110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1796 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
453 aa  912    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  58.33 
 
 
446 aa  511  1e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0777  polysaccharide biosynthesis protein  28.82 
 
 
441 aa  156  8e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1767  polysaccharide biosynthesis protein  27.52 
 
 
447 aa  147  3e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0935149 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1020  polysaccharide biosynthesis protein  27.09 
 
 
490 aa  124  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2996  polysaccharide biosynthesis protein  26.6 
 
 
459 aa  122  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.143417 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  24.75 
 
 
499 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3018  polysaccharide biosynthesis protein  25.25 
 
 
468 aa  109  9.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2754  polysaccharide biosynthesis protein  25.79 
 
 
460 aa  107  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.316209  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1685  polysaccharide biosynthesis protein  25.92 
 
 
441 aa  106  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.929392  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3553  polysaccharide biosynthesis protein  24.54 
 
 
458 aa  102  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0890  polysaccharide biosynthesis protein  31.67 
 
 
407 aa  102  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  25.3 
 
 
430 aa  97.4  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  26.47 
 
 
461 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3983  polysaccharide biosynthesis associated protein  25.62 
 
 
467 aa  95.5  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  26.15 
 
 
489 aa  93.6  6e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2304  polysaccharide biosynthesis protein  25.72 
 
 
494 aa  93.6  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298994  normal  0.0362143 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  24.55 
 
 
512 aa  93.2  8e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0561  polysaccharide biosynthesis protein  25.12 
 
 
456 aa  90.5  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3541  polysaccharide biosynthesis protein  24.94 
 
 
474 aa  87.8  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4001  polysaccharide biosynthesis protein  29.31 
 
 
455 aa  87.4  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.443077 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  22.66 
 
 
423 aa  87  7e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3832  polysaccharide biosynthesis protein  25.06 
 
 
471 aa  86.3  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.431872  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1411  polysaccharide biosynthesis protein  29.85 
 
 
456 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1391  polysaccharide biosynthesis protein  29.5 
 
 
456 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6968  PST family polysaccharide export protein  29.85 
 
 
458 aa  83.2  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.756164  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6268  polysaccharide biosynthesis protein  25.85 
 
 
454 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.455573  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2073  polysaccharide biosynthesis protein  25.78 
 
 
492 aa  81.3  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2684  polysaccharide biosynthesis protein  21.61 
 
 
539 aa  80.9  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2520  polysaccharide biosynthesis protein  26.58 
 
 
474 aa  79.7  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2188  polysaccharide biosynthesis protein  24.3 
 
 
495 aa  79.7  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0172  polysaccharide efflux transporter, putative  25.12 
 
 
495 aa  77.8  0.0000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.377433 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05198  hypothetical protein  27.94 
 
 
435 aa  77.8  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001317  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsJ Membrane protein export of O-antigen and teichoic acid  22.89 
 
 
435 aa  74.7  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.872862  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4685  polysaccharide biosynthesis protein  28.86 
 
 
453 aa  74.7  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  20.33 
 
 
490 aa  73.6  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  28.34 
 
 
504 aa  73.2  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2438  polysaccharide biosynthesis protein  23.66 
 
 
495 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1933  polysaccharide biosynthesis protein  32 
 
 
135 aa  73.2  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.546859 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2006  polysaccharide biosynthesis protein  27.42 
 
 
529 aa  72.4  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.300214  normal  0.433718 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  22.75 
 
 
488 aa  70.9  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0040  polysaccharide biosynthesis protein  20.71 
 
 
435 aa  69.3  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000125854  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  22.47 
 
 
444 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  26.24 
 
 
517 aa  67.4  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  21.72 
 
 
482 aa  65.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0259  polysaccharide biosynthesis protein  30.29 
 
 
498 aa  65.9  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0588  polysaccharide biosynthesis protein  25.29 
 
 
410 aa  65.1  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0284636  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1128  polysaccharide biosynthesis protein  23.67 
 
 
547 aa  64.7  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1942  polysaccharide biosynthesis protein  20.33 
 
 
464 aa  63.2  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.634447  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1961  polysaccharide biosynthesis protein  30.07 
 
 
431 aa  63.2  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0629938 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1862  polysaccharide efflux transporter, putative  25.45 
 
 
496 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3720  polysaccharide biosynthesis protein  24.47 
 
 
470 aa  63.2  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1361  polysaccharide biosynthesis protein  26.82 
 
 
413 aa  63.2  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483225  unclonable  0.0000000256808 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0416  polysaccharide biosynthesis protein  21.5 
 
 
506 aa  62  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.484223  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  23.64 
 
 
440 aa  61.6  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  27.75 
 
 
490 aa  61.2  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1490  polysaccharide biosynthesis protein  21.2 
 
 
479 aa  60.5  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  22.38 
 
 
444 aa  60.1  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  28.72 
 
 
476 aa  59.7  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0767  O-antigen transporter-like  24.53 
 
 
506 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0727  polysaccharide biosynthesis protein  29.79 
 
 
478 aa  59.3  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.207142  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8594  polysaccharide biosynthesis protein  22.22 
 
 
434 aa  58.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2457  polysaccharide biosynthesis protein  22.27 
 
 
514 aa  57.8  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.267844  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  27.13 
 
 
477 aa  56.6  0.0000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  27.86 
 
 
427 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  19.83 
 
 
489 aa  55.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2770  polysaccharide biosynthesis protein  23.96 
 
 
460 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0414  polysaccharide biosynthesis protein  19.61 
 
 
500 aa  54.7  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37906  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2455  polysaccharide biosynthesis protein  21.84 
 
 
434 aa  54.7  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0341  polysaccharide biosynthesis protein  21.03 
 
 
500 aa  54.7  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.467363  decreased coverage  0.0000100108 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0744  polysaccharide biosynthesis protein  24.1 
 
 
436 aa  54.3  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923042  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4321  polysaccharide biosynthesis protein  27.42 
 
 
456 aa  53.9  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2602  polysaccharide biosynthesis protein  27.37 
 
 
448 aa  53.1  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  24.85 
 
 
476 aa  52.8  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  26.06 
 
 
488 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0639  polysaccharide biosynthesis protein  27.84 
 
 
458 aa  53.1  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.216711  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3272  polysaccharide biosynthesis protein  23.13 
 
 
546 aa  52.4  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.509561  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1074  polysaccharide biosynthesis protein  29.27 
 
 
476 aa  52.4  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0510405  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  19.77 
 
 
483 aa  52.4  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2047  polysaccharide biosynthesis protein  20.81 
 
 
504 aa  52.4  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82849  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22040  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 
517 aa  50.8  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  21 
 
 
426 aa  50.4  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  22.67 
 
 
429 aa  50.4  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0987  polysaccharide biosynthesis protein  28.07 
 
 
458 aa  50.4  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.676741 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1608  polysaccharide biosynthesis protein  20.96 
 
 
492 aa  50.1  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3181  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  20.18 
 
 
501 aa  49.7  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  23.98 
 
 
475 aa  48.1  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5327  polysaccharide biosynthesis protein  27.84 
 
 
445 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0472551  normal  0.0858273 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  23.36 
 
 
451 aa  47  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4040  polysaccharide biosynthesis protein  22.73 
 
 
444 aa  47  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.519664  normal  0.589796 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3971  polysaccharide biosynthesis protein  20.53 
 
 
582 aa  46.6  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.137474  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  23.58 
 
 
487 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0508  polysaccharide biosynthesis protein  22.28 
 
 
505 aa  45.4  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1062  multi anti extrusion protein MatE  25.76 
 
 
464 aa  45.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4228  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 
486 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1966  polysaccharide biosynthesis protein  22.22 
 
 
507 aa  45.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2910  polysaccharide biosynthesis protein  23.67 
 
 
485 aa  45.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  21.02 
 
 
489 aa  45.1  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  21.08 
 
 
475 aa  44.7  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08851  hypothetical protein  20.26 
 
 
484 aa  45.1  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.227884  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>