More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1663 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1663  polyprenyl synthetase  100 
 
 
295 aa  599  1e-170  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.746907  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  48.32 
 
 
295 aa  259  4e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  46.42 
 
 
299 aa  256  3e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  47.65 
 
 
295 aa  255  5e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  49.49 
 
 
294 aa  251  8.000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2437  polyprenyl synthetase  48.81 
 
 
298 aa  251  1e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  45.39 
 
 
294 aa  249  4e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  46.98 
 
 
296 aa  248  7e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0416  Polyprenyl synthetase  47.72 
 
 
297 aa  241  1e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17563  predicted protein  44.98 
 
 
312 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0164113  normal  0.0513256 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  44.44 
 
 
295 aa  240  2.9999999999999997e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  46.74 
 
 
306 aa  239  5e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  45.92 
 
 
297 aa  236  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1668  geranyltranstransferase (farnesyldiphosphate synthase)  46.31 
 
 
296 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000016201  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20600  geranyltranstransferase  51.32 
 
 
295 aa  231  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.715859  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07880  geranyltranstransferase  51.32 
 
 
295 aa  231  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408699  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1935  farnesyl-diphosphate synthase  47.16 
 
 
297 aa  230  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  45.36 
 
 
300 aa  230  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0776  farnesyl-diphosphate synthase  44.37 
 
 
301 aa  229  5e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2183  Polyprenyl synthetase  45.42 
 
 
297 aa  228  8e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000465843  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  44.25 
 
 
294 aa  228  1e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2618  farnesyl-diphosphate synthase  43.42 
 
 
305 aa  226  3e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3432  farnesyl-diphosphate synthase  45.45 
 
 
315 aa  226  3e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2253  farnesyl-diphosphate synthase  45.24 
 
 
303 aa  226  4e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0847122  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0580  polyprenyl synthetase  47.42 
 
 
295 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3841  farnesyl-diphosphate synthase  49.06 
 
 
295 aa  226  4e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.599692  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2176  polyprenyl synthetase  46.62 
 
 
297 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000107352  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0605  polyprenyl synthetase  47.12 
 
 
295 aa  225  6e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158094  normal  0.173751 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0528  polyprenyl synthetase  47.42 
 
 
295 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  44.67 
 
 
299 aa  224  1e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004257  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  41.16 
 
 
294 aa  224  1e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2404  polyprenyl synthetase  45.08 
 
 
297 aa  224  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0620494  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0699  geranyltranstransferase  46.42 
 
 
295 aa  223  3e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  41.89 
 
 
297 aa  223  3e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  41.78 
 
 
307 aa  223  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1765  geranyltranstransferase  45.61 
 
 
297 aa  223  4e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316781  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0562  polyprenyl synthetase  47.08 
 
 
295 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109586  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0934  geranyltranstransferase  41.5 
 
 
298 aa  222  4.9999999999999996e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1746  farnesyl-diphosphate synthase  44.07 
 
 
306 aa  222  7e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0573  polyprenyl synthetase  47.6 
 
 
295 aa  221  8e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  44.33 
 
 
299 aa  221  8e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0156  Polyprenyl synthetase  41.98 
 
 
309 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2704  farnesyl-diphosphate synthase  40.96 
 
 
309 aa  221  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000153186  normal  0.671867 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0152  Polyprenyl synthetase  41.98 
 
 
309 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  hitchhiker  0.00332618 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  43.99 
 
 
299 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11560  geranyltranstransferase  47.44 
 
 
295 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1500  polyprenyl synthetase  44.63 
 
 
327 aa  219  3e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3212  geranyltranstransferase  43.9 
 
 
299 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000111364 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5006  farnesyl-diphosphate synthase  45.73 
 
 
295 aa  218  7e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3060  farnesyl-diphosphate synthase  41.28 
 
 
297 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.016258  hitchhiker  0.00000723246 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4173  farnesyl-diphosphate synthase  41.98 
 
 
316 aa  215  5.9999999999999996e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3221  farnesyl-diphosphate synthase  43.84 
 
 
295 aa  215  7e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  43 
 
 
300 aa  214  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0250  Polyprenyl synthetase  44.96 
 
 
297 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1400  Polyprenyl synthetase  44.63 
 
 
286 aa  214  9.999999999999999e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2789  polyprenyl synthetase  41.1 
 
 
293 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00992702  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  42.66 
 
 
300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0972  Polyprenyl synthetase  42.03 
 
 
320 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23311  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0516  polyprenyl synthetase  44.36 
 
 
308 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.472432  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1025  polyprenyl synthetase  43.79 
 
 
295 aa  213  2.9999999999999995e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  43.64 
 
 
306 aa  213  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7389  Polyprenyl synthetase  45.52 
 
 
337 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  42.66 
 
 
300 aa  212  7e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  43.1 
 
 
292 aa  212  7.999999999999999e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1058  geranyltranstransferase  47.1 
 
 
295 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0942  Polyprenyl synthetase  47.5 
 
 
295 aa  211  2e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2037  polyprenyl synthetase  39.86 
 
 
296 aa  209  3e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2770  polyprenyl synthetase  43.02 
 
 
293 aa  210  3e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.409346 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0497  polyprenyl synthetase  46.99 
 
 
308 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.385542  normal  0.0104009 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0413  geranyltranstransferase  40.68 
 
 
294 aa  209  4e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.058519  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0569  polyprenyl synthetase  45.21 
 
 
301 aa  208  8e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0210108  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0623  polyprenyl synthetase  43.98 
 
 
308 aa  208  1e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226314  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0818  geranyltranstransferase  42.23 
 
 
300 aa  207  2e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0904  farnesyl-diphosphate synthase  38.83 
 
 
296 aa  207  2e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1276  polyprenyl synthetase  40.29 
 
 
293 aa  206  3e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0835849  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7621  farnesyl-diphosphate synthase  43.98 
 
 
307 aa  206  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0290776  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0313  polyprenyl synthetase  43.23 
 
 
321 aa  205  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.732711 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1526  geranyltranstransferase  40.29 
 
 
293 aa  205  7e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2990  polyprenyl synthetase  39.93 
 
 
293 aa  204  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0298794  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3252  geranyltranstransferase  44.44 
 
 
306 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1383  polyprenyl synthetase  38.68 
 
 
293 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.444608 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1031  geranyltranstransferase  43.52 
 
 
303 aa  203  3e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1344  polyprenyl synthetase  38.68 
 
 
293 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00140947  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2320  Polyprenyl synthetase  43.08 
 
 
297 aa  203  3e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1985  polyprenyl synthetase  43.96 
 
 
307 aa  203  3e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3002  Polyprenyl synthetase  38.68 
 
 
293 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  decreased coverage  0.0000000854993 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19000  farnesyltranstransferase  38.33 
 
 
337 aa  203  3e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916261  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2435  geranyltranstransferase  43.56 
 
 
293 aa  202  4e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.408518  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3111  geranyltranstransferase  44.44 
 
 
306 aa  202  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1264  Polyprenyl synthetase  42.09 
 
 
297 aa  202  4e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3477  polyprenyl synthetase  38.95 
 
 
293 aa  202  5e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.171034  hitchhiker  0.00323812 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1916  Polyprenyl synthetase  38.18 
 
 
294 aa  202  6e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2632  farnesyl-diphosphate synthase  42.18 
 
 
297 aa  202  7e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1651  geranyltranstransferase  42.59 
 
 
291 aa  201  9e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0098  farnesyl-diphosphate synthase  47.17 
 
 
285 aa  201  9e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1358  polyprenyl synthetase  39.62 
 
 
293 aa  201  9e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00331153  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3073  geranyltranstransferase  44.3 
 
 
306 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2828  farnesyl-diphosphate synthase  40.88 
 
 
293 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1599  polyprenyl synthetase  42.59 
 
 
291 aa  201  9.999999999999999e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4821  polyprenyl synthetase  40.61 
 
 
294 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221306  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>