More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1630 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1630  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 
474 aa  972    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.685537  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0844  peptidase M48 Ste24p  34.51 
 
 
470 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000290245  normal  0.0785618 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2122  TPR repeat-containing protein  34.87 
 
 
483 aa  230  3e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318434  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1555  peptidase M48, Ste24p  33.18 
 
 
481 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0483  peptidase M48 Ste24p  32.7 
 
 
490 aa  209  6e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00260218 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0679  peptidase M48 Ste24p  31.02 
 
 
472 aa  206  9e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.156874  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3647  peptidase M48, Ste24p  32.14 
 
 
480 aa  202  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00143596  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1448  peptidase M48 Ste24p  30.57 
 
 
469 aa  190  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.749654  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2483  peptidase M48, Ste24p  28.13 
 
 
500 aa  170  4e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2220  peptidase M48 Ste24p  29.97 
 
 
474 aa  167  5e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.687721  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  25.56 
 
 
484 aa  161  3e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3089  peptidase M48, Ste24p  34.43 
 
 
483 aa  155  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1330  hypothetical protein  28.7 
 
 
473 aa  152  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.643696  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2792  peptidase M48 Ste24p  29.28 
 
 
479 aa  148  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2537  peptidase M48, Ste24p  31.21 
 
 
502 aa  145  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.606815  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2202  peptidase M48, Ste24p  39.27 
 
 
486 aa  143  8e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000223537  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0200  peptidase M48, Ste24p  30.61 
 
 
475 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0178367 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1185  hypothetical protein  29.18 
 
 
478 aa  141  3e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  32.26 
 
 
268 aa  140  6e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1179  hypothetical protein  29.18 
 
 
478 aa  139  8.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0605  peptidase M48, Ste24p  26 
 
 
494 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3980  peptidase M48 Ste24p  31.21 
 
 
478 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  32.66 
 
 
268 aa  137  5e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  30.22 
 
 
264 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3190  hypothetical protein  27.08 
 
 
483 aa  135  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.602192  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0404  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 
604 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.527715  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0628  peptidase M48 Ste24p  30.38 
 
 
480 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.173678 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1232  hypothetical protein  30.3 
 
 
478 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.705832 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0056  peptidase M48, Ste24p  27.92 
 
 
461 aa  134  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.147991 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4186  peptidase M48 Ste24p  30.3 
 
 
478 aa  133  9e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.129955  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1262  peptidase M48, Ste24p  30.3 
 
 
478 aa  133  9e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349395  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3958  hypothetical protein  30.84 
 
 
477 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2378  peptidase M48 Ste24p  34.47 
 
 
640 aa  131  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0561  putative signal peptide protein  33.86 
 
 
561 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.611701  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1841  peptidase M48, Ste24p  26.19 
 
 
485 aa  130  6e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.891186  normal  0.107833 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0568  M48 family peptidase  33.11 
 
 
518 aa  130  7.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017113  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0130  peptidase M48, Ste24p  32.23 
 
 
528 aa  129  9.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  31.02 
 
 
278 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2250  peptidase M48, Ste24p  33.73 
 
 
284 aa  129  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.581419  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1069  peptidase M48 Ste24p  26.99 
 
 
488 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0482  peptidase M48 Ste24p  32.13 
 
 
569 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0188  peptidase M48 Ste24p  32.2 
 
 
632 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0183  peptidase M48 Ste24p  32.2 
 
 
632 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.457604 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0469  peptidase M48 Ste24p  32.13 
 
 
567 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  32.57 
 
 
605 aa  127  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1543  peptidase M48, Ste24p  30.19 
 
 
477 aa  126  7e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.457387  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  31.27 
 
 
280 aa  125  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2400  peptidase M48, Ste24p  32.05 
 
 
550 aa  125  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0992443  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0060  putative signal peptide protein  30.45 
 
 
533 aa  124  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0678938 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2820  peptidase M48, Ste24p  29.43 
 
 
481 aa  124  4e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1212  peptidase M48  31.2 
 
 
285 aa  124  5e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02141  peptidase M48, Ste24p  25.82 
 
 
487 aa  123  6e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.522189  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3517  peptidase M48 Ste24p  29.86 
 
 
487 aa  123  6e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000725556  normal  0.963067 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1695  peptidase M48, Ste24p  28.04 
 
 
485 aa  123  7e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  25.81 
 
 
424 aa  123  8e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51320  hypothetical protein  28.61 
 
 
477 aa  123  8e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000410651 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  30.16 
 
 
573 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1658  peptidase M48, Ste24p  28.82 
 
 
477 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.782843  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4392  hypothetical protein  28.31 
 
 
477 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0209  hypothetical protein  32.33 
 
 
561 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000702463 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0229  peptidase M48, Ste24p  32.33 
 
 
553 aa  121  3e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00038191  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3127  M48 family peptidase  29.38 
 
 
494 aa  120  3.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000135694  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1307  hypothetical protein  31.14 
 
 
490 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.31128  normal  0.470451 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0654  M48 family peptidase  31.47 
 
 
589 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1356  peptidase M48 Ste24p  29.38 
 
 
524 aa  120  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1239  M48 family peptidase  29.38 
 
 
494 aa  120  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000273921  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1971  peptidase M48 Ste24p  27.2 
 
 
486 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.436824  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0450  peptidase M48 Ste24p  33.78 
 
 
562 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101014  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002788  zinc metalloprotease  27.89 
 
 
483 aa  120  7e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0209  peptidase M48, Ste24p  33.73 
 
 
289 aa  120  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2987  peptidase M48 Ste24p  27.3 
 
 
487 aa  119  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.595956  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0287  hypothetical protein  31.47 
 
 
560 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0824  hypothetical protein  31.47 
 
 
572 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2169  peptidase M48 Ste24p  27.43 
 
 
486 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139537  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0985  M48 family peptidase  31.47 
 
 
589 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399945  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0582  hypothetical protein  31.47 
 
 
572 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10883  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2415  hypothetical protein  31.47 
 
 
572 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0028  hypothetical protein  31.47 
 
 
572 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.189438  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0827  hypothetical protein  31.47 
 
 
589 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1134  peptidase M48 Ste24p  28.51 
 
 
487 aa  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0120  peptidase M48 Ste24p  34.4 
 
 
279 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0733637 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2862  TPR repeat-containing protein YfgC  29.38 
 
 
487 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5176  peptidase M48 Ste24p  31.98 
 
 
521 aa  118  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1212  Zn-dependent protease, putative  29.35 
 
 
436 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776404  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0123  peptidase M48 Ste24p  34.4 
 
 
279 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2641  TPR repeat-containing protein YfgC  29.38 
 
 
487 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00482944  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2731  TPR repeat-containing protein YfgC  29.38 
 
 
487 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.211116  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0926  peptidase M48, Ste24p  27.51 
 
 
481 aa  118  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.240705 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2753  TPR repeat-containing protein YfgC  29.38 
 
 
487 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2689  TPR repeat-containing protein YfgC  29.38 
 
 
487 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.534359  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2869  hypothetical protein  29.39 
 
 
489 aa  118  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2749  peptidase M48 Ste24p  32.68 
 
 
494 aa  117  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114888  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3182  peptidase M48 Ste24p  29.38 
 
 
487 aa  117  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258553  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2482  peptidase M48, Ste24p  27.44 
 
 
488 aa  118  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0040  hypothetical protein  32.74 
 
 
513 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.257159 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1366  peptidase M48, Ste24p  29.87 
 
 
477 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03193  protease  26.62 
 
 
484 aa  117  5e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1913  peptidase M48, Ste24p  31.4 
 
 
489 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.910226  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1649  peptidase M48, Ste24p  30.14 
 
 
489 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2347  peptidase M48, Ste24p  30.14 
 
 
489 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.300143  decreased coverage  0.00000000108832 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>