117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1353 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1353  hypothetical protein  100 
 
 
427 aa  830    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000251364  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0315  protein of unknown function DUF81  65.94 
 
 
415 aa  534  1e-150  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24542  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1425  hypothetical protein  57.52 
 
 
426 aa  479  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0163769  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1427  hypothetical protein  58.23 
 
 
428 aa  464  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000425148  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3160  protein of unknown function DUF81  56.63 
 
 
443 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1984  protein of unknown function DUF81  55.56 
 
 
415 aa  433  1e-120  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0357  protein of unknown function DUF81  56.24 
 
 
420 aa  425  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.968564  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0644  hypothetical protein  56.1 
 
 
417 aa  424  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2833  hypothetical protein  60.1 
 
 
415 aa  424  1e-117  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.260143  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1799  protein of unknown function DUF81  30.36 
 
 
356 aa  139  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2673  protein of unknown function DUF81  30.55 
 
 
349 aa  130  6e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.970315  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2103  protein of unknown function DUF81  31.51 
 
 
352 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2613  hypothetical protein  29.57 
 
 
361 aa  124  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.303309 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0095  hypothetical protein  31.4 
 
 
356 aa  124  3e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.571557  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1011  protein of unknown function DUF81  31.89 
 
 
362 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0652909 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1975  hypothetical protein  32.86 
 
 
394 aa  116  7.999999999999999e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000141125  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1512  hypothetical protein  29.56 
 
 
360 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.864681  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4296  protein of unknown function DUF81  30.04 
 
 
346 aa  113  6e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  31.67 
 
 
305 aa  113  7.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  31.67 
 
 
296 aa  112  9e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  31.38 
 
 
307 aa  109  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  29.74 
 
 
307 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0264  protein of unknown function DUF81  29.96 
 
 
345 aa  107  4e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  29.37 
 
 
307 aa  106  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0285  protein of unknown function DUF81  30.57 
 
 
350 aa  105  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0253252 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  30 
 
 
306 aa  102  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1641  protein of unknown function DUF81  30.38 
 
 
354 aa  102  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.407514  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  29.06 
 
 
308 aa  101  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  31.65 
 
 
303 aa  99.4  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0703  protein of unknown function DUF81  30.69 
 
 
312 aa  97.1  6e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.619223 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2100  hypothetical protein  32.86 
 
 
307 aa  95.5  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2342  protein of unknown function DUF81  29.17 
 
 
350 aa  96.3  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  30.74 
 
 
307 aa  95.5  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0602  hypothetical protein  27.44 
 
 
307 aa  95.5  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.116643  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  30.48 
 
 
310 aa  94.7  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0626  hypothetical protein  29.01 
 
 
356 aa  94  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0638  hypothetical protein  30.22 
 
 
355 aa  92.8  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.328833  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  28.97 
 
 
306 aa  92  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  27.99 
 
 
305 aa  91.3  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2818  hypothetical protein  28.41 
 
 
350 aa  91.3  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  28.57 
 
 
306 aa  90.1  6e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1032  protein of unknown function DUF81  29.62 
 
 
329 aa  87.4  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1316  hypothetical protein  28.9 
 
 
339 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.919916  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  28.11 
 
 
315 aa  84.7  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0741  hypothetical protein  26.89 
 
 
308 aa  83.2  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.610206  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2287  hypothetical protein  29.15 
 
 
306 aa  83.2  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0881  protein of unknown function DUF81  27.55 
 
 
320 aa  83.2  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0529  protein of unknown function DUF81  30.91 
 
 
301 aa  82.8  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.639681  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0184  hypothetical protein  27.64 
 
 
343 aa  81.3  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.249656  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0823  hypothetical protein  27.64 
 
 
316 aa  80.9  0.00000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.580669  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0772  hypothetical protein  27.24 
 
 
316 aa  79.7  0.00000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000254854  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3098  hypothetical protein  31.08 
 
 
330 aa  79.3  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.075635  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4610  hypothetical protein  27.41 
 
 
307 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427893  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4256  protein of unknown function DUF81  28.41 
 
 
330 aa  78.6  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0800  hypothetical protein  27.55 
 
 
307 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.979856  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3547  hypothetical protein  28.71 
 
 
304 aa  77  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  26 
 
 
309 aa  74.7  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4039  hypothetical protein  26.42 
 
 
306 aa  74.3  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.995552  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2642  hypothetical protein  27.44 
 
 
304 aa  73.6  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2732  hypothetical protein  26.64 
 
 
307 aa  72  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.990455  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3097  hypothetical protein  27.68 
 
 
307 aa  70.9  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0521383  normal  0.0206179 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0807  putative permease  26.79 
 
 
308 aa  70.1  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0899504 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1793  protein of unknown function DUF81  26.88 
 
 
348 aa  62.4  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3721  protein of unknown function DUF81  25.51 
 
 
346 aa  62.4  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.766072  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2487  hypothetical protein  28.89 
 
 
307 aa  61.2  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.741718 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1044  protein of unknown function DUF81  26.88 
 
 
349 aa  60.8  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.161703  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5288  protein of unknown function DUF81  28.3 
 
 
307 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000586578  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3729  hypothetical protein  25.85 
 
 
261 aa  59.7  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0245  hypothetical protein  28.36 
 
 
308 aa  57.8  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.176673  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0240  hypothetical protein  25.86 
 
 
313 aa  57  0.0000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0364801  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  26.48 
 
 
300 aa  53.9  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  34.88 
 
 
2798 aa  53.1  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1504  hypothetical protein  25.94 
 
 
255 aa  52.8  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00278101  normal  0.358981 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1334  hypothetical protein  35.96 
 
 
266 aa  50.1  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00153027  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  37.5 
 
 
266 aa  50.1  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1613  hypothetical protein  35.96 
 
 
266 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1575  hypothetical protein  35.96 
 
 
266 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.02028  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1360  hypothetical protein  35.96 
 
 
266 aa  50.1  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183653  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3838  hypothetical protein  31.67 
 
 
266 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0242257  hitchhiker  0.000000000114081 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1333  hypothetical protein  35.96 
 
 
262 aa  50.1  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105686  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1470  hypothetical protein  35.96 
 
 
262 aa  49.7  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1507  hypothetical protein  35.96 
 
 
266 aa  50.1  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131683  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1375  hypothetical protein  35.96 
 
 
266 aa  49.3  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1543  hypothetical protein  35.96 
 
 
139 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000133691 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0286  protein of unknown function DUF81  33.33 
 
 
254 aa  47.8  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1020  protein of unknown function DUF81  24.2 
 
 
325 aa  48.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.470827  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01140  predicted permease  33.86 
 
 
302 aa  47.8  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3045  protein of unknown function DUF81  39.51 
 
 
302 aa  47.8  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4544  hypothetical protein  26.79 
 
 
266 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0413667  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0031  permease  23.9 
 
 
257 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  32.08 
 
 
293 aa  46.6  0.0008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1540  hypothetical protein  41.18 
 
 
305 aa  46.6  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.472601 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00380  predicted permease  27.65 
 
 
277 aa  46.6  0.0009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4222  hypothetical protein  32.35 
 
 
261 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  26.26 
 
 
255 aa  46.2  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1875  hypothetical protein  28.57 
 
 
261 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0071  hypothetical protein  23.64 
 
 
251 aa  45.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0073  hypothetical protein  23.64 
 
 
251 aa  45.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  30.88 
 
 
267 aa  45.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1329  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF81 domain protein)  25 
 
 
259 aa  45.1  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.520044  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>