More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1241 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1241  hypothetical protein  100 
 
 		 575 aa  1192    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0044833  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0413  hypothetical protein  46.76 
 
 		 584 aa  534  1e-150  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0235  protein of unknown function DUF181  42.4 
 
 		 572 aa  444  1e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1028  hypothetical protein  40.14 
 
 		 575 aa  434  1e-120  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1738  protein of unknown function DUF181  41.39 
 
 		 572 aa  425  1e-118  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.858461 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0004  protein of unknown function DUF181  41.32 
 
 		 584 aa  413  1e-114  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0544869 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1001  protein of unknown function DUF181  39.22 
 
 		 580 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2348  hypothetical protein  39.55 
 
 		 582 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.119117  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1333  hypothetical protein  28.21 
 
 		 404 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.157946  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0591  NADPH-dependent FMN reductase  26.58 
 
 		 403 aa  115  3e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0069008  hitchhiker  0.000778526 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2493  hypothetical protein  29.01 
 
 		 763 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2214  hypothetical protein  29.01 
 
 		 763 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0023  hypothetical protein  29.01 
 
 		 716 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0517  hypothetical protein  28.96 
 
 		 756 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11147  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0527  hypothetical protein  28.21 
 
 		 406 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.518429 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2869  hypothetical protein  29.01 
 
 		 763 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0622  hypothetical protein  28.73 
 
 		 769 aa  111  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.940579  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1978  hypothetical protein  28.43 
 
 		 403 aa  111  3e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.154455  normal  0.549107 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0637  YcaO-like fatty acid binding domain-containing protein  28.73 
 
 		 766 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0802  AknN  28.73 
 
 		 844 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.919252  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2355  hypothetical protein  26.35 
 
 		 769 aa  105  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.247728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6310  protein of unknown function DUF181  26.85 
 
 		 443 aa  103  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5737  protein of unknown function DUF181  24.53 
 
 		 750 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0880  hypothetical protein  26.26 
 
 		 749 aa  99.8  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5136  hypothetical protein  27.93 
 
 		 745 aa  99.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00343987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5723  hypothetical protein  27.93 
 
 		 745 aa  99.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250134  normal  0.533402 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2767  protein of unknown function DUF181  25.82 
 
 		 757 aa  99.4  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128011  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0842  hypothetical protein  24.16 
 
 		 404 aa  96.7  1e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0167577  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1602  methanogenesis marker protein 1  27.85 
 
 		 400 aa  95.5  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.192531  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4504  hypothetical protein  27.39 
 
 		 745 aa  95.5  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1788  hypothetical protein  24.94 
 
 		 746 aa  95.9  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6037  protein of unknown function DUF181  25.94 
 
 		 420 aa  94.4  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.463338  normal  0.501056 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0310  hypothetical protein  26.42 
 
 		 400 aa  93.6  8e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4676  protein of unknown function DUF181  27.94 
 
 		 752 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0537  hypothetical protein  30.24 
 
 		 400 aa  93.2  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0125337  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0379  hypothetical protein  29.79 
 
 		 403 aa  92.4  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3967  hypothetical protein  24.53 
 
 		 752 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.154728 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0821  hypothetical protein  27.66 
 
 		 424 aa  92  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3135  hypothetical protein  25.65 
 
 		 745 aa  91.3  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.535305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1401  hypothetical protein  29.24 
 
 		 403 aa  91.3  5e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4992  hypothetical protein  26.01 
 
 		 745 aa  88.6  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.934351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0519  protein of unknown function DUF181  22.29 
 
 		 762 aa  86.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2069  hypothetical protein  25.73 
 
 		 426 aa  86.3  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3472  hypothetical protein  24.48 
 
 		 389 aa  85.9  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2237  hypothetical protein  27.12 
 
 		 397 aa  84.7  0.000000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.61 
 
 		 632 aa  83.6  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3061  hypothetical protein  28.05 
 
 		 736 aa  83.6  0.000000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493225  normal  0.24084 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4368  hypothetical protein  27.13 
 
 		 727 aa  83.6  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150776 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0608  protein of unknown function DUF181  26.17 
 
 		 388 aa  83.2  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1211  methanogenesis marker protein 1  29.04 
 
 		 403 aa  82.8  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.882639 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2211  hypothetical protein  28.92 
 
 		 404 aa  81.6  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471647  normal  0.108179 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.33 
 
 		 810 aa  80.1  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7195  protein of unknown function DUF181  25.37 
 
 		 420 aa  80.1  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.175202  normal  0.168527 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1311  hypothetical protein  24.05 
 
 		 649 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.705807  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  32.65 
 
 		 878 aa  78.2  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.5 
 
 		 1022 aa  78.2  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  30.06 
 
 		 750 aa  77.8  0.0000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0980  hypothetical protein  29.71 
 
 		 597 aa  77.4  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00400135  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1073  hypothetical protein  29.71 
 
 		 597 aa  77.4  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788303  normal  0.409514 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4033  hypothetical protein  23.46 
 
 		 649 aa  77  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1008  hypothetical protein  29.39 
 
 		 611 aa  77  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1088  hypothetical protein  29.71 
 
 		 611 aa  76.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.654387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1039  hypothetical protein  29.57 
 
 		 586 aa  75.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.548133  normal  0.203105 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1002  hypothetical protein  28.21 
 
 		 586 aa  75.5  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.332512  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1066  hypothetical protein  29.57 
 
 		 586 aa  74.7  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0179082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0882  TPR repeat-containing protein  31.72 
 
 		 388 aa  74.7  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1425  hypothetical protein  29.19 
 
 		 586 aa  74.3  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.824732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0908  TPR repeat-containing protein  31.72 
 
 		 388 aa  74.3  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2216  hypothetical protein  29.24 
 
 		 586 aa  73.9  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.522723  normal  0.321049 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2423  hypothetical protein  29.24 
 
 		 586 aa  73.9  0.000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00238381  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00909  hypothetical protein  29.24 
 
 		 586 aa  73.6  0.000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2738  protein of unknown function DUF181  29.24 
 
 		 586 aa  73.6  0.000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.143697  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1011  hypothetical protein  29.24 
 
 		 586 aa  73.6  0.000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000298438  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2691  hypothetical protein  29.24 
 
 		 586 aa  73.6  0.000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.864502 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0447  TPR domain-containing protein  29.49 
 
 		 992 aa  73.6  0.000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000620141  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00916  hypothetical protein  29.24 
 
 		 586 aa  73.6  0.000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3949  TPR repeat-containing protein  30.46 
 
 		 361 aa  73.6  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.22 
 
 		 758 aa  73.6  0.000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1415  hypothetical protein  22.87 
 
 		 649 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  31.21 
 
 		 3145 aa  73.2  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1337  hypothetical protein  23.17 
 
 		 649 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.85919e-19 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1373  hypothetical protein  24.54 
 
 		 635 aa  72.4  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000799529  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1377  hypothetical protein  23.32 
 
 		 649 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1155  hypothetical protein  23.17 
 
 		 649 aa  72  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.34 
 
 		 265 aa  72  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  28.91 
 
 		 465 aa  71.6  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  25.31 
 
 		 887 aa  71.6  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  29.66 
 
 		 265 aa  70.9  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  31.72 
 
 		 265 aa  70.9  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6106  hypothetical protein  27.51 
 
 		 405 aa  70.5  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0977639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0768  TPR repeat-containing protein  28.11 
 
 		 258 aa  70.5  0.00000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.638517  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0917  hypothetical protein  23.81 
 
 		 437 aa  70.5  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1174  hypothetical protein  22.87 
 
 		 649 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1267  hypothetical protein  22.87 
 
 		 649 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.67 
 
 		 818 aa  70.1  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.04 
 
 		 784 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1149  hypothetical protein  22.87 
 
 		 649 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 		 543 aa  68.6  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1163  hypothetical protein  22.09 
 
 		 649 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  21.9 
 
 		 486 aa  68.2  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>