198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1483 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1483  hypothetical protein  100 
 
 		 237 aa  481  1e-135  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0453  hypothetical protein  31.53 
 
 		 239 aa  95.5  7e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.629046 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12698  hypothetical protein  29.25 
 
 		 405 aa  89  6e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  28.4 
 
 		 255 aa  84.7  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  29.2 
 
 		 402 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3394  hypothetical protein  27.64 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.689408  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  29.63 
 
 		 412 aa  75.9  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0227  hypothetical protein  25.91 
 
 		 257 aa  74.7  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1673  OsmC-like protein  30.99 
 
 		 409 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2450  hypothetical protein  29.88 
 
 		 258 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1840  hypothetical protein  29.8 
 
 		 405 aa  72  0.000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.949047 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3422  hydrolase-like protein  31.82 
 
 		 264 aa  71.2  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0226  hypothetical protein  25.51 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1777  OsmC-like protein  30.3 
 
 		 410 aa  70.1  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5429  OsmC family protein  28.02 
 
 		 397 aa  69.7  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1013  OsmC-like protein  29.13 
 
 		 423 aa  68.9  0.00000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.325781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  26.67 
 
 		 408 aa  68.9  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0234  alpha/beta hydrolase fold protein  31.2 
 
 		 256 aa  68.6  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.104073 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  26.21 
 
 		 259 aa  67.8  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1206  OsmC family protein  27.16 
 
 		 413 aa  67.4  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.423514  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  27.87 
 
 		 261 aa  67  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3247  putative redox protein  26.97 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.184697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1911  hydrolase of the alpha/beta superfamily protein  28.02 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0630248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0208  alpha/beta hydrolase  30.6 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2376  putative redox protein  27.75 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1200  putative redox protein  27.59 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000020196 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1127  putative redox protein  26.32 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2280  OsmC-like protein  30.2 
 
 		 406 aa  63.9  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  26.34 
 
 		 415 aa  63.9  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2852  alpha/beta hydrolase fold  39.52 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142259  normal  0.522222 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0049  OsmC family protein  29.17 
 
 		 406 aa  63.9  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2757  hypothetical protein  29.65 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.128442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3633  OsmC-like protein  31.56 
 
 		 406 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1835  OsmC-like protein  30.58 
 
 		 407 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1387  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.062595  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2694  OsmC-like protein  29.25 
 
 		 406 aa  61.6  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0941  OsmC family protein  28.51 
 
 		 409 aa  61.2  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.3755  normal  0.451532 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  36 
 
 		 292 aa  60.5  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2424  putative enzyme (3.4.-)  29.28 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2873  hypothetical protein  28.93 
 
 		 405 aa  60.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.326467  normal  0.0265941 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02426  predicted peptidase  29.55 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.643238  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04550  lysophospholipase  28.31 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3766  hypothetical protein  29.55 
 
 		 284 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2819  hypothetical protein  29.55 
 
 		 284 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000321727  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1143  putative enzyme  29.55 
 
 		 284 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2686  hypothetical protein  29.55 
 
 		 284 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00504077  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02390  hypothetical protein  29.55 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.555868  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3055  OsmC-like family protein  30.86 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5143  alpha/beta hydrolase fold protein  25.53 
 
 		 275 aa  58.5  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4230  hypothetical protein  28.57 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00845825 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  26.12 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2961  OsmC-like family protein  23.97 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0745233  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0403  OsmC family protein  30 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2687  hypothetical protein  28.74 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.441932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5147  hypothetical protein  29.02 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.252623 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2243  hypothetical protein  29.95 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2038  hypothetical protein  31.96 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.965886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0384  hypothetical protein  30.93 
 
 		 254 aa  57  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.72124  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0852  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  31.06 
 
 		 248 aa  57  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1667  hypothetical protein  24.59 
 
 		 311 aa  56.2  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000328892  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0804  hypothetical protein  29.31 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1134  putative enzyme  28 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3465  peptidase S15  34.13 
 
 		 317 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2909  hypothetical protein  28.98 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00394962  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1762  alpha/beta fold family hydrolase  28.02 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000326151  normal  0.089199 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3530  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  27.86 
 
 		 649 aa  55.5  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00138387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1199  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 290 aa  54.3  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2909  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  28.81 
 
 		 735 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.390736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1313  peptidase S15  24.07 
 
 		 294 aa  54.7  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0687  alpha/beta hydrolase fold  29.13 
 
 		 254 aa  54.7  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2294  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.44 
 
 		 776 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237204  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2331  hypothetical protein  27.5 
 
 		 305 aa  54.3  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.978321  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0956  hypothetical protein  30.63 
 
 		 249 aa  53.9  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.412658  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_002936  DET0149  alpha/beta fold family hydrolase  24.69 
 
 		 277 aa  53.1  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0187  hypothetical protein  25.91 
 
 		 257 aa  53.5  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1375  lysophospholipase  33.88 
 
 		 326 aa  53.1  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2579  hypothetical protein  27.64 
 
 		 345 aa  53.1  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.121751  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4266  putative hydrolase protein  29.07 
 
 		 274 aa  53.1  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0544  hypothetical protein  27.62 
 
 		 276 aa  52.8  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00193081  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0700  hypothetical protein  27.62 
 
 		 276 aa  52.8  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000140392  hitchhiker  0.000000000902529 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0670  hypothetical protein  27.97 
 
 		 257 aa  52.4  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3567  phospholipase/carboxylesterase  25 
 
 		 290 aa  52.4  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.486808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  25.5 
 
 		 258 aa  52.4  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4531  putative hydrolase protein  29.13 
 
 		 277 aa  52.4  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.213453 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0293  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase  24.27 
 
 		 321 aa  52  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.744416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5068  hypothetical protein  29.32 
 
 		 276 aa  52  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0775486  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0457  Lysophospholipase-like protein  25.31 
 
 		 274 aa  52.4  0.000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0702  hypothetical protein  26.79 
 
 		 294 aa  52.4  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00518069  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1252  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  30.46 
 
 		 294 aa  52  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.696042  normal  0.518884 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0819  hypothetical protein  26.76 
 
 		 253 aa  51.6  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0963  alpha/beta hydrolase fold protein  34 
 
 		 374 aa  51.6  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0623938  hitchhiker  0.00346396 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2092  hypothetical protein  28.9 
 
 		 275 aa  51.6  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_157  hydrolase, alpha/beta fold family  25.1 
 
 		 277 aa  51.6  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.379638  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0891  alpha/beta hydrolase fold  25.86 
 
 		 274 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0900  phospholipase/Carboxylesterase  28.33 
 
 		 306 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4740  hypothetical protein  28.84 
 
 		 252 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.268463  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2116  hypothetical protein  29 
 
 		 263 aa  50.8  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2788  hypothetical protein  27.01 
 
 		 292 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0282632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6443  OsmC family protein  29.26 
 
 		 408 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.588479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0222  acylglycerol lipase  24.28 
 
 		 277 aa  50.4  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>