More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1660 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2931  elongation factor G  49.93 
 
 
688 aa  652    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.400395 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1933  elongation factor G  49.64 
 
 
697 aa  701    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0407442  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1969  elongation factor G  49.27 
 
 
692 aa  676    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.704236  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1985  elongation factor G  49.13 
 
 
697 aa  710    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.786263  normal  0.270154 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1660  translation elongation factor G  100 
 
 
691 aa  1420    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00040628  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2741  elongation factor G  48.63 
 
 
686 aa  675    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.784554  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2318  elongation factor G  48.68 
 
 
701 aa  688    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.866261  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1937  elongation factor G  49.28 
 
 
685 aa  645    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2909  elongation factor G  50.79 
 
 
686 aa  691    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1319  elongation factor G  50.44 
 
 
694 aa  702    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0378966  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0068  elongation factor G  51.59 
 
 
691 aa  732    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480211  normal  0.213325 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0656  elongation factor G  50.15 
 
 
694 aa  707    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2815  elongation factor G  49.49 
 
 
697 aa  707    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1905  elongation factor G  50 
 
 
701 aa  692    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.129196 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1785  elongation factor G  47.19 
 
 
687 aa  622  1e-177  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1152  elongation factor G  46.9 
 
 
682 aa  622  1e-177  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000572853  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2103  elongation factor G  48.78 
 
 
688 aa  623  1e-177  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0828  elongation factor G  45.81 
 
 
679 aa  609  1e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  45.04 
 
 
692 aa  608  9.999999999999999e-173  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1113  translation elongation factor G  45.2 
 
 
696 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.862086  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3663  translation elongation factor G  44.91 
 
 
690 aa  603  1.0000000000000001e-171  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.132269 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1142  elongation factor G  46.01 
 
 
680 aa  602  1.0000000000000001e-171  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.283647  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1794  elongation factor G  45.18 
 
 
695 aa  594  1e-168  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2972  translation elongation factor G  44.54 
 
 
673 aa  591  1e-167  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0832  translation elongation factor G  43.25 
 
 
695 aa  587  1e-166  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  44.22 
 
 
692 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1831  elongation factor G  43.67 
 
 
694 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000276436  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0698  elongation factor G  43.84 
 
 
692 aa  579  1e-164  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000205392  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  44.28 
 
 
692 aa  581  1e-164  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4753  translation elongation factor G  45.06 
 
 
701 aa  581  1e-164  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1229  translation elongation factor G  43.32 
 
 
673 aa  580  1e-164  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0505633  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0074  elongation factor G  43.5 
 
 
696 aa  576  1.0000000000000001e-163  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0096  elongation factor G  43.36 
 
 
696 aa  575  1.0000000000000001e-163  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2318  small GTP-binding protein domain-containing protein  45.28 
 
 
682 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  43.26 
 
 
692 aa  570  1e-161  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  43.02 
 
 
692 aa  567  1e-160  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  43.15 
 
 
689 aa  565  1e-160  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1045  translation elongation factor G  43.59 
 
 
696 aa  566  1e-160  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2016  elongation factor G  41.31 
 
 
697 aa  564  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  43.34 
 
 
689 aa  564  1.0000000000000001e-159  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1367  translation elongation factor G  42.21 
 
 
670 aa  564  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00560984 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  42.9 
 
 
692 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1931  elongation factor G  41.17 
 
 
697 aa  561  1e-158  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1486  elongation factor G  41.35 
 
 
695 aa  559  1e-158  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000303107  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  42.77 
 
 
692 aa  560  1e-158  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1948  elongation factor G  40.88 
 
 
697 aa  559  1e-158  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1022  elongation factor G  42.25 
 
 
683 aa  559  1e-158  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_995  translation elongation factor, GTPase  44.46 
 
 
683 aa  560  1e-158  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  42.42 
 
 
692 aa  561  1e-158  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1212  elongation factor G  43.95 
 
 
686 aa  556  1e-157  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3331  elongation factor G  42.46 
 
 
692 aa  558  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70074e-16 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0612  elongation factor G  40.96 
 
 
688 aa  556  1e-157  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0876048  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1065  elongation factor G  41.64 
 
 
692 aa  554  1e-156  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239049  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2879  elongation factor G  45.84 
 
 
694 aa  553  1e-156  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.450791  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  42.35 
 
 
697 aa  554  1e-156  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0844  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  42.82 
 
 
692 aa  555  1e-156  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0265516  decreased coverage  0.0000171204 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2729  elongation factor G  41.72 
 
 
697 aa  551  1e-155  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.255792  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0391  elongation factor G  41.27 
 
 
694 aa  550  1e-155  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0366  elongation factor G  41.13 
 
 
694 aa  550  1e-155  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  41.84 
 
 
691 aa  551  1e-155  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1187  translation elongation factor G  42.02 
 
 
688 aa  548  1e-155  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000405339  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1769  elongation factor G  41.29 
 
 
692 aa  547  1e-154  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00415674  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  40.47 
 
 
691 aa  548  1e-154  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1909  elongation factor G  40.73 
 
 
697 aa  545  1e-154  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.105206 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0124  translation elongation factor G  41.45 
 
 
707 aa  548  1e-154  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0128  elongation factor G  41.4 
 
 
692 aa  542  1e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000285485  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  41.4 
 
 
692 aa  544  1e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0289  elongation factor G  40.79 
 
 
698 aa  545  1e-153  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000225468  unclonable  2.3107599999999997e-27 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0119  elongation factor G  41.25 
 
 
692 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.92544e-59 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0188  elongation factor G  40.78 
 
 
693 aa  539  9.999999999999999e-153  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000059659  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  41.11 
 
 
692 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  41.25 
 
 
692 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000647757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  41.25 
 
 
692 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410071  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  41.25 
 
 
692 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1762  translation elongation factor G  41.9 
 
 
667 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.352706  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0950  elongation factor G  41.62 
 
 
691 aa  541  9.999999999999999e-153  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000219808  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  41.25 
 
 
692 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000590247  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  41.25 
 
 
692 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000392838  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0864  elongation factor G  40.56 
 
 
689 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000306199  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  41 
 
 
692 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000176822  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5198  elongation factor G  41.25 
 
 
692 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000109677  unclonable  1.5030900000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1762  elongation factor G  41.29 
 
 
693 aa  541  9.999999999999999e-153  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.286696  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2067  elongation factor G  41.4 
 
 
704 aa  539  9.999999999999999e-153  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000338261  normal  0.439953 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1141  elongation factor G  41.79 
 
 
691 aa  538  9.999999999999999e-153  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000161111  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0395  translation elongation factor G  40.7 
 
 
695 aa  537  1e-151  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.408849  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1223  elongation factor G  40.56 
 
 
697 aa  537  1e-151  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000218328  hitchhiker  0.000228753 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0283  translation elongation factor G  40.62 
 
 
691 aa  536  1e-151  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000288442  decreased coverage  0.000024327 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0453  elongation factor G  41.2 
 
 
691 aa  538  1e-151  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2910  translation elongation factor G  41.88 
 
 
695 aa  536  1e-151  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00946616  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2375  elongation factor G  41.8 
 
 
698 aa  532  1e-150  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.092172  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0542  elongation factor G  41.17 
 
 
691 aa  534  1e-150  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09730  translation elongation factor G  40.41 
 
 
688 aa  533  1e-150  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0661  translation elongation factor G  41.18 
 
 
692 aa  533  1e-150  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0156588  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0885  elongation factor G  41 
 
 
694 aa  532  1e-150  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000398473 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0262  elongation factor G  39.74 
 
 
692 aa  532  1e-150  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000815728  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0944  small GTP-binding protein  41.89 
 
 
703 aa  533  1e-150  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.303462  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0513  elongation factor G  41.17 
 
 
691 aa  533  1e-150  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0730313  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2299  elongation factor G  41.76 
 
 
704 aa  533  1e-150  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00120894  decreased coverage  0.000176451 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1442  elongation factor G  41.17 
 
 
691 aa  534  1e-150  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1857  elongation factor G  40.64 
 
 
699 aa  529  1e-149  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00459949  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>