76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1787 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1787  polymorphic outer membrane protein  100 
 
 		 1332 aa  2672    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1788  polymorphic membrane protein  72.41 
 
 		 1092 aa  780    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1790  polymorphic membrane protein  62.1 
 
 		 799 aa  887    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1792  hypothetical protein  71.52 
 
 		 932 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000052319  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1791  hypothetical protein  72.76 
 
 		 669 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0011076  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1789  hypothetical protein  68.77 
 
 		 1123 aa  438  1e-121  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1875  polymorphic membrane protein  31.8 
 
 		 507 aa  179  3e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  33.65 
 
 		 852 aa  166  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0327  conserved repeat domain protein  31.3 
 
 		 743 aa  159  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  34.23 
 
 		 2192 aa  157  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0726  hypothetical protein  32.2 
 
 		 1263 aa  147  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.434756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1921  hypothetical protein  35.96 
 
 		 350 aa  140  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.884061  normal  0.370126 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0005  polymorphic outer membrane protein  31.37 
 
 		 775 aa  136  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000710623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3801  Ig family protein  30.64 
 
 		 1170 aa  130  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000269985  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  32.97 
 
 		 1526 aa  130  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0619  Polymorphic membrane protein  31.52 
 
 		 1216 aa  129  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.418961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1035  hypothetical protein  33.41 
 
 		 1010 aa  125  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1920  hypothetical protein  35.38 
 
 		 417 aa  119  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.409778 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  26.99 
 
 		 1296 aa  117  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2319  hypothetical protein  39.21 
 
 		 1106 aa  115  5e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.300784  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  31.25 
 
 		 1318 aa  107  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  46.06 
 
 		 1394 aa  107  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0821  hypothetical protein  28.2 
 
 		 1055 aa  103  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.661621  normal  0.324111 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  38.86 
 
 		 14609 aa  103  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2515  hypothetical protein  27.76 
 
 		 441 aa  100  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1704  polymorphic outer membrane protein  25.65 
 
 		 1755 aa  94.4  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.041755  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2043  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.65 
 
 		 2031 aa  90.9  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  36.2 
 
 		 1831 aa  79.7  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  36.89 
 
 		 1188 aa  78.2  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3122  S-layer-like domain-containing protein  53.73 
 
 		 692 aa  73.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4084  TPR repeat-containing protein  41.94 
 
 		 462 aa  73.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.806562  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2032  hypothetical protein  37.82 
 
 		 1908 aa  73.2  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3282  hypothetical protein  41.94 
 
 		 149 aa  70.9  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.290972  hitchhiker  0.000227158 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2647  hypothetical protein  43.36 
 
 		 1487 aa  71.2  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1621  PA14 domain-containing protein  44.66 
 
 		 654 aa  66.6  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.459309  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2871  hypothetical protein  40.44 
 
 		 767 aa  64.3  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0966428  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0132  hypothetical protein  48.57 
 
 		 830 aa  64.3  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00263601  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1990  hypothetical protein  38.57 
 
 		 474 aa  58.9  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.842738  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4025  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  40.71 
 
 		 1480 aa  57.4  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  28.8 
 
 		 1197 aa  57.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3450  hypothetical protein  36 
 
 		 5453 aa  55.8  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.119049 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3321  hypothetical protein  39.04 
 
 		 1316 aa  55.5  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.72566 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2766  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1106 aa  55.1  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000116349  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2392  hypothetical protein  44.29 
 
 		 682 aa  54.7  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  47.76 
 
 		 3027 aa  54.7  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3279  PA14 domain protein  38.24 
 
 		 4009 aa  54.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0589032 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1865  hypothetical protein  45.71 
 
 		 640 aa  53.5  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1994  hypothetical protein  42.55 
 
 		 1321 aa  53.5  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0311677  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1246  putative lipoprotein  36.46 
 
 		 842 aa  53.1  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.229851  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4375  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.82 
 
 		 465 aa  52.4  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000665337 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  25.98 
 
 		 1750 aa  52  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  39.73 
 
 		 1066 aa  52  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4252  hypothetical protein  32.73 
 
 		 866 aa  51.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.908424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  34.4 
 
 		 483 aa  50.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  46.03 
 
 		 2117 aa  50.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2695  polymorphic membrane protein  28.97 
 
 		 483 aa  50.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0661586  hitchhiker  0.000503026 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1609  hypothetical protein  27.78 
 
 		 435 aa  50.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.0279779 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4370  polymorphic outer membrane protein  27.81 
 
 		 450 aa  49.3  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3703  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  37.76 
 
 		 4022 aa  49.7  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000991592 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0806  hypothetical protein  44.44 
 
 		 1107 aa  49.7  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0992  putative Vgr-related protein  27.27 
 
 		 979 aa  49.3  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2618  polymorphic outer membrane protein  26.32 
 
 		 863 aa  48.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1960  two component regulator propeller domain-containing protein  47.22 
 
 		 2374 aa  48.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1119  hypothetical protein  44.16 
 
 		 476 aa  47.8  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.993118  normal  0.376129 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3987  hypothetical protein  28.14 
 
 		 467 aa  48.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2876  parallel beta-helix repeat-containing protein  36.62 
 
 		 512 aa  47  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.794955 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2574  LamG domain-containing protein  39.56 
 
 		 3861 aa  47.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1554  Hemolysin-type calcium-binding region  33.67 
 
 		 677 aa  47  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1120  polymorphic outer membrane protein  40 
 
 		 441 aa  47  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2511  polymorphic membrane protein  29.03 
 
 		 477 aa  45.8  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.238754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  33.33 
 
 		 4357 aa  45.8  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4430  polymorphic outer membrane protein  29.14 
 
 		 465 aa  45.8  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3625  hypothetical protein  45.9 
 
 		 442 aa  45.4  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000590004 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  32 
 
 		 759 aa  45.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0877  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  37.36 
 
 		 3822 aa  45.4  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0168834 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  32.74 
 
 		 1037 aa  45.4  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>