More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1166 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1166  cysteine synthase  100 
 
 		 771 aa  1589    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0478  cysteine synthases  47.14 
 
 		 773 aa  704    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00249553  hitchhiker  0.000140585 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1036  cysteine synthase  44.23 
 
 		 768 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.876649  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0830  cysteine synthase  43.82 
 
 		 764 aa  556  1e-157  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.246504 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1653  cysteinyl-tRNA synthetase  38.38 
 
 		 471 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3005  cysteine synthase B  56.36 
 
 		 308 aa  320  5e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.951108  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2678  cysteine synthase  53.08 
 
 		 318 aa  317  6e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1311  cysteine synthase  55.33 
 
 		 302 aa  316  8e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.933049  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0822  cysteine synthase  55.48 
 
 		 307 aa  313  7.999999999999999e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0164  cysteinyl-tRNA synthetase  36.44 
 
 		 475 aa  311  2.9999999999999997e-83  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0618453  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3359  cysteine synthases  54.27 
 
 		 305 aa  304  4.0000000000000003e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1096  cysteine synthase  52.76 
 
 		 299 aa  303  9e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.365638 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3163  cysteine synthase  52.41 
 
 		 354 aa  301  4e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  34.84 
 
 		 468 aa  300  7e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0313  cysteinyl-tRNA synthetase  33.83 
 
 		 476 aa  296  7e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.625731 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1644  cysteinyl-tRNA synthetase  35.96 
 
 		 472 aa  295  2e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1599  cysteinyl-tRNA synthetase  34.46 
 
 		 476 aa  295  3e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00000906806  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0534  cysteinyl-tRNA synthetase  33.62 
 
 		 476 aa  292  2e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0472255  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0264  cysteine synthase  53.18 
 
 		 308 aa  290  9e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.170266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  35.18 
 
 		 465 aa  289  1e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  34.75 
 
 		 470 aa  287  4e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2732  cysteinyl-tRNA synthetase  35.37 
 
 		 474 aa  287  5e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.511576  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  34.41 
 
 		 500 aa  286  8e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1314  cysteine synthase  50.51 
 
 		 322 aa  286  1.0000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0415  cysteinyl-tRNA synthetase  35.93 
 
 		 490 aa  284  4.0000000000000003e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  35.76 
 
 		 474 aa  283  6.000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0171  cysteinyl-tRNA synthetase  36.15 
 
 		 469 aa  283  7.000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000554263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0338  cysteinyl-tRNA synthetase  35.28 
 
 		 472 aa  283  8.000000000000001e-75  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000985703  hitchhiker  0.00000017831 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0746  cysteine synthases  51.19 
 
 		 305 aa  282  1e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1024  cysteine synthase  51.86 
 
 		 305 aa  282  2e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.18883  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  35.55 
 
 		 468 aa  280  5e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  34.18 
 
 		 466 aa  280  8e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  34.18 
 
 		 466 aa  279  1e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0188  cysteinyl-tRNA synthetase  36 
 
 		 478 aa  279  1e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.272447  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3158  cysteine synthase B  53.51 
 
 		 308 aa  277  5e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0839  cysteine synthase B  51.17 
 
 		 316 aa  277  6e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0067092  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  36.78 
 
 		 485 aa  274  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  33.55 
 
 		 466 aa  273  6e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2660  cysteinyl-tRNA synthetase  35.49 
 
 		 461 aa  273  8.000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0958679  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  32.41 
 
 		 466 aa  273  1e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1559  cysteinyl-tRNA synthetase  33.76 
 
 		 467 aa  273  1e-71  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3653  cysteinyl-tRNA synthetase  33.26 
 
 		 465 aa  271  2.9999999999999997e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1645  cysteinyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 472 aa  271  4e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0256229  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  34.92 
 
 		 486 aa  271  5e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0398  cysteinyl-tRNA synthetase  35.77 
 
 		 477 aa  270  7e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000244083  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  48.85 
 
 		 308 aa  270  8e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0382  cysteinyl-tRNA synthetase  31.69 
 
 		 475 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.477113  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  32.36 
 
 		 461 aa  268  2.9999999999999995e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000668205  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  35.4 
 
 		 479 aa  267  4e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  30.69 
 
 		 465 aa  267  5e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  31.95 
 
 		 484 aa  267  5e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0120  cysteinyl-tRNA synthetase  30.69 
 
 		 465 aa  267  5e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252042  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  30.62 
 
 		 465 aa  267  5.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  30.62 
 
 		 465 aa  267  5.999999999999999e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  30.62 
 
 		 465 aa  267  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0303  cysteinyl-tRNA synthetase  32.49 
 
 		 470 aa  267  5.999999999999999e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209155  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  30.84 
 
 		 465 aa  267  5.999999999999999e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000240351  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  30.62 
 
 		 465 aa  267  5.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  30.62 
 
 		 465 aa  267  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  32.84 
 
 		 466 aa  266  8e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  34.01 
 
 		 493 aa  266  8e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  30.41 
 
 		 465 aa  266  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1666  cysteinyl-tRNA synthetase  35.29 
 
 		 458 aa  265  2e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0162  cysteinyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 468 aa  265  2e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0231  cysteine synthase B  49.49 
 
 		 321 aa  265  3e-69  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000104682  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0530  cysteinyl-tRNA synthetase  35.15 
 
 		 460 aa  265  3e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.474927  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  33.47 
 
 		 481 aa  263  1e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3742  cysteinyl-tRNA synthetase  35.89 
 
 		 460 aa  262  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156882  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2832  cysteine synthase B  46.39 
 
 		 294 aa  262  2e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2454  cysteine synthase  46.39 
 
 		 294 aa  262  2e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0944548  normal  0.580019 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1735  cysteinyl-tRNA synthetase  35.89 
 
 		 460 aa  261  3e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_61  cysteinyl-tRNA synthetase  34.19 
 
 		 457 aa  261  3e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  33.6 
 
 		 493 aa  261  4e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1248  cysteinyl-tRNA synthetase  34.66 
 
 		 461 aa  261  5.0000000000000005e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000407868  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  33.4 
 
 		 494 aa  260  6e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5208  cysteinyl-tRNA synthetase  34.62 
 
 		 494 aa  260  6e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  34.65 
 
 		 461 aa  260  7e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0061  cysteinyl-tRNA synthetase  33.97 
 
 		 458 aa  259  1e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0055  cysteinyl-tRNA synthetase  34.04 
 
 		 457 aa  259  1e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0537  cysteinyl-tRNA synthetase  34.85 
 
 		 485 aa  259  1e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2249  cysteine--tRNA ligase  35.09 
 
 		 485 aa  259  1e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000746597  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0110  cysteinyl-tRNA synthetase  30.19 
 
 		 465 aa  259  1e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.033401  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2398  cysteinyl-tRNA synthetase  35.43 
 
 		 461 aa  259  1e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2786  cysteinyl-tRNA synthetase  34.92 
 
 		 460 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5216  cysteinyl-tRNA synthetase  30.41 
 
 		 465 aa  259  2e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00001018  unclonable  2.47403e-25 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  35.37 
 
 		 459 aa  258  2e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  32.64 
 
 		 487 aa  257  4e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  33.95 
 
 		 480 aa  257  5e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1166  cysteinyl-tRNA synthetase  35.28 
 
 		 461 aa  257  7e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193068  normal  0.0129624 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1677  cysteine synthase  46.28 
 
 		 317 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0482  cysteinyl-tRNA synthetase  36.12 
 
 		 485 aa  256  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00357659 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2905  cysteinyl-tRNA synthetase  34.92 
 
 		 460 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.242748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0210  cysteinyl-tRNA synthetase  35.97 
 
 		 460 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0207  cysteinyl-tRNA synthetase  32.84 
 
 		 447 aa  255  2.0000000000000002e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3031  cysteine synthase B  47.1 
 
 		 296 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0208  cysteinyl-tRNA synthetase  35.97 
 
 		 460 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1345  cysteinyl-tRNA synthetase  34.44 
 
 		 461 aa  256  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  33.96 
 
 		 480 aa  255  3e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2722  cysteinyl-tRNA synthetase  33.06 
 
 		 486 aa  254  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.688362 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2878  cysteinyl-tRNA synthetase  34.71 
 
 		 460 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.846571  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>