More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1190 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 160 aa  318  3e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  42.86 
 
 		 162 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0386  lipoprotein signal peptidase  44.03 
 
 		 178 aa  130  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000832352  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3756  lipoprotein signal peptidase  45.86 
 
 		 164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  42.57 
 
 		 161 aa  125  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  42.21 
 
 		 162 aa  125  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  46.97 
 
 		 158 aa  122  3e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  42.57 
 
 		 163 aa  120  5e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  42.14 
 
 		 182 aa  121  5e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1239  lipoprotein signal peptidase  45.52 
 
 		 165 aa  120  8e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261124  normal  0.0513456 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3597  lipoprotein signal peptidase  41.56 
 
 		 161 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000941199  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3135  lipoprotein signal peptidase  43.31 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.269423  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0123  lipoprotein signal peptidase  42.96 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0839092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0487  lipoprotein signal peptidase  42.38 
 
 		 178 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  45.22 
 
 		 169 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  44.37 
 
 		 180 aa  117  9e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1117  lipoprotein signal peptidase  43.38 
 
 		 165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.149841  normal  0.0706096 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0195  lipoprotein signal peptidase  42.95 
 
 		 163 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1860  signal peptidase II  45.32 
 
 		 174 aa  115  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  45.07 
 
 		 159 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  40.29 
 
 		 173 aa  114  6.9999999999999995e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  43.42 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  40.54 
 
 		 145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  42.38 
 
 		 164 aa  112  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  43.26 
 
 		 169 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2143  signal peptidase II  40.69 
 
 		 156 aa  110  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4314  lipoprotein signal peptidase  39.24 
 
 		 163 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081258  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  41.22 
 
 		 164 aa  108  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  42.86 
 
 		 170 aa  108  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0265  lipoprotein signal peptidase  39.49 
 
 		 166 aa  107  6e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0465894 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  44.52 
 
 		 166 aa  107  6e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  43.28 
 
 		 176 aa  107  6e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  39.07 
 
 		 157 aa  107  7.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  39.22 
 
 		 167 aa  107  7.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  44.52 
 
 		 166 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  44.52 
 
 		 166 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  44.52 
 
 		 166 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  44.52 
 
 		 166 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  44.52 
 
 		 166 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  44.52 
 
 		 166 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  44.52 
 
 		 166 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  37.84 
 
 		 170 aa  104  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0868  signal peptidase II  44.85 
 
 		 150 aa  104  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  40.85 
 
 		 171 aa  104  4e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0480  lipoprotein signal peptidase  41.13 
 
 		 159 aa  104  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3400  lipoprotein signal peptidase  43.26 
 
 		 165 aa  104  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2736  lipoprotein signal peptidase  43.26 
 
 		 165 aa  104  6e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.396586  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  42.47 
 
 		 173 aa  103  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  37.84 
 
 		 170 aa  103  7e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  37.84 
 
 		 170 aa  103  7e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  37.84 
 
 		 170 aa  103  7e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2364  lipoprotein signal peptidase  41.45 
 
 		 158 aa  103  8e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  41.78 
 
 		 166 aa  103  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  44.6 
 
 		 176 aa  103  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  37.59 
 
 		 171 aa  103  8e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1323  lipoprotein signal peptidase  41.61 
 
 		 152 aa  103  9e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3230  lipoprotein signal peptidase  44.03 
 
 		 179 aa  103  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  38.73 
 
 		 169 aa  102  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  39.29 
 
 		 168 aa  103  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  36.88 
 
 		 171 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0789  lipoprotein signal peptidase  38.73 
 
 		 169 aa  102  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.56712 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2967  lipoprotein signal peptidase  41.13 
 
 		 160 aa  102  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0888295  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  42.86 
 
 		 174 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3587  lipoprotein signal peptidase  38.73 
 
 		 169 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  36.88 
 
 		 171 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  36.88 
 
 		 171 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  39.29 
 
 		 170 aa  102  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  43.84 
 
 		 157 aa  102  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  39.72 
 
 		 176 aa  102  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  39.35 
 
 		 163 aa  101  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  42.14 
 
 		 174 aa  101  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  42.28 
 
 		 172 aa  101  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0948  lipoprotein signal peptidase  41.06 
 
 		 153 aa  101  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00981  lipoprotein signal peptidase  38.46 
 
 		 168 aa  100  7e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 171 aa  100  8e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  41.78 
 
 		 166 aa  100  9e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1814  lipoprotein signal peptidase  41.5 
 
 		 358 aa  99.8  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.344803 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  41.61 
 
 		 172 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  42.28 
 
 		 160 aa  100  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  41.1 
 
 		 166 aa  99.8  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  35.8 
 
 		 162 aa  99.4  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  38.78 
 
 		 164 aa  99.4  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  35.9 
 
 		 159 aa  99  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2110  lipoprotein signal peptidase  40.82 
 
 		 167 aa  98.6  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004418  lipoprotein signal peptidase  36.91 
 
 		 169 aa  99  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5948  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase /lipoprotein signal peptidase involved in Pb(II) resistance PbrB/C  41.91 
 
 		 358 aa  98.6  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.418988 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3451  lipoprotein signal peptidase  40.43 
 
 		 169 aa  99  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10093  normal  0.187541 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4558  lipoprotein signal peptidase  43.57 
 
 		 171 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.21418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  39.73 
 
 		 166 aa  97.4  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  39.26 
 
 		 182 aa  97.4  7e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2818  signal peptidase II  42.25 
 
 		 160 aa  97.4  7e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2630  peptidase A8, signal peptidase II  36.94 
 
 		 166 aa  97.1  9e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  40.54 
 
 		 178 aa  97.1  9e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3649  lipoprotein signal peptidase  42.04 
 
 		 164 aa  97.1  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0184315  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  35.29 
 
 		 170 aa  97.1  9e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  38.51 
 
 		 169 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2231  lipoprotein signal peptidase  45.75 
 
 		 189 aa  96.7  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0509  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 163 aa  96.7  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2146  lipoprotein signal peptidase  43.57 
 
 		 167 aa  96.7  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.669133  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  39.19 
 
 		 169 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>