More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1605 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1605  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 526 aa  1097    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1133  AMP-dependent synthetase and ligase  40.94 
 
 		 518 aa  364  2e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508244  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  38.1 
 
 		 523 aa  356  5e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  38.65 
 
 		 520 aa  353  5.9999999999999994e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  38.6 
 
 		 516 aa  350  5e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3514  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.31 
 
 		 525 aa  347  2e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270509  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  39.1 
 
 		 520 aa  345  1e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4080  AMP-dependent synthetase and ligase  37.98 
 
 		 518 aa  342  9e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656205  normal  0.161644 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.02 
 
 		 526 aa  342  1e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1595  AMP-dependent synthetase and ligase  38.31 
 
 		 519 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3816  AMP-dependent synthetase and ligase  39.07 
 
 		 518 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0163789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3720  AMP-dependent synthetase and ligase  38.49 
 
 		 518 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.189603  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5140  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.25 
 
 		 525 aa  339  5.9999999999999996e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24744  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3600  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.75 
 
 		 525 aa  339  7e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.887287  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2924  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.55 
 
 		 526 aa  339  9e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.42655 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  37.24 
 
 		 509 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3975  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.11 
 
 		 530 aa  335  7.999999999999999e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.251646  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3704  AMP-dependent synthetase and ligase  36.05 
 
 		 515 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0990866  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2038  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  36.05 
 
 		 565 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2745  AMP-dependent synthetase and ligase  39.77 
 
 		 519 aa  334  3e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000193004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4826  AMP-dependent synthetase and ligase  38.09 
 
 		 520 aa  334  3e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0178748  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4758  AMP-dependent synthetase and ligase  37.72 
 
 		 518 aa  333  4e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5827  AMP-dependent synthetase and ligase  37.55 
 
 		 518 aa  333  5e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.671788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1367  AMP-dependent synthetase and ligase  39.13 
 
 		 502 aa  332  9e-90  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.439129  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1868  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.21 
 
 		 525 aa  331  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.205754 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3993  AMP-dependent synthetase and ligase  38.27 
 
 		 524 aa  330  4e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.968795  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3158  AMP-dependent synthetase and ligase  36.81 
 
 		 515 aa  330  4e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1964  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.18 
 
 		 525 aa  330  4e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1724  AMP-dependent synthetase and ligase  35.67 
 
 		 515 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0701995  normal  0.167784 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5944  AMP-dependent synthetase and ligase  36.73 
 
 		 532 aa  328  2.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420174  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  35.36 
 
 		 512 aa  326  5e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5034  AMP-dependent synthetase and ligase  37.7 
 
 		 517 aa  326  5e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5826  AMP-dependent synthetase and ligase  37.7 
 
 		 517 aa  326  5e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4353  AMP-dependent synthetase and ligase  37.5 
 
 		 517 aa  325  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  36.73 
 
 		 509 aa  323  6e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5309  AMP-dependent synthetase and ligase  35.2 
 
 		 517 aa  322  9.000000000000001e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2246  AMP-dependent synthetase and ligase  37.76 
 
 		 517 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000334479  hitchhiker  6.92492e-16 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  37.9 
 
 		 511 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  34.67 
 
 		 521 aa  322  9.999999999999999e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6394  AMP-dependent synthetase and ligase  36.77 
 
 		 517 aa  322  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178832  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  37.98 
 
 		 520 aa  320  5e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5942  AMP-dependent synthetase and ligase  36.17 
 
 		 516 aa  320  5e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.050377 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  36.35 
 
 		 515 aa  319  6e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0682  AMP-dependent synthetase and ligase  36.59 
 
 		 530 aa  318  1e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1676  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.04 
 
 		 526 aa  318  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.591328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  38.83 
 
 		 499 aa  318  2e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.58 
 
 		 514 aa  317  2e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  34.4 
 
 		 539 aa  317  3e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3747  AMP-dependent synthetase and ligase  37.35 
 
 		 514 aa  315  9.999999999999999e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1515  AMP-dependent synthetase and ligase  36.75 
 
 		 515 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00288915  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1538  AMP-dependent synthetase and ligase  36.75 
 
 		 515 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0661  AMP-binding enzyme family protein  35.09 
 
 		 520 aa  313  3.9999999999999997e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4691  AMP-dependent synthetase and ligase  38.64 
 
 		 502 aa  313  5.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1666  AMP-dependent synthetase and ligase  33.52 
 
 		 518 aa  313  5.999999999999999e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1763  AMP-dependent synthetase and ligase  35.81 
 
 		 521 aa  311  2e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.494407 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2485  AMP-dependent synthetase and ligase  34.83 
 
 		 534 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.71 
 
 		 519 aa  311  2.9999999999999997e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3890  AMP-dependent synthetase and ligase  34.3 
 
 		 517 aa  310  4e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0529507  normal  0.227811 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1837  AMP-dependent synthetase and ligase  35.16 
 
 		 518 aa  310  4e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.963932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  35.7 
 
 		 525 aa  309  6.999999999999999e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1498  AMP-dependent synthetase and ligase  34.63 
 
 		 531 aa  309  8e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  34.87 
 
 		 503 aa  309  9e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  34.65 
 
 		 520 aa  309  9e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2377  AMP-dependent synthetase and ligase  36.62 
 
 		 530 aa  307  3e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.581612  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.55 
 
 		 582 aa  306  6e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4595  AMP-dependent synthetase and ligase  35.52 
 
 		 525 aa  306  7e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.28 
 
 		 561 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0970  AMP-dependent synthetase and ligase  38.96 
 
 		 520 aa  305  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0371  AMP-dependent synthetase and ligase  36.64 
 
 		 544 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00566676  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.36 
 
 		 563 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  35.91 
 
 		 518 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.65 
 
 		 561 aa  303  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.55 
 
 		 563 aa  303  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0851  acyl-CoA synthetase  35.35 
 
 		 504 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0227528 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  34.83 
 
 		 534 aa  303  7.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.55948  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  38.52 
 
 		 525 aa  302  1e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1211  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.76 
 
 		 527 aa  302  1e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.24 
 
 		 561 aa  301  1e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4616  AMP-dependent synthetase and ligase  37.35 
 
 		 518 aa  301  2e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  34.57 
 
 		 566 aa  301  2e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0337  AMP-dependent synthetase and ligase  35.95 
 
 		 577 aa  301  2e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.238028  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5271  AMP-dependent synthetase and ligase  38.58 
 
 		 541 aa  300  4e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.74 
 
 		 561 aa  300  5e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0177  putative ligase  35.52 
 
 		 514 aa  299  7e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.709782 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3215  O-succinylbenzoate-CoA ligase  37.5 
 
 		 517 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0554015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.36 
 
 		 582 aa  298  1e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3204  O-succinylbenzoate-CoA ligase  37.5 
 
 		 517 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716175  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3266  O-succinylbenzoate-CoA ligase  37.5 
 
 		 517 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.10141  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.36 
 
 		 563 aa  298  2e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1963  AMP-binding domain protein  33.81 
 
 		 560 aa  298  2e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17114  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.36 
 
 		 563 aa  298  2e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3611  AMP-dependent synthetase and ligase  35.24 
 
 		 532 aa  298  2e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0778531  normal  0.0346233 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4472  AMP-dependent synthetase and ligase  35.14 
 
 		 517 aa  298  2e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4820  acyl-CoA synthetase  34.3 
 
 		 533 aa  297  3e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.755365  normal  0.560915 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  35.69 
 
 		 569 aa  297  4e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3076  acyl-CoA synthetase  34.19 
 
 		 545 aa  296  6e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.67 
 
 		 561 aa  296  6e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4389  acyl-CoA synthetase  33.72 
 
 		 533 aa  295  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0682495  normal  0.0388697 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0171  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 630 aa  294  3e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  34.3 
 
 		 536 aa  293  5e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000011697 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>