123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1733 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  100 
 
 		 746 aa  1512    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1994  hypothetical protein  37.92 
 
 		 1321 aa  172  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0311677  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  29.5 
 
 		 1022 aa  117  8.999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1185  Uracil-DNA glycosylase  31.32 
 
 		 295 aa  90.9  8e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.233821 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1791  protein of unknown function DUF1566  26.78 
 
 		 343 aa  90.9  8e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2076  protein of unknown function DUF1566  37.13 
 
 		 317 aa  90.1  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000300588  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3267  hypothetical protein  32.02 
 
 		 1123 aa  88.2  6e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0168  protein of unknown function DUF1566  28.66 
 
 		 333 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.409063  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2139  hypothetical protein  48.91 
 
 		 1011 aa  84.3  0.000000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000321254  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  47.92 
 
 		 1750 aa  84  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03098  putative orphan protein  32.39 
 
 		 591 aa  82  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2339  APHP domain protein  25.77 
 
 		 2002 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3291  hypothetical protein  34.11 
 
 		 165 aa  79  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285219  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3292  hypothetical protein  28.57 
 
 		 571 aa  79  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764747  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  38.24 
 
 		 855 aa  73.6  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  36.03 
 
 		 1107 aa  72  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0436  hypothetical protein  29.2 
 
 		 316 aa  72  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1619  hypothetical protein  29.32 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000971569  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0072  putative lipoprotein  29.61 
 
 		 480 aa  71.2  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  45.65 
 
 		 848 aa  71.2  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3266  hypothetical protein  34.06 
 
 		 176 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2546  hypothetical protein  31.97 
 
 		 181 aa  68.9  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2014  peptidase C25 gingipain  46.84 
 
 		 994 aa  68.9  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0011841  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2974  PKD domain-containing protein  45.92 
 
 		 833 aa  68.2  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3265  hypothetical protein  30.72 
 
 		 245 aa  67.8  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0740  fibronectin, type III domain-containing protein  33.33 
 
 		 409 aa  67.8  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128234  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  39.22 
 
 		 972 aa  67  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  36.51 
 
 		 848 aa  65.9  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2535  hypothetical protein  25.87 
 
 		 670 aa  65.5  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001259  hypothetical protein  26.88 
 
 		 477 aa  64.7  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0451  hypothetical protein  31.12 
 
 		 1152 aa  64.3  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2072  protein of unknown function DUF1566  36.22 
 
 		 166 aa  64.7  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000064519  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004053  hypothetical protein  37.23 
 
 		 994 aa  63.5  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000445976  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0007  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.74 
 
 		 913 aa  62.4  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0741  hypothetical protein  33.54 
 
 		 337 aa  62  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.452637  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0007  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.94 
 
 		 911 aa  61.2  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000289605 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00841  PKD domain protein  41.98 
 
 		 1098 aa  61.2  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2462  protein kinase  31.52 
 
 		 499 aa  60.8  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5348  peptidase M36 fungalysin  37.72 
 
 		 950 aa  60.8  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1186  hypothetical protein  28.68 
 
 		 179 aa  60.5  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.218554 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0625  PE-PGRS family protein  38.06 
 
 		 665 aa  58.5  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.215384  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6125  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.94 
 
 		 1212 aa  58.2  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.000714594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0590  PE-PGRS family protein  36.42 
 
 		 665 aa  58.2  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  35.34 
 
 		 1771 aa  58.2  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4740  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.22 
 
 		 1217 aa  58.2  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.51333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2890  hypothetical protein  32.17 
 
 		 514 aa  57  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.921469  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1232  PKD domain-containing protein  34.69 
 
 		 2706 aa  56.6  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1500  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.3 
 
 		 1293 aa  57.4  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  30.95 
 
 		 868 aa  55.5  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2651  PKD domain-containing protein  37.89 
 
 		 611 aa  55.5  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03097  putative Fimh-like protein  34.95 
 
 		 187 aa  55.5  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1422  PKD domain containing protein  40.18 
 
 		 400 aa  55.1  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0109  fibronectin type III domain-containing protein  35 
 
 		 1225 aa  55.1  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0825  protease domain-containing protein  37.63 
 
 		 1258 aa  54.7  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.184637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2171  hypothetical protein  34.69 
 
 		 1879 aa  54.7  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  38.46 
 
 		 868 aa  54.7  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  37.36 
 
 		 869 aa  54.3  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1130  hypothetical protein  27.72 
 
 		 768 aa  53.9  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.541884 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2224  PKD domain-containing protein  35.21 
 
 		 460 aa  53.9  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2857  hypothetical protein  37.08 
 
 		 1208 aa  53.5  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2953  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  36.27 
 
 		 1004 aa  53.9  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.5475 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  30.16 
 
 		 868 aa  53.9  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  39.56 
 
 		 863 aa  53.5  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2915  cell wall/surface repeat protein  31.47 
 
 		 1310 aa  53.9  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0807  hypothetical protein  32.41 
 
 		 587 aa  53.1  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0970671  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0521  hypothetical protein  35.42 
 
 		 164 aa  52.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  37.36 
 
 		 868 aa  52.8  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  37.36 
 
 		 867 aa  53.1  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  37.36 
 
 		 868 aa  52.8  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05133  hypothetical protein  25.76 
 
 		 380 aa  53.5  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3468  serine/threonine protein kinase  30.28 
 
 		 463 aa  52  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  29.37 
 
 		 868 aa  52  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0338  cytochrome c5530 family protein  32.99 
 
 		 969 aa  51.6  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.808886  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2254  PKD domain-containing protein  28.87 
 
 		 1011 aa  51.6  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000165849  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3768  protease domain-containing protein  40 
 
 		 1265 aa  52  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000500867  hitchhiker  0.00925065 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2914  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  28.98 
 
 		 1035 aa  51.2  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0248  PKD domain-containing protein  38.27 
 
 		 3278 aa  51.2  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.748556 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4979  Carbohydrate-binding family 9  32.06 
 
 		 1418 aa  51.2  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1524  outer membrane protein  27.72 
 
 		 777 aa  51.2  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.312083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1670  PKD domain containing protein  32.56 
 
 		 635 aa  50.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00387943  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1097  Kelch repeat-containing protein  28.91 
 
 		 1557 aa  50.1  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612946  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001260  hypothetical protein  32.97 
 
 		 190 aa  50.8  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4997  outer membrane protein  29.19 
 
 		 4428 aa  50.1  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4622  hypothetical protein  31 
 
 		 230 aa  50.4  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.417022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3607  hypothetical protein  31.52 
 
 		 145 aa  50.1  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.615518  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05135  hypothetical protein  31.87 
 
 		 190 aa  50.1  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1112  hypothetical protein  43.28 
 
 		 901 aa  48.9  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0403332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2034  outer membrane protein  28.29 
 
 		 465 aa  48.9  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.549347  normal  0.451307 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4990  Ig domain-containing protein  37.08 
 
 		 1532 aa  49.3  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  37.37 
 
 		 884 aa  48.9  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4145  hypothetical protein  27.75 
 
 		 756 aa  48.5  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.686732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1743  PKD domain containing protein  36.92 
 
 		 635 aa  48.9  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.619925  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  36 
 
 		 623 aa  48.1  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1432  hypothetical protein  30 
 
 		 172 aa  48.1  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000213962  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0388  protein of unknown function DUF1566  36.67 
 
 		 190 aa  48.5  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.470988  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  36.84 
 
 		 712 aa  48.1  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.94 
 
 		 590 aa  47.8  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194573 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0512  PKD domain-containing protein  39.36 
 
 		 706 aa  47.8  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0022816  normal  0.634462 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2203  protein of unknown function DUF1566  27.93 
 
 		 165 aa  47.8  0.0008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000589172  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0772  fibronectin type III domain-containing protein  36.26 
 
 		 497 aa  47.8  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>