More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1419 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1419  electron transfer flavoprotein alpha subunit  100 
 
 
320 aa  637    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00843459  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2265  electron transfer flavoprotein subunit alpha  62.7 
 
 
322 aa  414  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0896895  hitchhiker  0.0000142262 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0463  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  52.81 
 
 
332 aa  348  5e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3700  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.17 
 
 
327 aa  187  3e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0768904  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3332  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.8 
 
 
317 aa  186  4e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3825  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.88 
 
 
317 aa  182  8.000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.194441  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1388  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.64 
 
 
317 aa  176  3e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2262  electron transfer flavoprotein subunit alpha  36.83 
 
 
301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0143745  hitchhiker  0.000000546266 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1269  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.09 
 
 
316 aa  171  1e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.877633 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1602  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.37 
 
 
304 aa  170  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.679429  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1470  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.08 
 
 
302 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0970  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.26 
 
 
316 aa  166  5e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2783  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.41 
 
 
302 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2796  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  31.08 
 
 
340 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1078  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  33.54 
 
 
335 aa  165  1.0000000000000001e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.224584 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1384  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.43 
 
 
305 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0386  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.99 
 
 
315 aa  162  5.0000000000000005e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0684  electron transfer flavoprotein subunit alpha  31.1 
 
 
443 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0329544  normal  0.845757 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2829  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.08 
 
 
305 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2415  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  31.19 
 
 
441 aa  162  9e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5956  electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.99 
 
 
316 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.149032 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2066  electron transfer flavoprotein subunit alpha  32.62 
 
 
448 aa  160  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2520  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  31.94 
 
 
304 aa  160  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1590  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.44 
 
 
327 aa  159  7e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1358  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  30.25 
 
 
452 aa  159  8e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1354  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.75 
 
 
334 aa  158  1e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00167442  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0163  electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.13 
 
 
317 aa  157  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0921  electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.37 
 
 
323 aa  157  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.541285 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2927  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  30.49 
 
 
452 aa  156  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0720  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  34.73 
 
 
316 aa  156  4e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0900083  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2786  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  32.31 
 
 
447 aa  156  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0654  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  33.1 
 
 
317 aa  154  1e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.480174  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1544  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  31.1 
 
 
339 aa  154  2e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1712  electron transfer flavoprotein subunit alpha  34.6 
 
 
304 aa  154  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.817831 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1467  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  31.48 
 
 
447 aa  154  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2132  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  31.08 
 
 
436 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000989021 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4639  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  31.4 
 
 
325 aa  151  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0785631 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2715  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  30.03 
 
 
439 aa  151  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777462 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2086  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  32 
 
 
436 aa  151  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2257  electron transfer flavoprotein subunit alpha  29.45 
 
 
442 aa  151  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00336089  hitchhiker  0.0000000000804212 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1699  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  29.91 
 
 
326 aa  151  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.440081  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1501  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  29.72 
 
 
442 aa  150  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1212  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  30.77 
 
 
441 aa  150  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.72306  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3037  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.24 
 
 
305 aa  149  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1779  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  31.29 
 
 
325 aa  149  7e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06699  electron transfer flavoprotein alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05470)  37.58 
 
 
349 aa  148  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.76668 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1857  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.64 
 
 
330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.519797  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0571  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  30.46 
 
 
443 aa  147  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.871139  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1607  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  27.95 
 
 
399 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00997  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  34.08 
 
 
308 aa  146  4.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.325031  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0583  electron transfer flavoprotein alpha subunit  30.67 
 
 
341 aa  146  5e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2775  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  31.38 
 
 
428 aa  145  9e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00380307  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1836  electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.09 
 
 
325 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0730508  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0065  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.94 
 
 
320 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.777154  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0053  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.71 
 
 
320 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2582  3-hydroxybutyryl-CoA dehydrogenase  27.95 
 
 
335 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2284  3-hydroxybutyryl-CoA dehydrogenase  27.95 
 
 
335 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.383741  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1990  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.01 
 
 
311 aa  144  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3195  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  33.94 
 
 
309 aa  143  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.234178  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1879  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  29.81 
 
 
410 aa  143  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.281207  normal  0.354147 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2625  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  31.9 
 
 
325 aa  142  6e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000950552  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0831  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  31.97 
 
 
325 aa  142  7e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2364  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  33.66 
 
 
309 aa  142  8e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0059  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  31.17 
 
 
341 aa  141  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122913 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1607  electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.01 
 
 
313 aa  141  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0655  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  34.11 
 
 
309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.304729  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0304  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  27.58 
 
 
397 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2949  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.58 
 
 
303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0309  electron transfer flavoprotein, alpha subunit/FixB family protein  27.33 
 
 
397 aa  140  3e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1373  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  27.64 
 
 
399 aa  140  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.255821  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0457  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  32.71 
 
 
310 aa  140  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.196696  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3168  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  32.71 
 
 
310 aa  140  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.929742  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1316  electron transfer flavoprotein alpha subunit  27.81 
 
 
401 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2916  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  31.83 
 
 
318 aa  139  3.9999999999999997e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.113103  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0050  electron transfer flavoprotein alpha and beta subunits  32.62 
 
 
320 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.69565 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0411  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  32.76 
 
 
325 aa  139  6e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3647  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  30.53 
 
 
329 aa  139  7e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0179  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  33.44 
 
 
309 aa  139  7e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0131  electron transfer flavoprotein alpha subunit  27.53 
 
 
333 aa  139  7e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7803  electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.85 
 
 
309 aa  139  7e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1248  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  27.78 
 
 
601 aa  139  7.999999999999999e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0635  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  29.23 
 
 
610 aa  139  8.999999999999999e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3535  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0755  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  30.87 
 
 
300 aa  139  8.999999999999999e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.714567 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2152  electron transfer flavoprotein subunit alpha  33.01 
 
 
302 aa  138  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000659142  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1075  electron transfer flavoprotein alpha subunit  31.08 
 
 
320 aa  138  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4634  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  31.31 
 
 
325 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0476  electron transfer flavoprotein alpha subunit  30.49 
 
 
350 aa  137  2e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000000313809  decreased coverage  0.000297308 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4418  electron transfer flavoprotein subunit alpha  31.31 
 
 
325 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4257  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  31.31 
 
 
325 aa  137  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4759  electron transfer flavoprotein subunit alpha  31.31 
 
 
325 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0049  electron transfer flavoprotein alpha and beta subunits  34.31 
 
 
321 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2557  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.83 
 
 
308 aa  138  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0605  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  31.31 
 
 
325 aa  138  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05549  acyl-CoA dehydrogenase, short-chain specific  33.11 
 
 
321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2186  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  33.23 
 
 
309 aa  136  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0697  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  31.08 
 
 
317 aa  136  4e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4350  electron transfer flavoprotein alpha subunit  31.76 
 
 
325 aa  136  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.233822  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1751  electron transfer flavoprotein alpha subunit  31.65 
 
 
311 aa  136  5e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0899131 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1334  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.63 
 
 
303 aa  136  5e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4650  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  30.99 
 
 
325 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>