19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1263 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1263  hypothetical protein  100 
 
 
214 aa  430  1e-120  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0102895  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0842  hypothetical protein  32.02 
 
 
220 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9665e-36 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1861  hypothetical protein  35.95 
 
 
215 aa  100  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0736957  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3918  hypothetical protein  32.38 
 
 
215 aa  95.9  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0113  hypothetical protein  35.06 
 
 
244 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1452  hypothetical protein  30.45 
 
 
269 aa  86.7  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1869  hypothetical protein  31.1 
 
 
244 aa  79.7  0.00000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000122959  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1694  hypothetical protein  24.22 
 
 
288 aa  71.6  0.000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6024  hypothetical protein  28.93 
 
 
243 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1117  hypothetical protein  26.45 
 
 
220 aa  57  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.616893  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1528  hypothetical protein  23.7 
 
 
222 aa  56.6  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00813694 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2914  hypothetical protein  29.36 
 
 
218 aa  53.1  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16720  hypothetical protein  23.39 
 
 
235 aa  52.8  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.923744  normal  0.426223 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17150  hypothetical protein  21.32 
 
 
237 aa  49.7  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.059036  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0153  hypothetical protein  25.15 
 
 
234 aa  49.7  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.161082  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0635  hypothetical protein  30.72 
 
 
223 aa  48.9  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2035  hypothetical protein  27.03 
 
 
214 aa  48.5  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4621  hypothetical protein  26.87 
 
 
226 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.152861  decreased coverage  0.0000000039388 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1164  hypothetical protein  22.87 
 
 
213 aa  46.2  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000515055  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>