More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1474 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  100 
 
 		 334 aa  691    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  38.58 
 
 		 345 aa  238  1e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  44.4 
 
 		 252 aa  177  3e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0039  nitroreductase  39.64 
 
 		 245 aa  159  4e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.499814  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0968  nitroreductase  27.8 
 
 		 273 aa  109  5e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000969197  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1590  nitroreductase  29.25 
 
 		 287 aa  99.8  7e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000230699  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0979  nitroreductase family protein  24.68 
 
 		 272 aa  99  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0228506  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1543  nitroreductase  28.97 
 
 		 274 aa  95.5  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000000268728  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0390  nitroreductase  26.52 
 
 		 274 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00534305  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  31.31 
 
 		 188 aa  94.4  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1688  nitroreductase  26.95 
 
 		 273 aa  92.4  9e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3391  nitroreductase  29.01 
 
 		 284 aa  91.3  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0601341 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1649  nitroreductase  25.71 
 
 		 274 aa  90.9  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3115  nitroreductase  25.5 
 
 		 274 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273584 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  29.86 
 
 		 202 aa  87.4  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  28.5 
 
 		 183 aa  87.4  3e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1641  nitroreductase  26.96 
 
 		 272 aa  87  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3021  nitroreductase family protein  25.28 
 
 		 262 aa  86.3  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2472  nitroreductase  26.5 
 
 		 272 aa  85.1  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.151442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2413  nitroreductase family protein  24.68 
 
 		 275 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1135  nitroreductase family protein  23.42 
 
 		 272 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000059926  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2624  nitroreductase  25.77 
 
 		 273 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.28949  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1845  nitroreductase  24.53 
 
 		 278 aa  84  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000200158  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1141  nitroreductase  29.34 
 
 		 263 aa  84  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.262211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  26.36 
 
 		 187 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1484  nitroreductase  24.7 
 
 		 295 aa  83.6  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.763778 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1631  nitroreductase  25.47 
 
 		 263 aa  82.8  0.000000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1838  nitroreductase  23.6 
 
 		 274 aa  82.8  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00713551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0432  hypothetical protein  24.37 
 
 		 265 aa  82.8  0.000000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0528  nitroreductase family protein  23.2 
 
 		 274 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0687509  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0625  nitroreductase  24.6 
 
 		 279 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0497203  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  28.24 
 
 		 191 aa  77.8  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2365  nitroreductase  23.51 
 
 		 273 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  31.02 
 
 		 169 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0777  nitroreductase  22.86 
 
 		 275 aa  75.5  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0136069  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3737  NADH dehydrogenase  30.43 
 
 		 221 aa  75.1  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  26.01 
 
 		 194 aa  75.1  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0454  nitroreductase  24.68 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00612332  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0500  ferredoxin-nitroreductase protein  27.98 
 
 		 277 aa  73.9  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26390  nitroreductase  27.4 
 
 		 174 aa  73.9  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0345  nitroreductase  28.1 
 
 		 228 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196416  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0660  nitroreductase  27.31 
 
 		 189 aa  73.6  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0886  hypothetical protein  23.85 
 
 		 303 aa  73.2  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2908  nitroreductase  28.82 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0453  nitroreductase  25 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  33.95 
 
 		 176 aa  72  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  30.19 
 
 		 174 aa  72  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  27.88 
 
 		 190 aa  72.4  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  30.65 
 
 		 173 aa  72  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  32.16 
 
 		 184 aa  72  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1490  nitroreductase  24.77 
 
 		 275 aa  71.2  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.628384  normal  0.490077 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  26.73 
 
 		 169 aa  70.9  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  24.88 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3287  nitroreductase  24.46 
 
 		 273 aa  69.3  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.954102 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  26.42 
 
 		 167 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1856  nitroreductase  28.05 
 
 		 350 aa  68.9  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1055  nitroreductase  25.87 
 
 		 192 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  30.81 
 
 		 196 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  31.53 
 
 		 190 aa  68.2  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  29.81 
 
 		 186 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2980  nitroreductase  27.62 
 
 		 189 aa  68.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1938  nitroreductase  25.59 
 
 		 235 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.255877  hitchhiker  0.00446173 
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  27.75 
 
 		 183 aa  67.4  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0015  nitroreductase  25 
 
 		 272 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  29.65 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1140  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.45 
 
 		 269 aa  67  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0290509  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3631  nitroreductase  29.58 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3352  nitroreductase  26.7 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1266  nitroreductase  27.11 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4125  nitroreductase  24.39 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  30 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0573  nitroreductase family protein  26.79 
 
 		 228 aa  65.5  0.000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4912  nitroreductase  29.44 
 
 		 247 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1401  nitroreductase family protein  29.69 
 
 		 368 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000248129  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0390  nitroreductase  27.71 
 
 		 278 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.36041  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1608  oxidoreductase protein  26.59 
 
 		 235 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000515625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18390  nitroreductase  24.84 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.281647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0586  hypothetical protein  25 
 
 		 188 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0626117  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  25.12 
 
 		 185 aa  64.7  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  30.49 
 
 		 184 aa  65.1  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1610  nitroreductase  26.59 
 
 		 235 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367755  normal  0.918275 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47250  Nitroreductase  29.65 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  32.93 
 
 		 174 aa  63.9  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2246  nitroreductase  27.98 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  33.95 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3222  nitroreductase family protein  29.61 
 
 		 411 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00153701  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  26.54 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0862  nitroreductase family protein  29.61 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00254558  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2051  nitroreductase family protein  29.61 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000565957  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2694  nitroreductase family protein  29.61 
 
 		 351 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.990195  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3169  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.61 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00240689  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3208  nitroreductase family protein  29.61 
 
 		 394 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1740  nitroreductase  23.99 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.326694  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  26.54 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1203  nitroreductase  28 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000186245  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  27.38 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5732  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.64 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0348  ferredoxin  22.8 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1615  nitroreductase  25.78 
 
 		 257 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00251246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2325  nitroreductase  26.92 
 
 		 234 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  0.241368 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>