More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1886 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2195  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  63.83 
 
 
491 aa  638    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1886  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  100 
 
 
485 aa  977    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2349  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  63.87 
 
 
487 aa  646    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.163967  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1615  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  63.45 
 
 
487 aa  643    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1524  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  62.82 
 
 
487 aa  637    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1520  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  63.66 
 
 
487 aa  645    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0307442  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2122  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  67.71 
 
 
491 aa  672    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1217  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  62.5 
 
 
491 aa  632  1e-180  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2293  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  62.81 
 
 
491 aa  634  1e-180  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.711267  normal  0.709548 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0988  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  63.31 
 
 
485 aa  629  1e-179  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00325513  hitchhiker  0.000530591 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0764  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  62.99 
 
 
489 aa  631  1e-179  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3124  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  62.79 
 
 
489 aa  628  1e-179  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2011  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  63.96 
 
 
489 aa  629  1e-179  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1471  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  63.18 
 
 
485 aa  626  1e-178  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0143553  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1949  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  63.81 
 
 
485 aa  627  1e-178  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2497  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  64.85 
 
 
485 aa  626  1e-178  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0704163  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0781  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.95 
 
 
489 aa  624  1e-178  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4214  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.21 
 
 
488 aa  619  1e-176  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3126  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  62.76 
 
 
486 aa  616  1e-175  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.151477 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0749  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  62.16 
 
 
493 aa  614  9.999999999999999e-175  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0613  IMP dehydrogenase  60.37 
 
 
486 aa  610  1e-173  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000830235  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1141  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.54 
 
 
486 aa  610  1e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.144187 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0697  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.92 
 
 
490 aa  608  1e-173  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0725248  normal  0.819187 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1200  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.17 
 
 
486 aa  607  9.999999999999999e-173  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.608786  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1900  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  63.47 
 
 
488 aa  608  9.999999999999999e-173  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3391  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.94 
 
 
493 aa  604  9.999999999999999e-173  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207114  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1805  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.3 
 
 
485 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0147128  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1260  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.96 
 
 
499 aa  602  1.0000000000000001e-171  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.334206 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1108  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.71 
 
 
485 aa  599  1e-170  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.927877  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0207  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.88 
 
 
507 aa  599  1e-170  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1200  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.04 
 
 
492 aa  596  1e-169  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1639  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.58 
 
 
488 aa  596  1e-169  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0762082  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0500  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.41 
 
 
490 aa  592  1e-168  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0514  response regulator receiver protein  59.46 
 
 
484 aa  592  1e-168  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135977  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0011  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.42 
 
 
494 aa  590  1e-167  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1137  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.96 
 
 
489 aa  585  1e-166  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3087  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.71 
 
 
485 aa  587  1e-166  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000190164  hitchhiker  0.00103544 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1320  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59 
 
 
504 aa  584  1e-166  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0931634  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.71 
 
 
508 aa  585  1e-166  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000189991  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20480  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.2 
 
 
486 aa  586  1e-166  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000012591  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.58 
 
 
488 aa  587  1e-166  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0805  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.62 
 
 
488 aa  584  1.0000000000000001e-165  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1314  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.43 
 
 
486 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.25 
 
 
488 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212236  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1193  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.04 
 
 
490 aa  582  1.0000000000000001e-165  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0291  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.71 
 
 
487 aa  580  1e-164  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1436  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.88 
 
 
482 aa  579  1e-164  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1482  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.88 
 
 
482 aa  579  1e-164  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2146  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  57.44 
 
 
498 aa  578  1e-164  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0916  IMP dehydrogenase  58.63 
 
 
484 aa  580  1e-164  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.366746  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08496  putative inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.95 
 
 
490 aa  581  1e-164  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1856  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  57.14 
 
 
487 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0486  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.32 
 
 
482 aa  576  1.0000000000000001e-163  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0029  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.65 
 
 
485 aa  575  1.0000000000000001e-163  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3287  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.92 
 
 
484 aa  577  1.0000000000000001e-163  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000039579  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1594  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.02 
 
 
489 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.221976 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1070  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.21 
 
 
485 aa  576  1.0000000000000001e-163  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.462822  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1906  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.44 
 
 
484 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1429  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.73 
 
 
487 aa  574  1.0000000000000001e-162  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0657932  normal  0.0240553 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2623  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.68 
 
 
487 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2431  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.64 
 
 
486 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.171445 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0999  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.51 
 
 
491 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000499041  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3486  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.39 
 
 
489 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3370  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.8 
 
 
489 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2011  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.43 
 
 
486 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.438138  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1049  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  56.85 
 
 
496 aa  570  1e-161  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0106058 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1295  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.64 
 
 
486 aa  569  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1524  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.64 
 
 
486 aa  569  1e-161  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.048391  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2549  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.64 
 
 
486 aa  569  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.425317  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0529  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.73 
 
 
487 aa  570  1e-161  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3287  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.64 
 
 
486 aa  569  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00821787  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5301  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.22 
 
 
486 aa  568  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.446018  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0012  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.63 
 
 
487 aa  568  1e-161  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0594668  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1706  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.64 
 
 
486 aa  570  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2546  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.61 
 
 
498 aa  569  1e-161  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.509974  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1461  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  57.14 
 
 
487 aa  570  1e-161  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2405  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.64 
 
 
486 aa  569  1e-161  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.323419  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6086  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.64 
 
 
486 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1893  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.43 
 
 
486 aa  570  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0489208  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0008  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.63 
 
 
487 aa  569  1e-161  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2217  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.32 
 
 
490 aa  569  1e-161  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166559  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2024  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.43 
 
 
486 aa  570  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.363824  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1991  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.64 
 
 
486 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.287012  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1923  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.02 
 
 
496 aa  568  1e-161  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0612  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.88 
 
 
483 aa  571  1e-161  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00142081  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0829  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.44 
 
 
504 aa  568  1e-161  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.363415  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2457  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.64 
 
 
486 aa  569  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195801  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2024  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.64 
 
 
486 aa  569  1e-161  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.637626  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1370  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.73 
 
 
487 aa  566  1e-160  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.810739  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0012  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.18 
 
 
487 aa  565  1e-160  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.84 
 
 
487 aa  567  1e-160  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5306  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.42 
 
 
487 aa  568  1e-160  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000300598  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0011  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.39 
 
 
487 aa  566  1e-160  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.84 
 
 
487 aa  567  1e-160  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0008  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.21 
 
 
487 aa  566  1e-160  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.303266  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2056  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.43 
 
 
486 aa  567  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3193  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  57.02 
 
 
498 aa  567  1e-160  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.291902  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2288  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  56.96 
 
 
489 aa  565  1e-160  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.453935  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3071  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.11 
 
 
497 aa  566  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.303181  normal  0.0977004 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2264  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.11 
 
 
498 aa  566  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.334086 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>