More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1550 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 913 aa  1888    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.75 
 
 		 710 aa  545  1e-153  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3069  hypothetical protein  48.35 
 
 		 502 aa  492  1e-137  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2917  hypothetical protein  47.4 
 
 		 495 aa  455  1.0000000000000001e-126  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.381583  normal  0.0360554 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3240  hypothetical protein  45.82 
 
 		 485 aa  434  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.57921  normal  0.496079 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1856  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  41.63 
 
 		 484 aa  363  5.0000000000000005e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0653145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0741  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.47 
 
 		 287 aa  316  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.47 
 
 		 287 aa  313  7.999999999999999e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.553198 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0081  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.87 
 
 		 288 aa  313  1e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0091  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.23 
 
 		 287 aa  312  2e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.23 
 
 		 287 aa  312  2e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0938298 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10149  short-chain type dehydrogenase/reductase  54.68 
 
 		 286 aa  306  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3672  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.71 
 
 		 299 aa  292  2e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.382013  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.76 
 
 		 298 aa  287  8e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0473963 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3277  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.2 
 
 		 303 aa  281  5e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.362955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.13 
 
 		 301 aa  280  8e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4607  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.2 
 
 		 304 aa  279  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.707593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1699  short-chain dehydrogenase  47.19 
 
 		 303 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.650982  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0903  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.2 
 
 		 303 aa  276  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19730  oxidoreductase  47.19 
 
 		 303 aa  276  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54590  predicted protein  50.48 
 
 		 901 aa  274  5.000000000000001e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.900491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1025  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.36 
 
 		 303 aa  271  4e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1187  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  45.03 
 
 		 306 aa  271  5e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.49232  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.25 
 
 		 326 aa  270  1e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.130256  normal  0.744191 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.53 
 
 		 302 aa  268  2.9999999999999995e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.662956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5107  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.79 
 
 		 300 aa  268  4e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.21 
 
 		 306 aa  267  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.37 
 
 		 306 aa  263  1e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.05 
 
 		 307 aa  259  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0531  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.09 
 
 		 300 aa  260  1e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.490724 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.19 
 
 		 303 aa  257  7e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170855 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2470  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.62 
 
 		 302 aa  253  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.928177  normal  0.402686 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07111  peroxisomal multifunctional beta-oxidation protein (MFP), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03900)  46.96 
 
 		 903 aa  251  3e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.928702 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7556  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.3 
 
 		 310 aa  251  4e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.206699  normal  0.239691 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2673  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.11 
 
 		 302 aa  249  1e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3584  putative 3-oxo-(acyl) acyl carrier protein reductase  46.32 
 
 		 305 aa  249  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.185975 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.38 
 
 		 303 aa  247  6e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.935758  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.49 
 
 		 305 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145523  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.49 
 
 		 305 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2250  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.26 
 
 		 305 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.143825 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02530  peroxisomal hydratase-dehydrogenase-epimerase (hde), putative  44.44 
 
 		 893 aa  246  1.9999999999999999e-63  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.874708  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.46 
 
 		 300 aa  245  3e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0277304  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3088  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.26 
 
 		 304 aa  235  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.119324 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.59 
 
 		 313 aa  229  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.823461  normal  0.8573 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.97 
 
 		 305 aa  226  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4960  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.74 
 
 		 315 aa  226  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588653 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4404  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.57 
 
 		 306 aa  222  3e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0264564  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4785  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.57 
 
 		 306 aa  222  3e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.583445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.57 
 
 		 306 aa  222  3e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.227424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.09 
 
 		 292 aa  221  7e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.943405  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3697  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.78 
 
 		 313 aa  219  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.4 
 
 		 324 aa  217  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2572  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.2 
 
 		 324 aa  217  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.710215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2535  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.2 
 
 		 324 aa  217  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2580  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.2 
 
 		 324 aa  217  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4011  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.64 
 
 		 298 aa  213  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0205558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3473  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.75 
 
 		 301 aa  210  8e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.072083  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5003  putative short-chain dehydrogenase/reductase (SDR)  48.33 
 
 		 292 aa  210  9e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.874894  normal  0.0924335 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4858  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.81 
 
 		 296 aa  205  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.610122  hitchhiker  0.00520466 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.34 
 
 		 309 aa  205  3e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2739  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.59 
 
 		 311 aa  202  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.71 
 
 		 330 aa  201  5e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.872032  normal  0.990954 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51090  putative short-chain dehydrogenase  44.31 
 
 		 305 aa  201  5e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.264954  decreased coverage  0.0000000605367 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4360  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  44.08 
 
 		 305 aa  198  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.49 
 
 		 303 aa  196  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.707326  normal  0.647553 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5264  short chain dehydrogenase  44.35 
 
 		 301 aa  196  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251034 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.85 
 
 		 304 aa  196  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.973292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1492  short chain dehydrogenase  46.37 
 
 		 301 aa  196  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2930  putative short-chain dehydrogenase  44.58 
 
 		 304 aa  194  6e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5066  short chain dehydrogenase  43.95 
 
 		 301 aa  194  9e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.727463  normal  0.567593 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4681  short chain dehydrogenase  43.95 
 
 		 301 aa  194  9e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.351016  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4767  short chain dehydrogenase  43.95 
 
 		 301 aa  194  9e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1878  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.78 
 
 		 304 aa  193  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0386113 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1387  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.53 
 
 		 301 aa  191  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2388  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.53 
 
 		 301 aa  191  5e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1977  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.97 
 
 		 304 aa  189  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0854681  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3589  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.37 
 
 		 304 aa  189  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.336775  normal  0.435247 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3834  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.62 
 
 		 303 aa  187  6e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157096  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.55 
 
 		 301 aa  186  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.407831  normal  0.964751 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44 
 
 		 310 aa  185  4.0000000000000006e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13581  short chain dehydrogenase  42.69 
 
 		 304 aa  184  6e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0990591 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.4 
 
 		 294 aa  183  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0089985 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.56 
 
 		 305 aa  182  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.157995  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6895  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.95 
 
 		 301 aa  182  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4624  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 		 301 aa  181  4.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2933  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.52 
 
 		 351 aa  180  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.497281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.65 
 
 		 306 aa  180  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6296  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.57 
 
 		 305 aa  179  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953973  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2055  protein of unknown function DUF35  29.51 
 
 		 474 aa  178  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0203372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.98 
 
 		 301 aa  178  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2341  short chain dehydrogenase  41.9 
 
 		 291 aa  176  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199722  decreased coverage  0.00200779 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.11 
 
 		 301 aa  175  3.9999999999999995e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.45898  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.65 
 
 		 316 aa  174  9e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0535694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0196  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.5 
 
 		 334 aa  174  9e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 301 aa  173  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.761218 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0098  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.33 
 
 		 300 aa  172  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8749  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.46 
 
 		 317 aa  171  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.199675 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2741  short chain dehydrogenase  37.14 
 
 		 293 aa  171  6e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0662614  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4414  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.27 
 
 		 304 aa  171  8e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.27323  normal  0.448536 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.5 
 
 		 305 aa  170  9e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.260826 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>