23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1902 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1902  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  281  2.0000000000000002e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00660694  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0407  hypothetical protein  52.24 
 
 		 165 aa  143  9e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.337339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0086  hypothetical protein  50 
 
 		 137 aa  128  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0088  hypothetical protein  50 
 
 		 137 aa  128  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.713807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0062  hypothetical protein  32.5 
 
 		 139 aa  72  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.506925  normal  0.544054 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2717  hypothetical protein  32.71 
 
 		 140 aa  70.1  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1709  PilT domain-containing protein  30.66 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.567805  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0262  PilT protein domain protein  31.3 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.423377  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4992  hypothetical protein  31.94 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2889  hypothetical protein  25.81 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2207  hypothetical protein  30.43 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0485116  normal  0.147084 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1187  PilT domain-containing protein  25 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0894  hypothetical protein  29.29 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0230  PilT domain-containing protein  28.78 
 
 		 145 aa  47.8  0.00006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.874187 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1316  PilT domain-containing protein  27.74 
 
 		 142 aa  47.4  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.187557  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1327  hypothetical protein  46.3 
 
 		 146 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.668385 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3020  hypothetical protein  37.5 
 
 		 149 aa  45.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3076  hypothetical protein  26.43 
 
 		 142 aa  45.1  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.130003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0424  PilT domain-containing protein  27.27 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.437549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3018  hypothetical protein  27.94 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.318191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13202  hypothetical protein  27.21 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00935579  normal  0.278062 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1783  PilT domain-containing protein  29.55 
 
 		 144 aa  41.6  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0206  hypothetical protein  26.24 
 
 		 154 aa  40.8  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00358255  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>