134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1573 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1573  hydroxypyruvate reductase  100 
 
 		 452 aa  908    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0993833  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3915  MOFRL domain-containing protein  49.77 
 
 		 443 aa  401  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2751  glycerate 2-kinase  49.77 
 
 		 486 aa  380  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1997  hydroxypyruvate reductase  49.55 
 
 		 458 aa  365  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.05256 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0207  hydroxypyruvate reductase  44.11 
 
 		 459 aa  363  5.0000000000000005e-99  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2801  Hydroxypyruvate reductase  49.55 
 
 		 452 aa  355  6.999999999999999e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0099  Hydroxypyruvate reductase  44.09 
 
 		 443 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2205  hydroxypyruvate reductase  48.06 
 
 		 454 aa  352  8e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.870447 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0944  Hydroxypyruvate reductase  48.04 
 
 		 439 aa  351  1e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0451317  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3272  hydroxypyruvate reductase  48.86 
 
 		 458 aa  333  3e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.571627 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1595  glycerate 2-kinase  48.07 
 
 		 424 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00618023  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3263  glycerate 2-kinase  48.71 
 
 		 420 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3389  Hydroxypyruvate reductase  45.13 
 
 		 453 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.911945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1569  hydroxypyruvate reductase  46.96 
 
 		 424 aa  312  9e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.305775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2854  glycerate 2-kinase  45.33 
 
 		 428 aa  311  1e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2115  hydroxypyruvate reductase  46.12 
 
 		 440 aa  311  2e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122606 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3865  hydroxypyruvate reductase  46.96 
 
 		 424 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.57883  normal  0.36576 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4300  hydroxypyruvate reductase  46.69 
 
 		 424 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1122  hydroxypyruvate reductase  47.87 
 
 		 440 aa  310  4e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.468975  normal  0.520204 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3177  hydroxypyruvate reductase  47.31 
 
 		 428 aa  308  9e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000791929 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0806  Hydroxypyruvate reductase  43.36 
 
 		 496 aa  308  1.0000000000000001e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3625  hydroxypyruvate reductase  46.41 
 
 		 424 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3921  Hydroxypyruvate reductase  46.12 
 
 		 446 aa  306  3e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0976  hydroxypyruvate reductase  46.67 
 
 		 429 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0906913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3609  MOFRL domain protein  46.51 
 
 		 419 aa  305  8.000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1715  Hydroxypyruvate reductase  50.27 
 
 		 421 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.497663 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3833  hypothetical protein  46.69 
 
 		 421 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1721  hydroxypyruvate reductase  50.14 
 
 		 447 aa  305  1.0000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.374264  normal  0.0199208 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1502  Hydroxypyruvate reductase  43.73 
 
 		 446 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45030  hypothetical protein  46.69 
 
 		 421 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1042  Hydroxypyruvate reductase  47.62 
 
 		 440 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2309  hydroxypyruvate reductase  45.7 
 
 		 426 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.866459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1434  hydroxypyruvate reductase  46.12 
 
 		 438 aa  303  3.0000000000000004e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1253  hydroxypyruvate reductase  41.33 
 
 		 412 aa  303  3.0000000000000004e-81  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000356699  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3154  Hydroxypyruvate reductase  46.99 
 
 		 439 aa  301  1e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.941324 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3717  Hydroxypyruvate reductase  45.36 
 
 		 420 aa  301  2e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2421  Hydroxypyruvate reductase  44.94 
 
 		 454 aa  300  3e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2464  hydroxypyruvate reductase  49.86 
 
 		 421 aa  300  4e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2329  hydroxypyruvate reductase  45.48 
 
 		 432 aa  299  7e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.162481  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3451  glycerate 2-kinase  47.79 
 
 		 443 aa  299  7e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3294  glycerate 2-kinase  47.51 
 
 		 435 aa  298  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.805027  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1018  hydroxypyruvate reductase  45.7 
 
 		 448 aa  298  1e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49104  normal  0.460124 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3481  Hydroxypyruvate reductase  46.72 
 
 		 439 aa  297  2e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.866282  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1449  hydroxypyruvate reductase oxidoreductase protein  45.55 
 
 		 446 aa  295  1e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.618251  normal  0.42713 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2454  Hydroxypyruvate reductase  44.29 
 
 		 439 aa  294  2e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.50925  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2118  glycerate 2-kinase  46.13 
 
 		 426 aa  293  4e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_004310  BR0355  hydroxypyruvate reductase, putative  42.6 
 
 		 428 aa  291  1e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4311  hydroxypyruvate reductase  42.69 
 
 		 422 aa  291  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0996892 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0372  putative hydroxypyruvate reductase  42.6 
 
 		 448 aa  290  5.0000000000000004e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.236389  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2839  MOFRL  41.65 
 
 		 421 aa  289  6e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127402  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0534  hydroxypyruvate reductase  39.9 
 
 		 415 aa  289  8e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0143531  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1644  Hydroxypyruvate reductase  44.33 
 
 		 421 aa  286  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.265451 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4659  Hydroxypyruvate reductase  48.58 
 
 		 419 aa  285  8e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1319  hydroxypyruvate reductase  47.79 
 
 		 422 aa  285  2.0000000000000002e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0461  hydroxypyruvate reductase  43.81 
 
 		 424 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38588  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2772  glycerate 2-kinase  47.24 
 
 		 424 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569344  normal  0.431109 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1207  hydroxypyruvate reductase  39.29 
 
 		 417 aa  283  5.000000000000001e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103634  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1248  hydroxypyruvate reductase  39.29 
 
 		 417 aa  283  5.000000000000001e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0928  hydroxypyruvate reductase  46.65 
 
 		 460 aa  283  6.000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1160  hydroxypyruvate reductase  45.84 
 
 		 439 aa  282  9e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.370064  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1113  hydroxypyruvate reductase  45.36 
 
 		 448 aa  278  2e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1425  Hydroxypyruvate reductase  46.33 
 
 		 424 aa  276  8e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0377  Hydroxypyruvate reductase  43.1 
 
 		 432 aa  274  3e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.487635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1461  Hydroxypyruvate reductase  43.73 
 
 		 424 aa  274  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012769  normal  0.0639524 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0472  hydroxypyruvate reductase  38.7 
 
 		 442 aa  273  5.000000000000001e-72  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.488589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3163  hydroxypyruvate reductase  41.3 
 
 		 423 aa  272  9e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0654  MOFRL domain protein  45.86 
 
 		 419 aa  271  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2615  hydroxypyruvate reductase  44.76 
 
 		 422 aa  271  2e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5562  hydroxypyruvate reductase  41.58 
 
 		 404 aa  269  8.999999999999999e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.912561  normal  0.104542 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0405  MOFRL  41.15 
 
 		 432 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0774334 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1267  hydroxypyruvate reductase  46.13 
 
 		 422 aa  267  2.9999999999999995e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.315917  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3104  hydroxypyruvate reductase  45.29 
 
 		 418 aa  267  2.9999999999999995e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.561288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4629  hydroxypyruvate reductase  48.41 
 
 		 440 aa  266  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2209  hydroxypyruvate reductase  42.05 
 
 		 444 aa  266  5e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9119  hydroxypyruvate reductase  44.51 
 
 		 411 aa  264  2e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5964  MOFRL domain protein  45.02 
 
 		 434 aa  264  3e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1889  hydroxypyruvate reductase  40.1 
 
 		 450 aa  263  4.999999999999999e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000303684  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0477  hydroxypyruvate reductase  43.72 
 
 		 374 aa  263  6e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2747  hydroxypyruvate reductase  45.36 
 
 		 437 aa  261  1e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1132  hydroxypyruvate reductase  45.06 
 
 		 435 aa  261  2e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.217848 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2974  Hydroxypyruvate reductase  45.36 
 
 		 437 aa  260  4e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.845005 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5205  hydroxypyruvate reductase  44.86 
 
 		 434 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.37508  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4017  hydroxypyruvate reductase  38.9 
 
 		 442 aa  259  6e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0362  Hydroxypyruvate reductase  43.24 
 
 		 432 aa  258  1e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.228357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0380  MOFRL domain protein  43.32 
 
 		 504 aa  258  2e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.328441  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0486  putative hydroxypyruvate reductase oxidoreductase protein  42.97 
 
 		 432 aa  257  3e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0463  hydroxypyruvate reductase  43.51 
 
 		 437 aa  257  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00870475  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2759  Hydroxypyruvate reductase  46.35 
 
 		 317 aa  256  5e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3046  Hydroxypyruvate reductase  44.22 
 
 		 415 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.418895  normal  0.698329 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1233  glycerate 2-kinase  38.62 
 
 		 441 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.273528 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2230  hydroxypyruvate reductase  41.35 
 
 		 451 aa  253  6e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0085  hydroxypyruvate reductase  37.6 
 
 		 403 aa  252  1e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.145768  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2869  Hydroxypyruvate reductase  45.11 
 
 		 437 aa  251  1e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1897  hydroxypyruvate reductase  44.69 
 
 		 438 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.216641 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5683  Hydroxypyruvate reductase  43.53 
 
 		 428 aa  250  3e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.272807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7083  putative hydroxypyruvate reductase  43.99 
 
 		 426 aa  248  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3413  Hydroxypyruvate reductase  40.99 
 
 		 443 aa  248  1e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.691767  normal  0.696405 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2372  hydroxypyruvate reductase  47.53 
 
 		 424 aa  247  4e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.137273  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3926  hydroxypyruvate reductase  41.26 
 
 		 407 aa  243  3.9999999999999997e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2000  Hydroxypyruvate reductase  44.69 
 
 		 426 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>