218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1370 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1370  cation transporter  100 
 
 
479 aa  955    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804508  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  43.06 
 
 
481 aa  374  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2029  K+ transporter Trk  41.16 
 
 
481 aa  348  1e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00911384  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  39.5 
 
 
479 aa  346  6e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000731748  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  42.89 
 
 
494 aa  331  1e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3217  TrkH family potassium uptake protein  39.49 
 
 
482 aa  327  4.0000000000000003e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1309  K+ transporter Trk  37.53 
 
 
479 aa  326  5e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1063  K+ transporter Trk  36.65 
 
 
478 aa  325  8.000000000000001e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1969  potassium uptake protein, TrkH family  40.54 
 
 
482 aa  323  3e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.938293  normal  0.091936 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5095  cation transporter  37.83 
 
 
491 aa  319  6e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0265  cation transporter  37.76 
 
 
466 aa  306  7e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3423  trk system potassium uptake protein  37.98 
 
 
476 aa  302  9e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3429  sodium transport protein  37.44 
 
 
483 aa  300  4e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000905163  normal  0.144349 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1468  cation transporter  40.33 
 
 
483 aa  296  5e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10610  cation transporter  36.96 
 
 
477 aa  295  1e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0386774  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0913  K+ transporter trk  37.21 
 
 
482 aa  294  2e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3184  cation transporter  34.86 
 
 
483 aa  293  4e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0747652  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12238  putative potassium uptake protein  36.25 
 
 
498 aa  293  4e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.590421  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0088  Trk system potassium uptake protein TrkH  36.41 
 
 
480 aa  290  5.0000000000000004e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3505  cation transporter  37.97 
 
 
485 aa  289  6e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2219  potassium uptake protein TrkH  37.21 
 
 
487 aa  288  1e-76  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000665433 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0186  K+ transporter Trk  36.89 
 
 
483 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.568155  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  35.88 
 
 
482 aa  281  2e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0202  potassium uptake protein, TrkH family  37.07 
 
 
483 aa  280  4e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0485488  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00018  Trk system potassium uptake protein TrkH  34.7 
 
 
483 aa  280  5e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0021  trk system potassium uptake membrane protein TrkH  35.39 
 
 
488 aa  276  6e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0016  potassium uptake protein TrkH  36.96 
 
 
483 aa  276  8e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2905  cation transporter  38.84 
 
 
485 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.313942  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2041  TrkH family potassium uptake protein  34.03 
 
 
485 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.505265  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4081  cation transporter  37.29 
 
 
491 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0087  cation transporter  34.64 
 
 
485 aa  273  6e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0107  cation transporter  34.98 
 
 
485 aa  271  1e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3593  K+ transporter Trk  35.46 
 
 
484 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0183365  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  35.99 
 
 
483 aa  271  2e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0518  cation transporter  33.76 
 
 
524 aa  270  4e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.608027  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1801  potassium uptake protein TrkH  35.22 
 
 
484 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641993  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4013  cation transporter  36.45 
 
 
484 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.398378  hitchhiker  0.000106015 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4507  TrkH family potassium uptake protein  36.21 
 
 
484 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0017  potassium uptake protein TrkH  38.63 
 
 
482 aa  265  2e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000733585  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0018  K+ transporter Trk  36.86 
 
 
485 aa  264  2e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2078  potassium uptake protein, TrkH family  36.62 
 
 
483 aa  265  2e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1479  K+ transporter Trk  35.51 
 
 
484 aa  264  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0756741  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1404  TrkH family potassium uptake protein  36.45 
 
 
484 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0143112  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0022  trk system potassium uptake membrane protein  34.68 
 
 
485 aa  263  4e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.78231  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0035  TrkH family potassium uptake protein  34.76 
 
 
485 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161257  normal  0.16596 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0026  TrkH family potassium uptake protein  34.89 
 
 
485 aa  261  1e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0293301  normal  0.0416133 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3898  potassium transporter  38.11 
 
 
483 aa  262  1e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000274395  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0015  Trk system potassium uptake protein TrkH  37.3 
 
 
483 aa  261  2e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0024  potassium uptake protein TrkH  36.85 
 
 
486 aa  261  2e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3796  TrkH family potassium uptake protein  36.45 
 
 
484 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000285199 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0654  TrkH family potassium uptake protein  35.15 
 
 
481 aa  261  2e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.77805  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0016  TrkH family potassium uptake protein  36.45 
 
 
485 aa  258  2e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.917288  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_28  cation transport protein, Trk system  35.33 
 
 
481 aa  257  3e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0028  cation transporter  35.33 
 
 
481 aa  256  5e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0029  Trk system potassium uptake protein, putative  35.12 
 
 
481 aa  256  8e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.725548  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0021  TrkH family potassium uptake protein  37.06 
 
 
485 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000191681  hitchhiker  0.00118285 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0019  TrkH family potassium uptake protein  37.06 
 
 
485 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000172617  normal  0.0765099 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0016  potassium uptake protein, TrkH family protein  35.31 
 
 
485 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.339355  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0027  TrkH family potassium uptake protein  37.06 
 
 
485 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0260602  hitchhiker  0.0000000366479 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2266  potassium uptake protein, TrkH family  38.93 
 
 
484 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.644044  normal  0.0494123 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0021  TrkH family potassium uptake protein  33.61 
 
 
485 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1567  TrkH family potassium uptake protein  34.92 
 
 
484 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.120184 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0265  potassium transporter  38.19 
 
 
483 aa  254  2.0000000000000002e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00329538  normal  0.0155167 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2976  Trk system potassium uptake protein TrkH  36.48 
 
 
485 aa  254  2.0000000000000002e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0023  TrkH family potassium uptake protein  36.47 
 
 
485 aa  254  3e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.211854  normal  0.0148489 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0019  TrkH family potassium uptake protein  36.47 
 
 
485 aa  254  3e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.195703  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0024  TrkH family potassium uptake protein  36.47 
 
 
485 aa  254  3e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0989593  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0023  potassium uptake protein, TrkH family  36.47 
 
 
485 aa  254  3e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000299675 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0022  TrkH family potassium uptake protein  33.87 
 
 
485 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00747974  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3436  cation transporter  36.97 
 
 
478 aa  252  1e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0024  TrkH family potassium uptake protein  35.45 
 
 
485 aa  251  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.981015  normal  0.0103181 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3946  potassium transporter  37.76 
 
 
483 aa  251  2e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000895633  decreased coverage  0.00222416 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3953  TrkH family potassium uptake protein  36.07 
 
 
484 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1208  cation transporter  36.06 
 
 
512 aa  248  2e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.432956  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0286  potassium transporter  38.04 
 
 
483 aa  247  3e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000018042  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4193  potassium transporter  37.14 
 
 
483 aa  247  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000606727  normal  0.556467 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4265  potassium transporter  37.14 
 
 
483 aa  247  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0305009  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4312  potassium transporter  37.14 
 
 
483 aa  247  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0637309  normal  0.15299 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4216  potassium transporter  37.14 
 
 
483 aa  247  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000196268  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4372  potassium transporter  37.14 
 
 
483 aa  247  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0170672  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3744  potassium transporter  37.58 
 
 
483 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000338344  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4231  potassium transporter  36.96 
 
 
483 aa  246  6e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00335322  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1869  cation transporter  34.16 
 
 
484 aa  246  6e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.130982 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4041  potassium transporter  36.96 
 
 
483 aa  246  6.999999999999999e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.011777  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3930  potassium transporter  37.83 
 
 
483 aa  246  8e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000159691  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1915  potassium transporter  37.83 
 
 
483 aa  246  8e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000278342  normal  0.154047 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1398  cation transporter  33.65 
 
 
485 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000271372  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1935  cation transporter  34.52 
 
 
482 aa  245  9.999999999999999e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.27929 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5998  cation transporter  34.5 
 
 
488 aa  244  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443617 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2536  potassium uptake protein TrkH  36.68 
 
 
485 aa  244  1.9999999999999999e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000177354  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03740  potassium transporter  37.09 
 
 
483 aa  244  3e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0315647  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4132  potassium uptake protein, TrkH family  37.09 
 
 
483 aa  244  3e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000031848  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4161  potassium transporter  37.09 
 
 
483 aa  244  3e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00100489  decreased coverage  0.00000337879 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4319  potassium transporter  37.09 
 
 
483 aa  244  3e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000419761  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5288  potassium transporter  37.09 
 
 
483 aa  244  3e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000758223  normal  0.0471596 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4368  potassium transporter  37.09 
 
 
483 aa  244  3e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000385721  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03689  hypothetical protein  37.09 
 
 
483 aa  244  3e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.025775  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4072  potassium transporter  37.09 
 
 
483 aa  244  3e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258715  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22690  potassium uptake protein TrkH  34.99 
 
 
484 aa  243  5e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0159023 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0490  cation transporter  33.81 
 
 
485 aa  243  6e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>