132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1540 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1540  methyltransferase type 11  100 
 
 		 402 aa  832    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000274527  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0445  Methyltransferase type 11  44.14 
 
 		 399 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.832039  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2330  hypothetical protein  40.91 
 
 		 403 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0440768  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1828  Methyltransferase type 12  43.47 
 
 		 412 aa  301  1e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.358298  hitchhiker  0.0000267475 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1320  Methyltransferase type 11  45.1 
 
 		 315 aa  278  2e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.065684 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1722  hypothetical protein  41.48 
 
 		 350 aa  226  4e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0224  hypothetical protein  46.67 
 
 		 214 aa  186  4e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0587288  normal  0.156271 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1822  Methyltransferase type 11  45.67 
 
 		 213 aa  169  6e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00574627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6034  hypothetical protein  47.37 
 
 		 211 aa  158  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.335724  normal  0.0737922 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1009  Methyltransferase type 11  43.54 
 
 		 215 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00599159  normal  0.0418085 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2718  hypothetical protein  45.78 
 
 		 217 aa  156  6e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0525784  normal  0.0841779 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1270  hypothetical protein  41.51 
 
 		 217 aa  151  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37443  predicted protein  40.55 
 
 		 279 aa  150  5e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0385962  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13313  predicted protein  38.79 
 
 		 229 aa  150  5e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1120  hypothetical protein  40.95 
 
 		 217 aa  149  8e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1926  Methyltransferase type 11  41.04 
 
 		 213 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1977  hypothetical protein  41.92 
 
 		 217 aa  146  6e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.183577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2053  methyltransferase type 11  38.97 
 
 		 221 aa  143  5e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.617016 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2938  Methyltransferase type 11  44.24 
 
 		 216 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27591  predicted protein  37.39 
 
 		 241 aa  142  9.999999999999999e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.861459  normal  0.248845 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3179  hypothetical protein  44.24 
 
 		 216 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3170  methyltransferase type 11  47.49 
 
 		 219 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0295556  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1330  hypothetical protein  40.43 
 
 		 218 aa  135  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14191  predicted protein  39.66 
 
 		 225 aa  131  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1476  hypothetical protein  40.61 
 
 		 218 aa  125  1e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.470823 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13458  predicted protein  42.26 
 
 		 207 aa  125  1e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_4604  predicted protein  37.5 
 
 		 209 aa  125  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0142714  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14201  hypothetical protein  38.15 
 
 		 217 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432496 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0525  Methyltransferase type 11  36.53 
 
 		 237 aa  117  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10751  hypothetical protein  37.35 
 
 		 215 aa  116  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1031  hypothetical protein  41.33 
 
 		 217 aa  115  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0256527  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13601  hypothetical protein  35 
 
 		 212 aa  113  6e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13691  hypothetical protein  35.62 
 
 		 212 aa  113  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0487979  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13391  hypothetical protein  35.62 
 
 		 214 aa  112  9e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.417782  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10541  hypothetical protein  36.65 
 
 		 216 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.864146  hitchhiker  0.00665566 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0372  SAM-dependent methyltransferase  36.02 
 
 		 216 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.118814  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1268  hypothetical protein  33.12 
 
 		 212 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.391733  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_51541  methionine-dependent methyltransferase  23.27 
 
 		 214 aa  57  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  28.28 
 
 		 240 aa  57  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  29.01 
 
 		 237 aa  55.8  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1670  methyltransferase type 11  31.88 
 
 		 269 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1988  Methyltransferase type 11  31.88 
 
 		 269 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  50.94 
 
 		 281 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3941  methyltransferase type 11  44 
 
 		 237 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.16 
 
 		 238 aa  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  33.33 
 
 		 243 aa  52  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  31.71 
 
 		 243 aa  52  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  49.06 
 
 		 283 aa  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  32.06 
 
 		 199 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.16 
 
 		 236 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.36 
 
 		 258 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  31.93 
 
 		 213 aa  50.8  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  33.04 
 
 		 200 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  33.04 
 
 		 200 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  32.09 
 
 		 237 aa  51.2  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  38.37 
 
 		 275 aa  50.8  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  33.81 
 
 		 261 aa  50.4  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0011  methyltransferase type 11  32.09 
 
 		 289 aa  50.4  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  30.08 
 
 		 238 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4381  methyltransferase type 11  37.04 
 
 		 221 aa  50.1  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  36.25 
 
 		 225 aa  49.7  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  29.71 
 
 		 240 aa  49.7  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  28.46 
 
 		 255 aa  48.9  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1619  methyltransferase type 11  32.11 
 
 		 244 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4270  methyltransferase type 11  28.28 
 
 		 279 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  38.16 
 
 		 235 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  29.66 
 
 		 249 aa  48.9  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  29.33 
 
 		 237 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0842  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  42.37 
 
 		 235 aa  48.9  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3305  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  28.97 
 
 		 222 aa  47.8  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1103  methyltransferase type 11  29.52 
 
 		 237 aa  47.4  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292057  hitchhiker  0.000229506 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  34.09 
 
 		 634 aa  47.8  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1319  hypothetical protein  47.5 
 
 		 70 aa  47.8  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.051973 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0009  hypothetical protein  37.97 
 
 		 246 aa  47.4  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2320  Methyltransferase type 11  28.06 
 
 		 239 aa  47.4  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.46525  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1783  Methyltransferase type 11  31.88 
 
 		 258 aa  47  0.0006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4848  Methyltransferase type 11  29.31 
 
 		 241 aa  47  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0844  UbiE/COQ5 methyltransferase  44.07 
 
 		 269 aa  47  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  36.49 
 
 		 235 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  34.82 
 
 		 196 aa  46.6  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2007  methyltransferase type 11  29.06 
 
 		 239 aa  46.6  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 279 aa  46.6  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0996  Methyltransferase type 11  25 
 
 		 246 aa  46.6  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0746  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 254 aa  45.8  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0193664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1864  hypothetical protein  27.33 
 
 		 221 aa  45.8  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  41.94 
 
 		 258 aa  46.2  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2127  methyltransferase type 11  32.56 
 
 		 229 aa  46.2  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0382045  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 285 aa  46.2  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2546  hypothetical protein  47.37 
 
 		 280 aa  45.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.346853  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4344  Rhodanese domain protein  34.94 
 
 		 323 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.987797  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1127  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 246 aa  45.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0809  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 264 aa  45.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266836  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1510  hypothetical protein  43.75 
 
 		 247 aa  44.7  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.702399  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0405  methionine biosynthesis MetW  36.52 
 
 		 193 aa  44.3  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  24.39 
 
 		 243 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  25 
 
 		 870 aa  44.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5097  methyltransferase type 11  34.95 
 
 		 260 aa  44.7  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.3355 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1472  Methyltransferase type 11  28.03 
 
 		 242 aa  44.7  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6874  Methyltransferase type 11  42 
 
 		 260 aa  44.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.413969  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2810  Methyltransferase type 11  22.58 
 
 		 246 aa  44.7  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54366  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>