80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1164 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1164  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 320 aa  657    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1122  HD domain-containing protein  42.04 
 
 		 375 aa  264  2e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1665  metal dependent phosphohydrolase  44.16 
 
 		 388 aa  264  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2548  metal dependent phosphohydrolase  44.16 
 
 		 386 aa  262  6e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.98451e-17 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2675  metal dependent phosphohydrolase  42.59 
 
 		 384 aa  261  8e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.606537 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2929  metal dependent phosphohydrolase  42.45 
 
 		 366 aa  258  7e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.220477  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0157  metal dependent phosphohydrolase  43.34 
 
 		 348 aa  257  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0049  metal dependent phosphohydrolase  41.56 
 
 		 371 aa  238  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2013  HD-superfamily hydrolase  39.81 
 
 		 387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000276986  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0440  metal dependent phosphohydrolase  39.31 
 
 		 377 aa  227  2e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000386707  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4294  metal dependent phosphohydrolase  35.78 
 
 		 375 aa  220  3e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1796  metal dependent phosphohydrolase  38.29 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000175278  normal  0.229909 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2466  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  37.58 
 
 		 328 aa  212  7.999999999999999e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0701415  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0691  metal dependent phosphohydrolase  34.57 
 
 		 344 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000585513  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0667  metal dependent phosphohydrolase  34.27 
 
 		 336 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000407652  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0158  metal dependent phosphohydrolase  31.8 
 
 		 315 aa  192  7e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1026  metal dependent phosphohydrolase  34.75 
 
 		 327 aa  189  4e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2639  metal dependent phosphohydrolase  36.28 
 
 		 528 aa  189  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.130174  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2543  metal dependent phosphohydrolase  36.28 
 
 		 531 aa  189  4e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.738894  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1091  metal dependent phosphohydrolase  36.16 
 
 		 347 aa  186  6e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.628877  normal  0.443941 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1317  metal dependent phosphohydrolase  35.06 
 
 		 534 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0700325  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0129  metal dependent phosphohydrolase  34.91 
 
 		 343 aa  183  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0022  metal dependent phosphohydrolase  37.42 
 
 		 361 aa  181  1e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0126816 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0086  metal dependent phosphohydrolase  30.7 
 
 		 361 aa  177  2e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2446  metal dependent phosphohydrolase  34.95 
 
 		 534 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1404  metal dependent phosphohydrolase  35.54 
 
 		 343 aa  171  1e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.248325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1988  metal dependent phosphohydrolase  39.37 
 
 		 295 aa  171  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.489678  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2404  HD-superfamily hydrolase  33 
 
 		 321 aa  171  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0036501  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1025  metal dependent phosphohydrolase  31.6 
 
 		 336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0147  metal dependent phosphohydrolase  30.03 
 
 		 344 aa  161  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2339  metal dependent phosphohydrolase  32.49 
 
 		 347 aa  159  6e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5827  metal dependent phosphohydrolase  34.39 
 
 		 295 aa  155  7e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.163543  normal  0.236354 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0904  HD-superfamily hydrolase  32.19 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0636  3'-5' exoribonuclease YhaM  33.44 
 
 		 324 aa  152  8e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000053339  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1452  3'-5' exoribonuclease YhaM  35.03 
 
 		 376 aa  151  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0796  3'-5' exoribonuclease YhaM  32.15 
 
 		 318 aa  149  9e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4249  3'-5' exoribonuclease YhaM  32.15 
 
 		 314 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000074521 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0927  3'-5' exoribonuclease YhaM  31.35 
 
 		 314 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.475944  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1052  3'-5' exoribonuclease YhaM  31.83 
 
 		 314 aa  144  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0299092  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0920  3'-5' exoribonuclease YhaM  31.83 
 
 		 314 aa  144  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0118856  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1111  3'-5' exoribonuclease YhaM  31.83 
 
 		 314 aa  144  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.189435  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0947  3'-5' exoribonuclease YhaM  31.83 
 
 		 314 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0716307  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1087  3'-5' exoribonuclease YhaM  31.83 
 
 		 314 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6154099999999997e-58 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0933  3'-5' exoribonuclease YhaM  31.83 
 
 		 314 aa  144  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0143521  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1012  3'-5' exoribonuclease YhaM  31.83 
 
 		 314 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1180  3'-5' exoribonuclease YhaM  31.51 
 
 		 314 aa  142  8e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000316143  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1645  metal dependent phosphohydrolase  27.73 
 
 		 352 aa  136  5e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5784  metal dependent phosphohydrolase  30.84 
 
 		 327 aa  133  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.825544 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0317  metal dependent phosphohydrolase  28.88 
 
 		 333 aa  133  5e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1929  3'-5' exoribonuclease YhaM  29.47 
 
 		 313 aa  132  9e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1895  3'-5' exoribonuclease YhaM  29.47 
 
 		 313 aa  132  9e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.469436  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1448  HD-superfamily hydrolase  30.49 
 
 		 325 aa  132  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000046208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0027  3'-5' exoribonuclease YhaM  31.9 
 
 		 323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.838244  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0027  HD domain-containing protein  31.9 
 
 		 323 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1378  3'-5' exoribonuclease YhaM  28.8 
 
 		 313 aa  125  9e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.280441  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0730  HD-superfamily hydrolase  26.8 
 
 		 316 aa  125  1e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2193  HD-superfamily hydrolase  29.41 
 
 		 314 aa  116  3.9999999999999997e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl244  cmp-binding factor-1  25.85 
 
 		 326 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1773  HD domain-containing protein  25.31 
 
 		 313 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0235466  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1871  metal dependent phosphohydrolase  30.46 
 
 		 317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0450  metal dependent phosphohydrolase  28.79 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0847  metal dependent phosphohydrolase  30.64 
 
 		 354 aa  107  4e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.241634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0913  hypothetical protein  30.87 
 
 		 313 aa  106  6e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1766  HD-superfamily hydrolase  27.21 
 
 		 313 aa  106  6e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00925857  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3087  metal dependent phosphohydrolase  27.82 
 
 		 330 aa  105  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120543 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0473  hypothetical protein  26.81 
 
 		 326 aa  102  9e-21  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1232  metal dependent phosphohydrolase  32.12 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0723  metal dependent phosphohydrolase  32.11 
 
 		 228 aa  80.9  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0933  metal dependent phosphohydrolase  30.77 
 
 		 249 aa  79.7  0.00000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1443  metal dependent phosphohydrolase  36.24 
 
 		 228 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.281894  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1243  metal dependent phosphohydrolase  34.64 
 
 		 228 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2850  metal dependent phosphohydrolase  28.79 
 
 		 309 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0222  metal dependent phosphohydrolase  32.23 
 
 		 170 aa  55.1  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1141  metal dependent phosphohydrolase  34.78 
 
 		 320 aa  47.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00121912  hitchhiker  0.00000000000000887406 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0254  metal dependent phosphohydrolase  29.22 
 
 		 320 aa  47  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00126604  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2021  metal dependent phosphohydrolase  30.68 
 
 		 287 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000315761  decreased coverage  0.0000000241246 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2132  metal dependent phosphohydrolase  29.55 
 
 		 187 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1919  phosphodiesterase  24.55 
 
 		 512 aa  43.5  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0169953  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1162  metal dependent phosphohydrolase  25.15 
 
 		 217 aa  43.1  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.031643  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0550  phosphodiesterase  32.04 
 
 		 509 aa  42.4  0.009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>