More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1467 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1467  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
297 aa  610  9.999999999999999e-175  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.28 
 
 
304 aa  278  9e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.14574  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0532  domain of unknown function DUF1731  46.76 
 
 
304 aa  259  3e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3578  domain of unknown function DUF1731  42.05 
 
 
307 aa  252  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2535  domain of unknown function DUF1731  42.05 
 
 
307 aa  252  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0459  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.16 
 
 
321 aa  240  2e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3700  hypothetical protein  44.78 
 
 
299 aa  237  1e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0206  hypothetical protein  41.58 
 
 
306 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.886073  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1325  domain of unknown function DUF1731  42.57 
 
 
302 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.492061  normal  0.369891 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4903  domain of unknown function DUF1731  43.14 
 
 
314 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.810093  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1261  domain of unknown function DUF1731  41.04 
 
 
302 aa  233  3e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179162  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4516  domain of unknown function DUF1731  41.39 
 
 
307 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0231327 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0724  hypothetical protein  41.86 
 
 
297 aa  231  1e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00362096  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4780  hypothetical protein  40.73 
 
 
306 aa  230  2e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1751  hypothetical protein  42.43 
 
 
311 aa  230  3e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.888541  normal  0.757585 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3322  hypothetical protein  41.55 
 
 
304 aa  228  7e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00834384  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1739  domain of unknown function DUF1731  41.06 
 
 
306 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.599325  normal  0.399114 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1432  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  41.22 
 
 
302 aa  223  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000441102  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1542  hypothetical protein  41.22 
 
 
302 aa  223  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.450686  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0349  hypothetical protein  41.22 
 
 
302 aa  223  3e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000136273  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2388  hypothetical protein  40.34 
 
 
297 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.926114  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2579  hypothetical protein  42.57 
 
 
297 aa  222  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2700  hypothetical protein  42.57 
 
 
297 aa  222  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.473742  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2491  hypothetical protein  42.57 
 
 
297 aa  222  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.133788  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2591  hypothetical protein  42.57 
 
 
297 aa  222  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2537  hypothetical protein  42.57 
 
 
297 aa  222  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.158224  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0055  hypothetical protein  40.92 
 
 
298 aa  221  9e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2118  hypothetical protein  40.4 
 
 
310 aa  221  9e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0496  cell division inhibitor-like protein  38 
 
 
301 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0084  domain of unknown function DUF1731  40.46 
 
 
313 aa  221  9.999999999999999e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01351  putative cell division inhibitor  37.79 
 
 
310 aa  220  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.366171 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0486  cell division inhibitor-like protein  38 
 
 
301 aa  220  3e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0515  cell division inhibitor-like protein  38 
 
 
301 aa  220  3e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0429  epimerase, NAD dependent epimerase family protein  37.67 
 
 
301 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1380  domain of unknown function DUF1731  41.02 
 
 
302 aa  219  6e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.189159  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2477  hypothetical protein  41.22 
 
 
298 aa  218  7.999999999999999e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.775796  hitchhiker  0.0000277687 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2454  NAD-binding domain-containing protein  39.8 
 
 
297 aa  218  1e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000318682  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02229  conserved protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  39.8 
 
 
297 aa  217  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.210862  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1352  domain of unknown function DUF1731  39.8 
 
 
297 aa  217  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0231042  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1348  hypothetical protein  39.8 
 
 
297 aa  217  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.303624  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2460  NAD-binding domain-containing protein  40.13 
 
 
297 aa  217  2e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.040859  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02189  hypothetical protein  39.8 
 
 
297 aa  217  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.257838  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0425  epimerase, NAD dependent epimerase family protein  37.25 
 
 
301 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0432  hypothetical protein  39.26 
 
 
301 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1477  domain of unknown function DUF1731  40.33 
 
 
301 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0135189  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3948  hypothetical protein  37.62 
 
 
307 aa  216  4e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.750895  normal  0.0776826 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2598  NAD-binding domain-containing protein  39.47 
 
 
297 aa  216  4e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00110077  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0571  cell division inhibitor-like protein  37.33 
 
 
301 aa  216  5e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0496  hypothetical protein  40.07 
 
 
300 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2786  domain of unknown function DUF1731  40.47 
 
 
301 aa  215  9e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00697723  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2680  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  39.14 
 
 
297 aa  215  9e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0182151  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0570  cell division inhibitor-like protein  37 
 
 
301 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3444  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  39.14 
 
 
297 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0131327  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2853  hypothetical protein  39.67 
 
 
297 aa  212  7e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.257081 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38921  predicted protein  39.33 
 
 
373 aa  212  7e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.71449  normal  0.0770912 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2564  domain of unknown function DUF1731  39.66 
 
 
301 aa  211  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0342272  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0091  domain of unknown function DUF1731  40.26 
 
 
313 aa  210  2e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1851  hypothetical protein  39.23 
 
 
289 aa  209  4e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3645  domain of unknown function DUF1731  40.28 
 
 
298 aa  209  4e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0251  cell division inhibitor  38.93 
 
 
298 aa  209  5e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.451616  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4805  cell division inhibitor-like protein  37.25 
 
 
301 aa  208  8e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0383251  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.47 
 
 
301 aa  208  8e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0004  hypothetical protein  39.4 
 
 
313 aa  208  1e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0518  cell division inhibitor-like protein  36.58 
 
 
301 aa  207  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.87387  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2911  hypothetical protein  38.93 
 
 
297 aa  208  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0087  hypothetical protein  39.34 
 
 
313 aa  207  2e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.81 
 
 
301 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2675  hypothetical protein  41.25 
 
 
313 aa  206  3e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.422838  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1548  hypothetical protein  41.22 
 
 
296 aa  206  4e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.07586  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0221  hypothetical protein  38.59 
 
 
298 aa  205  6e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1483  hypothetical protein  41.22 
 
 
296 aa  205  7e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.274067  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1542  hypothetical protein  41.22 
 
 
296 aa  205  8e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.582377  normal  0.132975 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1333  domain of unknown function DUF1731  38.93 
 
 
305 aa  203  3e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0501  rcp protein  38.26 
 
 
304 aa  202  4e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3066  hypothetical protein  40.6 
 
 
462 aa  202  4e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000836111  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0934  hypothetical protein  40.47 
 
 
299 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.209626  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0966  hypothetical protein  39.73 
 
 
300 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4731  hypothetical protein  41.95 
 
 
300 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.083887  normal  0.818487 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0126  domain of unknown function DUF1731  39.27 
 
 
312 aa  200  1.9999999999999998e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0187314  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0330  hypothetical protein  38.64 
 
 
309 aa  200  3e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3614  sugar nucleotide epimerase  37.92 
 
 
300 aa  200  3e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0438  hypothetical protein  37.33 
 
 
299 aa  199  3.9999999999999996e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2922  hypothetical protein  39.19 
 
 
296 aa  199  5e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0468  hypothetical protein  43.05 
 
 
298 aa  199  5e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.403609  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2865  domain of unknown function DUF1731  41.2 
 
 
302 aa  199  6e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0806  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  37.54 
 
 
301 aa  199  6e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61590  hypothetical protein  40.48 
 
 
305 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.138504 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1663  hypothetical protein  38.61 
 
 
301 aa  198  9e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00364793  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1127  hypothetical protein  39.06 
 
 
300 aa  198  9e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2912  domain of unknown function DUF1731  39.8 
 
 
313 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0344654  normal  0.208799 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0103  domain of unknown function DUF1731  37.95 
 
 
312 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2704  hypothetical protein  37.63 
 
 
297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.148152  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2243  hypothetical protein  41.08 
 
 
309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000861994  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12244  hypothetical protein  41.16 
 
 
301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.257809  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2780  hypothetical protein  37.63 
 
 
297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.346145  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3719  domain of unknown function DUF1731  38.31 
 
 
304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2559  hypothetical protein  36.67 
 
 
299 aa  196  3e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2683  hypothetical protein  37.63 
 
 
297 aa  196  3e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.126988  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3580  hypothetical protein  40.82 
 
 
305 aa  196  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222015  normal  0.0797642 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1683  domain of unknown function DUF1731  37.63 
 
 
297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0603665  normal  0.0256156 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>