More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1231 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1231  aminotransferase class I and II  100 
 
 
339 aa  686    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3448  cobyric acid synthase CobQ  37.72 
 
 
852 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0869  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  31.93 
 
 
358 aa  181  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0487  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  34.42 
 
 
399 aa  178  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1104  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  31.21 
 
 
375 aa  172  5.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1737  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  31.53 
 
 
362 aa  172  7.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0451969 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  30.88 
 
 
863 aa  171  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2989  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  36.12 
 
 
361 aa  170  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.223207  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  32.93 
 
 
864 aa  168  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0043  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  34.72 
 
 
357 aa  167  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3089  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  31.25 
 
 
366 aa  166  4e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00022777  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1466  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  34.83 
 
 
362 aa  163  3e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3603  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  32.52 
 
 
370 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3679  cobyric acid synthase CobQ  30.49 
 
 
863 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1020  aminotransferase class I and II  27.73 
 
 
364 aa  162  8.000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3537  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  32.22 
 
 
379 aa  161  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1268  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  30.33 
 
 
364 aa  160  3e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1515  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  31.67 
 
 
361 aa  160  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1683  cobyric acid synthase CobQ  33.13 
 
 
858 aa  157  2e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1118  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  33.24 
 
 
366 aa  157  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1623  aminotransferase family protein  27.06 
 
 
358 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0121339  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1365  aminotransferase family protein  25.82 
 
 
358 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.078136  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2701  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  31.16 
 
 
360 aa  153  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1287  aminotransferase class I and II  27.76 
 
 
356 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0948768  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1011  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.25 
 
 
372 aa  147  3e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0943  aminotransferase class I and II  27.22 
 
 
363 aa  144  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.4987  normal  0.594638 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1295  threonine-phosphate decarboxylase  26.63 
 
 
354 aa  143  4e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.806359  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0012  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  29.55 
 
 
342 aa  143  5e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.393854 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1456  histidinol-phosphate aminotransferase  27.66 
 
 
371 aa  143  5e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.591481  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0747  threonine-phosphate decarboxylase  28.24 
 
 
364 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00550171  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0760  threonine-phosphate decarboxylase  28.53 
 
 
364 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0846626  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2936  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.71 
 
 
351 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0625  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  29.82 
 
 
368 aa  140  3e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.027617  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0804  threonine-phosphate decarboxylase  28.24 
 
 
364 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0706087  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0374  histidinol-phosphate aminotransferase  27.96 
 
 
371 aa  140  3e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0686765  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1849  histidinol-phosphate transaminase  32.63 
 
 
346 aa  140  3e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5370  aminotransferase class I and II  30.56 
 
 
340 aa  139  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1114  threonine-phosphate decarboxylase  26.63 
 
 
354 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.677622  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0655  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  30.06 
 
 
368 aa  139  6e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0689  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  30.06 
 
 
368 aa  139  6e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0304  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  27.68 
 
 
361 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0687  threonine-phosphate decarboxylase  28.24 
 
 
364 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000611427  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1111  aminotransferase class I and II  26.78 
 
 
362 aa  138  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02161  aminotransferase class-I  29.34 
 
 
371 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0701  threonine-phosphate decarboxylase  27.94 
 
 
364 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0153114  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3160  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.13 
 
 
352 aa  136  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0852475  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2208  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.04 
 
 
356 aa  136  4e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4468  aminotransferase class I and II  29.85 
 
 
342 aa  136  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.517965  normal  0.0670224 
 
 
-
 
NC_002950  PG1160  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  30.75 
 
 
335 aa  136  6.0000000000000005e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.693312 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_593  histidinol-phosphate aminotransferase  28.62 
 
 
368 aa  135  7.000000000000001e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.28275  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0463  histidinol-phosphate aminotransferase  26.52 
 
 
371 aa  135  9e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.070497  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1585  class I/II aminotransferase  29.82 
 
 
359 aa  133  3e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0420  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  31.44 
 
 
356 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1067  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  30.27 
 
 
359 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.748471  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0250  histidinol-phosphate aminotransferase  25.15 
 
 
371 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.941413  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  26.07 
 
 
358 aa  130  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1309  aminotransferase class I and II  29.95 
 
 
378 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000234222  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0722  threonine-phosphate decarboxylase  28.32 
 
 
366 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.762895 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0745  aminotransferase  30.27 
 
 
331 aa  126  7e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0512  aminotransferase class I and II  27.81 
 
 
346 aa  125  1e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.749213  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2464  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  30.84 
 
 
357 aa  125  1e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.275573 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02741  aminotransferases class-I  26.69 
 
 
360 aa  125  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0554  aminotransferase class I and II  28.74 
 
 
357 aa  124  3e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1565  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  26.69 
 
 
360 aa  123  4e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0633  aminotransferase class I and II  30.82 
 
 
354 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.982907  normal  0.468003 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2490  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.55 
 
 
362 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  27.11 
 
 
351 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0531  histidinol-phosphate aminotransferase  24.7 
 
 
371 aa  120  3e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.237574  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1109  threonine-phosphate decarboxylase  28.78 
 
 
357 aa  120  3.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0182392  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1052  aminotransferase class I and II  29 
 
 
383 aa  119  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1611  threonine-phosphate decarboxylase  29.17 
 
 
368 aa  119  6e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.238586  normal  0.916692 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1139  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  25.74 
 
 
348 aa  119  7e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.122292 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0576  aminotransferase, class I and II  30.54 
 
 
357 aa  119  7.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2687  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  26.33 
 
 
352 aa  119  9.999999999999999e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.243018  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02181  aminotransferases class-I  26.47 
 
 
374 aa  118  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0940  aminotransferase, class I and II  28.19 
 
 
334 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.240572  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02161  aminotransferases class-I  25.59 
 
 
373 aa  115  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2148  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  30.07 
 
 
357 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0200  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  26.05 
 
 
374 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.374942  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1766  threonine-phosphate decarboxylase  30.84 
 
 
367 aa  114  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  27.19 
 
 
371 aa  113  6e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5729  histidinol-phosphate aminotransferase  28.53 
 
 
369 aa  112  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0317  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  27.14 
 
 
364 aa  112  7.000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1265  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  28.23 
 
 
360 aa  112  9e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2087  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  26.3 
 
 
498 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.787862  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0650  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  33.24 
 
 
366 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000240372  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27901  aminotransferases class-I  28.57 
 
 
360 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1447  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.62 
 
 
332 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1723  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  25.88 
 
 
362 aa  109  7.000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  25.42 
 
 
373 aa  109  7.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  27.81 
 
 
362 aa  108  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0166  histidinol-phosphate aminotransferase  29.94 
 
 
352 aa  108  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal  0.633959 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1435  histidinol-phosphate aminotransferase  30.63 
 
 
362 aa  108  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.629545 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0471  histidinol-phosphate aminotransferase  23.98 
 
 
364 aa  108  1e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0312  histidinol-phosphate aminotransferase  26.92 
 
 
352 aa  108  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2089  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  24.56 
 
 
498 aa  107  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1260  aminotransferase class I and II  31.08 
 
 
365 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02271  aminotransferases class-I  26.05 
 
 
361 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.645989  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2908  histidinol-phosphate aminotransferase  31.49 
 
 
356 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174801  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1819  histidinol-phosphate aminotransferase  26.62 
 
 
351 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>