179 aa  105  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1440  NUDIX hydrolase  36.26 
 
 
183 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2258  NUDIX hydrolase  34.91 
 
 
196 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1418  ADP-ribose pyrophosphatase  35.71 
 
 
207 aa  105  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.656759  normal  0.0166929 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5562  NUDIX hydrolase  35.5 
 
 
196 aa  105  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1048  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
184 aa  105  4e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1622  NUDIX hydrolase  34.91 
 
 
196 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443471  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2234  NUDIX hydrolase  34.91 
 
 
196 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>