More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1347 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1347  response regulator receiver protein  100 
 
 		 688 aa  1391    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1697  anion transporter  30.34 
 
 		 452 aa  184  5.0000000000000004e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000215877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1343  sodium/sulphate symporter  33.47 
 
 		 618 aa  177  7e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0235  anion transporter  30.47 
 
 		 446 aa  151  4e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000069628  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22320  anion transporter  28.5 
 
 		 459 aa  123  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1359  anion transporter  29.67 
 
 		 534 aa  123  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3936  anion transporter  27.34 
 
 		 482 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603046  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2485  anion transporter  24.79 
 
 		 483 aa  110  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3967  anion transporter  25.22 
 
 		 475 aa  110  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1988  anion transporter  27.32 
 
 		 482 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.241159  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2574  anion transporter  28.73 
 
 		 534 aa  106  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2619  anion transporter  28.73 
 
 		 534 aa  106  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.243228  normal  0.988073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2613  anion transporter  28.8 
 
 		 534 aa  105  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0828231  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1734  anion transporter  24.26 
 
 		 483 aa  103  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2857  Sodium/sulphate symporter  23.9 
 
 		 482 aa  103  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00834763  hitchhiker  0.0000150124 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1357  response regulator receiver protein  42.06 
 
 		 144 aa  103  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3834  anion transporter  27.18 
 
 		 466 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0427  anion transporter  27.18 
 
 		 466 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2663  anion transporter  26.39 
 
 		 464 aa  102  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.392129  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3907  anion transporter  27.18 
 
 		 466 aa  101  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0326  transmembrane transport proteins-like  24.62 
 
 		 491 aa  101  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.677741  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4030  anion transporter  27.18 
 
 		 466 aa  101  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0442  anion transporter  26.58 
 
 		 486 aa  101  4e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1341  response regulator receiver protein  46.09 
 
 		 301 aa  100  7e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0794  sodium/sulphate symporter  25.63 
 
 		 490 aa  100  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000496756  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2490  anion transporter  26.35 
 
 		 463 aa  99.8  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0173335 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1510  hypothetical protein  25.37 
 
 		 522 aa  99.4  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.807629 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3393  anion transporter  26.7 
 
 		 466 aa  99  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3574  anion transporter  27.6 
 
 		 467 aa  98.6  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0455  anion transporter  27.6 
 
 		 467 aa  98.6  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3094  anion transporter  27.11 
 
 		 464 aa  96.7  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.962564  hitchhiker  0.00000460999 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0451  anion transporter  27.6 
 
 		 466 aa  96.7  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.865628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0618  response regulator receiver protein  39.67 
 
 		 157 aa  95.9  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0859  anion transporter  28.33 
 
 		 579 aa  95.1  4e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.878292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2459  anion transporter  26.64 
 
 		 513 aa  94.7  5e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.983995  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003739  di-and tricarboxylate transporter  27.36 
 
 		 456 aa  94.4  7e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45173  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1362  response regulator receiver protein  35.53 
 
 		 159 aa  94  9e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0884  anion transporter  23.79 
 
 		 456 aa  93.6  1e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195972  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3334  response regulator receiver protein  38.6 
 
 		 120 aa  93.6  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1560  anion transporter  25.5 
 
 		 465 aa  93.2  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.251545  hitchhiker  0.000139905 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2065  NadC family transporter  24.82 
 
 		 457 aa  93.6  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931902  hitchhiker  0.00141864 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0656  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 129 aa  93.6  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.663964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0497  anion transporter  24.13 
 
 		 487 aa  93.2  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0495  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 456 aa  92.8  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0648  response regulator receiver protein  35 
 
 		 151 aa  92.8  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0045  CitT protein  25.78 
 
 		 455 aa  92.4  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296324  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4649  anion transporter  25.29 
 
 		 557 aa  92.4  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02032  hypothetical protein  26.07 
 
 		 456 aa  91.7  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0435  response regulator receiver protein  41.44 
 
 		 124 aa  91.7  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00876892  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0636  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 124 aa  91.7  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.621219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0328  response regulator receiver domain-containing protein  42.34 
 
 		 406 aa  91.3  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.918345  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1377  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37.5 
 
 		 462 aa  90.1  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.244526  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1350  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 147 aa  90.1  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00189482  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3444  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 120 aa  90.5  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0314  response regulator receiver protein  42.48 
 
 		 131 aa  90.1  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0234873  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0150  anion transporter  23.01 
 
 		 531 aa  90.1  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2740  putative transporter  29.57 
 
 		 478 aa  90.1  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000997908  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0283  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.71 
 
 		 456 aa  90.1  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4779  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  38.14 
 
 		 494 aa  90.1  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0268  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.71 
 
 		 456 aa  89.7  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0540037 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2238  anion transporter  23.56 
 
 		 510 aa  89.4  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.864259  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2915  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  38.79 
 
 		 457 aa  88.6  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2679  response regulator receiver domain-containing protein  40 
 
 		 129 aa  89  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.380915  normal  0.27601 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1358  helix-turn-helix, AraC type  23.61 
 
 		 467 aa  88.6  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1802  anion transporter  25.82 
 
 		 487 aa  88.6  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.466043  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0221  anion transporter  24.83 
 
 		 460 aa  88.2  5e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0555  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 457 aa  88.2  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0219  NadC family transporter  24.28 
 
 		 462 aa  87.8  6e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000102508  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2784  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 125 aa  87.8  7e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0945133  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0632  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 135 aa  87.4  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2177  response regulator receiver protein  40.54 
 
 		 120 aa  87.4  7e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0324  response regulator receiver domain-containing protein  40.87 
 
 		 127 aa  87  9e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.581793  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1358  response regulator receiver protein  36.72 
 
 		 144 aa  87  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.107991  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2017  response regulator CheY  39.5 
 
 		 129 aa  86.7  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1924  anion transporter  25.71 
 
 		 491 aa  86.7  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.200858  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0193  anion transporter  26.96 
 
 		 498 aa  87  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00876839  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2267  Sodium/sulphate symporter  25.06 
 
 		 516 aa  86.7  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0413087 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2934  response regulator receiver protein  39.23 
 
 		 129 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000852899  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0816  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 157 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1145  conserved hypothetical protein, putative sodium/sulfate transporter  24.04 
 
 		 453 aa  87  0.000000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00119531  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3443  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 223 aa  86.7  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2446  Sodium/sulphate symporter  25.88 
 
 		 491 aa  86.3  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2041  sodium/sulphate symporter  26.07 
 
 		 488 aa  86.3  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.341922  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0108  NadC family protein  27.68 
 
 		 462 aa  86.3  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0786  anion transporter  22.32 
 
 		 456 aa  86.3  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2331  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 142 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000425244  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1991  anion transporter  23.19 
 
 		 483 aa  85.5  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000356301  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1351  response regulator receiver protein  39.67 
 
 		 141 aa  85.5  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000171187  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2748  anion transporter  23.76 
 
 		 478 aa  85.5  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2042  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 147 aa  85.1  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1973  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 127 aa  85.1  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00115006  hitchhiker  0.0000141072 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0445  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  38.84 
 
 		 481 aa  85.1  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1972  anion transporter  25.35 
 
 		 520 aa  84.7  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2739  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 451 aa  84.7  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.693002  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1117  response regulator  40.54 
 
 		 127 aa  84.7  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2006  anion transporter  25.35 
 
 		 520 aa  84.7  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.740344  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2205  two component Fis family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 182 aa  84.7  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2078  anion transporter  24.88 
 
 		 486 aa  84.3  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3857  response regulator receiver protein  32.14 
 
 		 122 aa  84.3  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.161717  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4841  response regulator receiver protein  36.04 
 
 		 118 aa  84.7  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.202718  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>