More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1189 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1189  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  100 
 
 
258 aa  512  1e-144  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0486  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.78 
 
 
261 aa  203  2e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1116  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.8 
 
 
249 aa  190  2e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.116 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0374  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  38.46 
 
 
263 aa  167  1e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000370596  hitchhiker  4.04856e-10 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0923  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.21 
 
 
249 aa  163  2e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.532012  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2869  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.51 
 
 
267 aa  160  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0014  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.13 
 
 
301 aa  152  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0015  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  37.19 
 
 
360 aa  150  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.891974  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0014  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  38.74 
 
 
301 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0014  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  38.74 
 
 
301 aa  148  7e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1509  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  37.67 
 
 
260 aa  148  8e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0951  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.52 
 
 
276 aa  142  5e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1732  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.6 
 
 
270 aa  137  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1235  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.09 
 
 
269 aa  137  2e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1967  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.1 
 
 
282 aa  136  3e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.394112  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0905  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.58 
 
 
267 aa  136  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  2.13906e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0904  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.37 
 
 
293 aa  135  5e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2374  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.44 
 
 
257 aa  130  1e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2042  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35 
 
 
260 aa  130  2e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  2.69177e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2716  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.12 
 
 
251 aa  129  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  6.13339e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0206  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.46 
 
 
271 aa  127  2e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0195  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.78 
 
 
297 aa  127  2e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.337573  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2585  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.33 
 
 
293 aa  126  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.221457  normal  0.189717 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2651  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.57 
 
 
257 aa  126  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004428  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.94 
 
 
273 aa  125  8e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1165  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.92 
 
 
279 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1192  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.92 
 
 
279 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0473  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.76 
 
 
357 aa  124  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0590188  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1583  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.06 
 
 
257 aa  124  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.889628 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2727  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.36 
 
 
262 aa  123  3e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0904003  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4345  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.74 
 
 
285 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2573  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.33 
 
 
267 aa  122  7e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.604509  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0233  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.73 
 
 
270 aa  122  8e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0994  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.29 
 
 
285 aa  121  1e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.101042  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00970  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.56 
 
 
273 aa  120  2e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0790  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.19 
 
 
293 aa  120  2e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0767  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.19 
 
 
293 aa  120  2e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1425  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.59 
 
 
260 aa  120  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1227  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.33 
 
 
261 aa  120  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0136152 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48180  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.32 
 
 
265 aa  120  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2433  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35 
 
 
262 aa  119  4e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1865  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.73 
 
 
253 aa  119  4e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.827419  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1230  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.98 
 
 
289 aa  119  4e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0607531 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2746  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.59 
 
 
265 aa  119  5e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1139  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.2 
 
 
282 aa  119  5e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3339  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.8 
 
 
276 aa  119  5e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0768  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.43 
 
 
263 aa  119  7e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0462  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  37.67 
 
 
342 aa  118  8e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.285848  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14920  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.5 
 
 
307 aa  118  9e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13542  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2131  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.59 
 
 
265 aa  117  2e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1639  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.54 
 
 
281 aa  116  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2253  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.48 
 
 
357 aa  116  4e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.411442  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1698  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.53 
 
 
266 aa  116  4e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  5.67119e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6749  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.46 
 
 
282 aa  116  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0902  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.69 
 
 
275 aa  115  5e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3746  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.56 
 
 
269 aa  115  6e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0511253  hitchhiker  0.00206835 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4306  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.74 
 
 
290 aa  115  6e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1553  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.78 
 
 
288 aa  115  7e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.880731 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3622  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.63 
 
 
290 aa  115  8e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2330  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.77 
 
 
292 aa  115  8e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.486837 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0572  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.92 
 
 
283 aa  115  8e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0106138  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1877  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.36 
 
 
261 aa  114  1e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.88014e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3170  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.26 
 
 
270 aa  115  1e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1415  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.39 
 
 
248 aa  114  1e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.269297  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4214  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.98 
 
 
266 aa  114  2e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0703  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.21 
 
 
294 aa  114  2e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.609213 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4841  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.59 
 
 
270 aa  114  2e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1477  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.8 
 
 
281 aa  114  2e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0180455  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1528  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.8 
 
 
281 aa  114  2e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0505  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.18 
 
 
287 aa  112  4e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0238281 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0301  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.35 
 
 
263 aa  113  4e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000153612  normal  0.153918 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4492  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.33 
 
 
321 aa  112  4e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0357938  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2802  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.7 
 
 
270 aa  113  4e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2273  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.22 
 
 
269 aa  113  4e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3171  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.1 
 
 
254 aa  112  4e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06631  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.96 
 
 
304 aa  112  4e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0984  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.8 
 
 
320 aa  112  5e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2039  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.58 
 
 
261 aa  112  5e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3822  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.22 
 
 
290 aa  112  6e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00839067  normal  0.429606 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5283  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.22 
 
 
270 aa  112  6e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1279  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.27 
 
 
250 aa  112  6e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1035  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.71 
 
 
290 aa  112  7e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.849889  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0983  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.71 
 
 
290 aa  112  7e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000100522  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3239  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.71 
 
 
290 aa  112  7e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.132712  normal  0.305063 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0434  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.95 
 
 
266 aa  111  1e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0921151  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2010  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.14 
 
 
294 aa  111  1e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3015  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.5 
 
 
287 aa  111  1e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2313  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.68 
 
 
294 aa  111  1e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0323  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.23 
 
 
269 aa  111  1e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.337894  normal  0.658901 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0720  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30 
 
 
263 aa  110  2e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0760049  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0974  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.65 
 
 
281 aa  110  2e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0181566  normal  0.0698787 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05161  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.25 
 
 
297 aa  110  2e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.889276  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1880  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.94 
 
 
271 aa  109  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0668134  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2548  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.06 
 
 
272 aa  110  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.535661  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5195  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.33 
 
 
268 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5049  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.33 
 
 
268 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0062  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.07 
 
 
295 aa  110  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04460  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.58 
 
 
266 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1342  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.04 
 
 
294 aa  109  4e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.467977 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0641  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.94 
 
 
276 aa  109  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>