116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1836 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 446 aa  886    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  58.33 
 
 		 453 aa  520  1e-146  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1767  polysaccharide biosynthesis protein  29.55 
 
 		 447 aa  161  3e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0935149 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0777  polysaccharide biosynthesis protein  28.34 
 
 		 441 aa  140  3.9999999999999997e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  29.62 
 
 		 499 aa  139  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0890  polysaccharide biosynthesis protein  31.4 
 
 		 407 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  27.36 
 
 		 512 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2996  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 459 aa  117  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143417 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  25.85 
 
 		 430 aa  112  9e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2754  polysaccharide biosynthesis protein  24.66 
 
 		 460 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.316209  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1020  polysaccharide biosynthesis protein  25.87 
 
 		 490 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3553  polysaccharide biosynthesis protein  24.35 
 
 		 458 aa  107  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  33.33 
 
 		 461 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1685  polysaccharide biosynthesis protein  25.81 
 
 		 441 aa  100  6e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.929392  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  28.02 
 
 		 489 aa  100  8e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6968  PST family polysaccharide export protein  23.82 
 
 		 458 aa  99  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.756164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0040  polysaccharide biosynthesis protein  25.3 
 
 		 435 aa  96.3  9e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000125854  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3018  polysaccharide biosynthesis protein  25.56 
 
 		 468 aa  95.1  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1411  polysaccharide biosynthesis protein  24.13 
 
 		 456 aa  94.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  23.82 
 
 		 423 aa  93.2  9e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3832  polysaccharide biosynthesis protein  24.68 
 
 		 471 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  26.87 
 
 		 482 aa  91.7  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1391  polysaccharide biosynthesis protein  30.29 
 
 		 456 aa  89.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3541  polysaccharide biosynthesis protein  23.66 
 
 		 474 aa  88.2  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0172  polysaccharide efflux transporter, putative  30.61 
 
 		 495 aa  84.7  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.377433 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4001  polysaccharide biosynthesis protein  28.43 
 
 		 455 aa  84  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.443077 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2073  polysaccharide biosynthesis protein  26.79 
 
 		 492 aa  82.4  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2684  polysaccharide biosynthesis protein  22 
 
 		 539 aa  80.9  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  27.67 
 
 		 517 aa  79.7  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05198  hypothetical protein  24.61 
 
 		 435 aa  79.7  0.00000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  28.57 
 
 		 504 aa  79.7  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4685  polysaccharide biosynthesis protein  27.8 
 
 		 453 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2304  polysaccharide biosynthesis protein  27.38 
 
 		 494 aa  76.6  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298994  normal  0.0362143 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001317  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsJ Membrane protein export of O-antigen and teichoic acid  30.34 
 
 		 435 aa  76.3  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.872862  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  23.62 
 
 		 490 aa  76.3  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0259  polysaccharide biosynthesis protein  31.89 
 
 		 498 aa  75.9  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2188  polysaccharide biosynthesis protein  24.41 
 
 		 495 aa  75.1  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0561  polysaccharide biosynthesis protein  23.91 
 
 		 456 aa  73.9  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2520  polysaccharide biosynthesis protein  23.39 
 
 		 474 aa  70.9  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2006  polysaccharide biosynthesis protein  25.27 
 
 		 529 aa  70.5  0.00000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.300214  normal  0.433718 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  23.27 
 
 		 489 aa  68.6  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1933  polysaccharide biosynthesis protein  34.4 
 
 		 135 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.546859 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  22.76 
 
 		 475 aa  67.8  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1862  polysaccharide efflux transporter, putative  25.71 
 
 		 496 aa  67.8  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3720  polysaccharide biosynthesis protein  24.25 
 
 		 470 aa  67.8  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  26.56 
 
 		 490 aa  67  0.0000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3983  polysaccharide biosynthesis associated protein  26.74 
 
 		 467 aa  66.6  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2438  polysaccharide biosynthesis protein  24.19 
 
 		 495 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  24.16 
 
 		 488 aa  63.5  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0416  polysaccharide biosynthesis protein  28.22 
 
 		 506 aa  63.5  0.000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.484223  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  22.97 
 
 		 483 aa  61.2  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  22.3 
 
 		 429 aa  59.7  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1361  polysaccharide biosynthesis protein  26 
 
 		 413 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483225  unclonable  0.0000000256808 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0220  PST family polysaccharide transporter  29.21 
 
 		 472 aa  57  0.0000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  27.72 
 
 		 476 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  21.94 
 
 		 444 aa  55.1  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1961  polysaccharide biosynthesis protein  25.85 
 
 		 431 aa  55.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0629938 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22040  polysaccharide biosynthesis protein  31.68 
 
 		 517 aa  55.1  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1920  polysaccharide biosynthesis protein  22.67 
 
 		 484 aa  55.1  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0707623  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2455  polysaccharide biosynthesis protein  22.65 
 
 		 434 aa  54.7  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  29.7 
 
 		 449 aa  53.9  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6268  polysaccharide biosynthesis protein  25.83 
 
 		 454 aa  53.9  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.455573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0341  polysaccharide biosynthesis protein  22.68 
 
 		 500 aa  53.1  0.000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.467363  decreased coverage  0.0000100108 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1120  polysaccharide biosynthesis protein  29.09 
 
 		 478 aa  53.5  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77221  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0945  multi antimicrobial extrusion protein MatE  21.98 
 
 		 495 aa  52.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.903745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  22.19 
 
 		 487 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2602  polysaccharide biosynthesis protein  28.1 
 
 		 448 aa  51.6  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0177  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 446 aa  51.6  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1128  polysaccharide biosynthesis protein  23.87 
 
 		 547 aa  51.2  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  23.83 
 
 		 444 aa  51.2  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1942  polysaccharide biosynthesis protein  21.46 
 
 		 464 aa  50.4  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.634447  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2253  lipopolysaccharide (O-antigen)exporter  26.63 
 
 		 444 aa  50.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0508  polysaccharide biosynthesis protein  26.29 
 
 		 505 aa  50.1  0.00008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0639  polysaccharide biosynthesis protein  37.88 
 
 		 458 aa  50.1  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.216711  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1759  polysaccharide biosynthesis protein  24.52 
 
 		 423 aa  49.7  0.00009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  23.48 
 
 		 440 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2457  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 514 aa  49.7  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.267844  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2653  polysaccharide biosynthesis protein  19.44 
 
 		 448 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0424985 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0796  hypothetical membrane associated protein  22.15 
 
 		 436 aa  48.9  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.610272  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6018  polysaccharide biosynthesis protein  26.79 
 
 		 433 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.203106 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1965  polysaccharide biosynthesis protein  26.94 
 
 		 463 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0295315 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  26.42 
 
 		 427 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  24.07 
 
 		 471 aa  48.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2144  O-antigen and teichoic acid-like export protein  24.76 
 
 		 387 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0727  polysaccharide biosynthesis protein  24.62 
 
 		 478 aa  47.8  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.207142  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0138  polysaccharide biosynthesis protein  25.48 
 
 		 441 aa  47.8  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0849763  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0414  polysaccharide biosynthesis protein  21.94 
 
 		 500 aa  47.8  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37906  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0588  polysaccharide biosynthesis protein  24.1 
 
 		 410 aa  47.8  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0284636  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4321  polysaccharide biosynthesis protein  25.38 
 
 		 456 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1490  polysaccharide biosynthesis protein  21.74 
 
 		 479 aa  47.4  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3272  polysaccharide biosynthesis protein  26.16 
 
 		 546 aa  47.8  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.509561  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  28.83 
 
 		 476 aa  47.4  0.0005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0144  polysaccharide biosynthesis protein  29.63 
 
 		 423 aa  47  0.0006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.232636  normal  0.0172475 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2950  glycosyl transferase group 1  25.63 
 
 		 899 aa  47  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1392  hypothetical protein  21.52 
 
 		 860 aa  47  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0959  polysaccharide biosynthesis protein  22.84 
 
 		 507 aa  46.6  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1343  polysaccharide biosynthesis protein  21.89 
 
 		 432 aa  46.6  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  23.89 
 
 		 489 aa  46.6  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2629  polysaccharide biosynthesis protein  25.81 
 
 		 474 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.105104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4040  polysaccharide biosynthesis protein  26.46 
 
 		 444 aa  45.8  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.519664  normal  0.589796 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>