111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1160 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1160  CoB--CoM heterodisulfide reductase  100 
 
 
295 aa  614  1e-175  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1334  CoB--CoM heterodisulfide reductase  42.5 
 
 
286 aa  226  3e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0395  CoB--CoM heterodisulfide reductase  38.54 
 
 
462 aa  221  1.9999999999999999e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.453445  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1352  CoB--CoM heterodisulfide reductase  40.56 
 
 
285 aa  218  6e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.472371 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0564  CoB--CoM heterodisulfide reductase  41.43 
 
 
283 aa  210  3e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0357  CoB--CoM heterodisulfide reductase  37.69 
 
 
284 aa  203  3e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0862  CoB--CoM heterodisulfide reductase  35.54 
 
 
292 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0810  hypothetical protein  34.95 
 
 
299 aa  199  5e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000756552 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1349  CoB--CoM heterodisulfide reductase  34.14 
 
 
293 aa  199  5e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.543015 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1261  CoB--CoM heterodisulfide reductase  36.99 
 
 
502 aa  199  6e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0091  heterodisulfide reductase subunit  35.54 
 
 
296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1108  heterodisulfide reductase, subunit C/succinate dehydrogenase, subunit C  36.17 
 
 
502 aa  196  5.000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.785263  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1195  hypothetical protein  36.43 
 
 
290 aa  195  6e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3425  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  35.07 
 
 
296 aa  194  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1201  CoB--CoM heterodisulfide reductase  34.98 
 
 
508 aa  191  2e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0710444  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0030  CoB--CoM heterodisulfide reductase  34.74 
 
 
317 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3582  CoB--CoM heterodisulfide reductase  35.56 
 
 
295 aa  189  4e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0150  CoB--CoM heterodisulfide reductase  35.56 
 
 
295 aa  189  5e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0031  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.74 
 
 
317 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17760  heterodisulfide reductase, subunit B  34.75 
 
 
349 aa  188  9e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1028  heterodisulfide reductase, subunit C/succinate dehydrogenase, subunit C  35.05 
 
 
502 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00356665  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3676  CoB--CoM heterodisulfide reductase  36.62 
 
 
300 aa  182  5.0000000000000004e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0819  CoB--CoM heterodisulfide reductase  34.75 
 
 
294 aa  182  6e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.130606 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1307  CoB--CoM heterodisulfide reductase  33.8 
 
 
497 aa  182  6e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0849  CoB--CoM heterodisulfide reductase  35.87 
 
 
294 aa  179  4e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0688989  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1701  CoB--CoM heterodisulfide reductase  34.51 
 
 
288 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000396629 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1326  hypothetical protein  34.38 
 
 
281 aa  176  6e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1805  hypothetical protein  34.15 
 
 
281 aa  173  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.852192 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2343  CoB--CoM heterodisulfide reductase  36.62 
 
 
305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.50274  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0827  CoB--CoM heterodisulfide reductase  35.76 
 
 
334 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.247627  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2099  CoB--CoM heterodisulfide reductase  34.36 
 
 
306 aa  171  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3525  heterodisulfide reductase, B subunit  36.5 
 
 
308 aa  171  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0197  CoB--CoM heterodisulfide reductase  36.27 
 
 
300 aa  168  1e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2316  CoB--CoM heterodisulfide reductase  36.27 
 
 
300 aa  168  1e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3573  CoB--CoM heterodisulfide reductase  32.98 
 
 
294 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1208  succinate dehydrogenase subunit C  34.38 
 
 
299 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1881  CoB--CoM heterodisulfide reductase  32.63 
 
 
295 aa  165  6.9999999999999995e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.983489  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0323  CoB--CoM heterodisulfide reductase  35.89 
 
 
326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.557922 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0416  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.11 
 
 
302 aa  163  3e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.373291 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26920  heterodisulfide reductase, subunit B  31.06 
 
 
296 aa  160  2e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0634  CoB--CoM heterodisulfide reductase  33.33 
 
 
290 aa  159  6e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1573  CoB--CoM heterodisulfide reductase  33.1 
 
 
281 aa  149  5e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4093  hypothetical protein  30.48 
 
 
296 aa  147  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.883836  normal  0.415354 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0637  CoB--CoM heterodisulfide reductase  29.97 
 
 
303 aa  145  5e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0945961 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2104  CoB--CoM heterodisulfide reductase  29.87 
 
 
305 aa  143  4e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06200  heterodisulfide reductase, subunit B  28.03 
 
 
297 aa  142  7e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.860836  hitchhiker  0.00110828 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0375  CoB--CoM heterodisulfide reductase  30.88 
 
 
291 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2211  CoB--CoM heterodisulfide reductase  29.63 
 
 
303 aa  141  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0339635  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2178  CoB--CoM heterodisulfide reductase  30.07 
 
 
303 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000377327 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2550  succinate dehydrogenase/fumarate reductase, C subunit  30.07 
 
 
303 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187993  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0172  CoB--CoM heterodisulfide reductase  30.11 
 
 
290 aa  139  6e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1251  CoB--CoM heterodisulfide reductase  29.35 
 
 
282 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.684126  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1542  CoB--CoM heterodisulfide reductase  26.64 
 
 
306 aa  133  3e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0167563 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3648  succinate dehydrogenase subunit C  26.69 
 
 
301 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115665  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0465  succinate dehydrogenase, C subunit  28.67 
 
 
285 aa  132  5e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0490  succinate dehydrogenase, C subunit  28.67 
 
 
285 aa  132  6e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1281  hypothetical protein  29.02 
 
 
285 aa  132  7.999999999999999e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0129  succinate/fumarate oxidoreductase, putative  28.57 
 
 
282 aa  132  9e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.394033  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1632  CoB--CoM heterodisulfide reductase  26.69 
 
 
301 aa  131  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0453  succinate dehydrogenase subunit C  25.93 
 
 
301 aa  129  7.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2715  CoB--CoM heterodisulfide reductase  27.24 
 
 
282 aa  129  7.000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2526  CoB--CoM heterodisulfide reductase  27.36 
 
 
302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0675  succinate dehydrogenase subunit C  27.6 
 
 
290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0161488  hitchhiker  0.000830307 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1028  succinate dehydrogenase/fumarate reductase subunit C  27.87 
 
 
293 aa  127  3e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.288715  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1077  CoB--CoM heterodisulfide reductase  26.91 
 
 
320 aa  127  3e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0320251  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2664  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.68 
 
 
276 aa  126  4.0000000000000003e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1993  succinate/fumarate oxidoreductase, putative  28.62 
 
 
282 aa  125  8.000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0310  succinate dehydrogenase subunit C  26.95 
 
 
282 aa  124  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.231375 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2342  CoB--CoM heterodisulfide reductase  27.56 
 
 
282 aa  124  2e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4068  CoB--CoM heterodisulfide reductase  26.01 
 
 
297 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0976  CoB--CoM heterodisulfide reductase  27.65 
 
 
296 aa  121  9.999999999999999e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.161405  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0250  CoB--CoM heterodisulfide reductase  26.88 
 
 
282 aa  120  3.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26914  normal  0.65671 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2945  CoB--CoM heterodisulfide reductase  26.35 
 
 
297 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3151  CoB--CoM heterodisulfide reductase  26.35 
 
 
297 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00144336  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0175  succinate dehydrogenase subunit C  28.47 
 
 
282 aa  119  7e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0475  CoB--CoM heterodisulfide reductase  25.51 
 
 
300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0286  CoB--CoM heterodisulfide reductase  26.43 
 
 
282 aa  117  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.82153  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1645  heterodisulfide reductase, B subunit  26.46 
 
 
303 aa  115  7.999999999999999e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0422083  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0308  CoB--CoM heterodisulfide reductase  25.51 
 
 
297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0307  CoB--CoM heterodisulfide reductase  26.87 
 
 
293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0428  succinate dehydrogenase subunit C  26.67 
 
 
295 aa  113  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0403  CoB--CoM heterodisulfide reductase  25.85 
 
 
300 aa  113  3e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.148896  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1605  CoB--CoM heterodisulfide reductase, subunit B  26.87 
 
 
293 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.590604  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0432  CoB--CoM heterodisulfide reductase  25.51 
 
 
299 aa  112  5e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1516  CoB--CoM heterodisulfide reductase, subunit B  25.51 
 
 
300 aa  112  9e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.479226  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0540  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit B  26.53 
 
 
293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0376  CoB--CoM heterodisulfide reductase  26.19 
 
 
293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5286  CoB--CoM heterodisulfide reductase  26.8 
 
 
304 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0240  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit B  28 
 
 
308 aa  109  5e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.345806 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0589  CoB--CoM heterodisulfide reductase  28.2 
 
 
307 aa  103  4e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0867729  normal  0.0373464 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1435  CoB--CoM heterodisulfide reductase  27.96 
 
 
278 aa  103  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.125924  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1837  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  26.37 
 
 
296 aa  100  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.213828  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1517  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit B  25.17 
 
 
306 aa  101  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00419351  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0624  CoB--CoM heterodisulfide reductase  25.34 
 
 
300 aa  99  8e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.022325  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0639  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit B  24.07 
 
 
300 aa  97.1  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2240  CoB/CoM heterodisulfide reductase, subunit B  24.91 
 
 
296 aa  94  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.145621  normal  0.0183025 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0440  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit B  23.89 
 
 
292 aa  87  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1954  heterodisulfide reductase, subunit B  24.56 
 
 
314 aa  76.6  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2995  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  26.46 
 
 
246 aa  54.7  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1599  CoB-CoM heterodisulfide reductase, subunit D  23.1 
 
 
409 aa  53.9  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>