More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1804 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1804  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
415 aa  863    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2877  glycosyl transferase, group 1  39.75 
 
 
426 aa  290  2e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0391  glycosyl transferase group 1  38.52 
 
 
414 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4356  glycosyl transferase group 1  38.52 
 
 
409 aa  276  5e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.784045 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0256  glycosyl transferase group 1  37.22 
 
 
415 aa  262  8e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3553  glycosyl transferase group 1  36.72 
 
 
403 aa  250  3e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0516541  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1784  glycosyltransferase  32.92 
 
 
401 aa  243  5e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3179  glycosyl transferase group 1  37.66 
 
 
403 aa  243  5e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0451  putative glycosyl transferase  34.83 
 
 
401 aa  239  5.999999999999999e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4972  glycosyl transferase group 1  36.51 
 
 
445 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0591  glycosyl transferase group 1  35.61 
 
 
404 aa  237  3e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4248  glycosyl transferase group 1  34.2 
 
 
405 aa  231  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461257  normal  0.0976118 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2208  glycosyl transferase group 1  32.84 
 
 
403 aa  203  4e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120517  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2495  glycosyl transferase group 1  30.32 
 
 
392 aa  202  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1051  putative transferase  31.09 
 
 
384 aa  189  7e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3293  glycosyl transferase group 1  32.54 
 
 
392 aa  187  4e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2189  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 
394 aa  179  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1704  glycosyl transferase group 1  26.65 
 
 
410 aa  163  6e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2588  glycosyl transferase, group 1  27.66 
 
 
426 aa  160  4e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0719  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 
401 aa  158  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341706  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2669  glycosyl transferase, group 1  31 
 
 
404 aa  156  7e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4364  glycosyl transferase group 1  30.03 
 
 
393 aa  155  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5087  glycosyl transferase group 1  29.69 
 
 
390 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4622  glycosyl transferase group 1  29.38 
 
 
391 aa  145  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0028112 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1173  glycosyl transferase group 1  25.6 
 
 
391 aa  144  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0472  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 
424 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.465878  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5004  glycosyl transferase group 1  29.89 
 
 
435 aa  129  9.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000372843 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2501  glycosyl transferase group 1  25.89 
 
 
423 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0663849  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2225  glycosyl transferase group 1  26.81 
 
 
423 aa  125  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4490  glycosyl transferase, group 1  28.98 
 
 
398 aa  125  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6389  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 
387 aa  124  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.447732  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2183  glycosyl transferase group 1  26.93 
 
 
424 aa  122  8e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0575473  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4354  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 
421 aa  119  9e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0613  glycosyl transferase, group 1 family protein / moaA/nifB/pqqE family protein  26.1 
 
 
778 aa  113  6e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.12808  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1077  glycosyl transferase group 1  22.73 
 
 
402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000145174 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2500  glycosyl transferase group 1  27.98 
 
 
434 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0602967  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1116  glycosyltransferase  24.88 
 
 
413 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1720  glycosyl transferase group 1  28.02 
 
 
422 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.523158  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2224  glycosyl transferase group 1  27.7 
 
 
434 aa  111  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.307523  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2778  glycosyl transferase, group 1  24.88 
 
 
413 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2339  glycosyl transferase, group 1  30.03 
 
 
381 aa  110  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4198  glycosyl transferase group 1  26.8 
 
 
405 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  27.71 
 
 
381 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  29.33 
 
 
364 aa  108  2e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1118  group 1 glycosyltransferase  27.85 
 
 
425 aa  107  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48856  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2780  glycosyl transferase, group 1  27.52 
 
 
425 aa  106  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.301884  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2161  glycosyl transferase group 1  28.82 
 
 
377 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492248 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0082  glycosyl transferase group 1  25.76 
 
 
403 aa  105  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2063  glycosyl transferase, group 1  25.79 
 
 
392 aa  105  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0079  glycosyltransferase, putative  25.76 
 
 
403 aa  105  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.471525  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0797  glycosyl transferase group 1  28.49 
 
 
441 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.926616  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0772  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.82 
 
 
397 aa  103  4e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  29.75 
 
 
353 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0458  glycosyl transferase group 1  27.64 
 
 
447 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6400  glycosyl transferase group 1  25.6 
 
 
389 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4229  glycosyl transferase, group 1  24.08 
 
 
445 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0378432 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3228  glycosyl transferase, group 1  25.49 
 
 
401 aa  99.8  8e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.948731  normal  0.566821 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12420  glycosyltransferase  26.79 
 
 
381 aa  99.4  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338746  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1390  glycosyl transferase group 1  26.43 
 
 
539 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2977  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3557  glycosyl transferase group 1  28.38 
 
 
417 aa  99.4  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0744165  normal  0.646322 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  27.35 
 
 
395 aa  98.6  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0471  glycosyl transferase group 1  27.35 
 
 
422 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120961  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2182  glycosyl transferase group 1  26.84 
 
 
443 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.347756  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  25.24 
 
 
392 aa  97.4  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0177  glycosyl transferase group 1  24.71 
 
 
445 aa  96.3  8e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0643614  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4708  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 
418 aa  96.3  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.514087 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5224  glycosyl transferase group 1  25.5 
 
 
384 aa  95.1  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3446  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.62 
 
 
412 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1102  glycosyl transferase group 1  32.85 
 
 
358 aa  94.4  3e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  30.9 
 
 
355 aa  94.4  3e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1719  glycosyl transferase group 1  26.41 
 
 
421 aa  94.4  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0539  glycosyl transferase group 1  30.28 
 
 
377 aa  94.4  4e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3216  glycosyl transferase, group 1  27.3 
 
 
414 aa  94  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.573386  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2602  glycosyl transferase, group 1  29.96 
 
 
812 aa  94  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  36.96 
 
 
414 aa  93.6  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3107  glycosyl transferase, group 1  25.17 
 
 
452 aa  93.6  7e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4345  glycosyl transferase, group 1  30.25 
 
 
447 aa  92.8  9e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3926  glycosyl transferase group 1  25.38 
 
 
410 aa  92.8  9e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760133 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0604  glycosyl transferase group 1  29.15 
 
 
819 aa  92.4  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 
377 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  31.56 
 
 
373 aa  91.7  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1125  glycosyl transferase group 1  24.92 
 
 
414 aa  92  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.157828 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  34.55 
 
 
390 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4355  glycosyl transferase group 1  29.93 
 
 
420 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  35 
 
 
409 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1095  glycosyl transferase group 1  25.49 
 
 
376 aa  91.3  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.174275  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6490  glycosyl transferase, group 1  25.89 
 
 
414 aa  91.3  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.632954  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  29.03 
 
 
380 aa  90.5  5e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50356  glycosyl transferase, group 1  27.1 
 
 
507 aa  89.7  7e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  32.16 
 
 
401 aa  90.1  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2445  glycosyl transferase group 1  31.43 
 
 
375 aa  89.7  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  30.22 
 
 
407 aa  90.1  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0959  glycosyl transferase group 1  24.87 
 
 
388 aa  89.4  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  35.03 
 
 
381 aa  89.4  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  30.63 
 
 
405 aa  89  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  30.63 
 
 
405 aa  89  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1480  glycosyl transferase, group 1:PHP-like  31.25 
 
 
803 aa  87.8  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.117248 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  30.08 
 
 
377 aa  87.8  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2958  glycosyl transferase group 1  30.37 
 
 
366 aa  87.4  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.298871  hitchhiker  0.000213048 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  35.67 
 
 
378 aa  87.8  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>