More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1135 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1135  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 206 aa  428  1e-119  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0784  TetR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42035  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5184  transcriptional regulator BetI  25.27 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.14696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3270  transcriptional regulator BetI  25.27 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5098  transcriptional regulator BetI  25.27 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3538  transcriptional regulator BetI  25.81 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1067  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0555  transcriptional regulator BetI  24.73 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1074  transcriptional regulator BetI  26.38 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000226822  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0669  transcriptional regulator, TetR family  25.98 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.922821  hitchhiker  0.000725922 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0565  transcriptional regulator BetI  25.13 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359685 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5035  transcriptional regulator BetI  26.2 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.496722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3308  transcriptional regulator BetI  26.16 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4510  transcriptional regulator BetI  26.2 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1926  transcriptional regulator EefR  29.01 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0902915  hitchhiker  0.0000000455593 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0916  transcriptional regulator BetI  25.14 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0327012  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1837  transcriptional regulator EefR  33.04 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000033131 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0375  transcriptional regulator BetI  25.31 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00292447  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  23.91 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0466  transcriptional regulator BetI  25.31 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0181  transcriptional regulator BetI  25.31 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1923  transcriptional regulator BetI  25.31 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00275068  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1834  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.353647 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1835  transcriptional regulator BetI  25.31 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1426  transcriptional regulator BetI  25.31 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80296  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9078  putative transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1333  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.103575  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3731  TetR family transcriptional regulator  19.8 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1087  transcriptional regulator, TetR family  23.88 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.9461  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2175  TetR family transcriptional regulator  19.8 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595394  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2338  transcriptional regulator, TetR family  22.35 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.857275  normal  0.161469 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  21.76 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5570  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2032  TetR family transcriptional regulator  19.8 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.874631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2399  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0482124  hitchhiker  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4264  transcriptional regulator, TetR family  36.25 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1866  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0891  transcriptional regulator BetI  21.91 
 
 		 208 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.21263  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2281  regulatory protein, TetR  44 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.45314 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3421  transcriptional regulator, TetR family  24.12 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0992  TetR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000245295 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  22.29 
 
 		 189 aa  53.9  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1138  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 248 aa  53.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2823  transcriptional regulator, TetR family  22.73 
 
 		 208 aa  53.1  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00548665  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2829  transcriptional regulator BetI  27.94 
 
 		 198 aa  53.1  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2513  transcriptional regulator, TetR family  30.08 
 
 		 199 aa  53.1  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 245 aa  52.4  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5621  transcriptional regulator, TetR family  20.93 
 
 		 195 aa  52.8  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00254336 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0189  DNA-binding transcriptional repressor FabR  27.59 
 
 		 213 aa  52.8  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.368893  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5896  transcriptional regulator  45.83 
 
 		 199 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371414  normal  0.0197091 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3720  transcriptional regulator, TetR family  23.16 
 
 		 200 aa  52  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91394  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5271  transcriptional regulator, TetR family  23.53 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.869889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1513  transcriptional regulator BetI  25 
 
 		 198 aa  52.4  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0564912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4168  TetR family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 244 aa  52.4  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0511823  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4197  DNA-binding transcriptional repressor FabR  26.62 
 
 		 215 aa  52  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00988726  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4449  DNA-binding transcriptional repressor FabR  26.62 
 
 		 215 aa  52  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.563556  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 199 aa  52  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2956  transcriptional regulator, TetR family  24.18 
 
 		 207 aa  52  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03848  DNA-binding transcriptional repressor  26.62 
 
 		 234 aa  52  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0143191  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5426  DNA-binding transcriptional repressor FabR  26.62 
 
 		 234 aa  52  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0614494  normal  0.10498 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4023  transcriptional regulator, TetR family  26.62 
 
 		 234 aa  52  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4504  DNA-binding transcriptional repressor FabR  26.62 
 
 		 215 aa  52  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00559066  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 204 aa  51.6  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4053  DNA-binding transcriptional repressor FabR  26.62 
 
 		 234 aa  52  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.506107  normal  0.0185922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8769  putative transcriptional regulator, TetR family  21.89 
 
 		 202 aa  52  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03797  hypothetical protein  26.62 
 
 		 234 aa  52  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0112282  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4410  DNA-binding transcriptional repressor FabR  26.62 
 
 		 234 aa  52  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0500651  normal  0.0177189 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3495  putative transcriptional regulator, TetR family  20.99 
 
 		 177 aa  52  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5060  transcriptional regulator BetI  26.55 
 
 		 195 aa  51.2  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0255482 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0066  transcriptional regulator  28.24 
 
 		 193 aa  51.6  0.000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17710  transcriptional regulator  24.61 
 
 		 203 aa  51.6  0.000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0632938  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3513  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.809024  normal  0.394338 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1516  transcriptional regulator BetI  25.14 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.026336  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2800  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0177  TetR family transcriptional regulator  23.26 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.775643 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2076  transcriptional regulator, TetR family  24.57 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.954712 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4362  TetR family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0699129  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2824  TetR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 226 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3937  transcriptional regulator, TetR family  24.64 
 
 		 187 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00797355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0658  TetR family transcriptional regulator  22.89 
 
 		 195 aa  50.8  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.609022  normal  0.929409 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0195  DNA-binding transcriptional repressor FabR  27.01 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.685771  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3936  TetR family transcriptional regulator  22.62 
 
 		 197 aa  50.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0494347  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1714  transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.058675  normal  0.0438262 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0129  DNA-binding transcriptional repressor FabR  27.16 
 
 		 218 aa  49.7  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.555645  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8695  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4773  DNA-binding transcriptional repressor FabR  25.97 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00222933  hitchhiker  0.00284138 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2855  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 199 aa  50.1  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00414349  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3786  DNA-binding transcriptional repressor FabR  27.78 
 
 		 212 aa  50.1  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.55352  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  23.16 
 
 		 221 aa  49.7  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0120  DNA-binding transcriptional repressor FabR  25.97 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102544  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4023  DNA-binding transcriptional repressor FabR  25.97 
 
 		 213 aa  50.1  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.23914  normal  0.0336938 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4076  DNA-binding transcriptional repressor FabR  25.97 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>