24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1757 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1757  FG-GAP repeat-containing protein  100 
 
 		 730 aa  1442    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000292234  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1221  FG-GAP repeat-containing protein  50.57 
 
 		 779 aa  487  1e-136  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000316782  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1754  FG-GAP repeat-containing protein  42.71 
 
 		 776 aa  444  1e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000113998  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1753  FG-GAP repeat-containing protein  39.09 
 
 		 768 aa  368  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000543044  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1941  hypothetical protein  37.27 
 
 		 758 aa  320  7.999999999999999e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1756  FG-GAP repeat-containing protein  39.54 
 
 		 708 aa  310  8e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000241186  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  33.83 
 
 		 8871 aa  177  5e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  33.94 
 
 		 2000 aa  88.6  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0323  hypothetical protein  31.65 
 
 		 503 aa  64.3  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  26.25 
 
 		 604 aa  60.1  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  26.35 
 
 		 593 aa  54.3  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  27.56 
 
 		 3197 aa  51.6  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08314  conserved hypothetical protein  29.43 
 
 		 1282 aa  50.4  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4333  FG-GAP repeat protein  25.43 
 
 		 758 aa  50.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00966426  normal  0.30257 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00200  hypothetical protein  29.67 
 
 		 655 aa  48.9  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.846168  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  26.92 
 
 		 1557 aa  48.1  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16659  predicted protein  27.17 
 
 		 742 aa  47.8  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.33 
 
 		 1114 aa  47  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  22.61 
 
 		 1838 aa  45.1  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  27.51 
 
 		 4379 aa  45.1  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  24.91 
 
 		 1113 aa  44.7  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.841506 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  28.18 
 
 		 1976 aa  44.3  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0487  hypothetical protein  22.77 
 
 		 438 aa  44.3  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5057  ASPIC/UnbV domain protein  29.03 
 
 		 1166 aa  44.3  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.279918 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>