More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1071 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1071  aminotransferase class-III  100 
 
 
402 aa  829    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1070  aminotransferase class-III  34.02 
 
 
460 aa  240  4e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2220  aminotransferase class-III  35.53 
 
 
411 aa  229  5e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1416  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  34.45 
 
 
477 aa  226  6e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2699  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  34.45 
 
 
472 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1819  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  33.93 
 
 
477 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3367  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  34.87 
 
 
429 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1304  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  35.22 
 
 
472 aa  219  7.999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000448411  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1277  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  34.11 
 
 
457 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0468315  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4387  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  34.87 
 
 
459 aa  218  1e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0627  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  34.87 
 
 
429 aa  218  1e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3540  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  34.87 
 
 
429 aa  218  1e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02942  putrescine:2-oxoglutaric acid aminotransferase, PLP-dependent  35.37 
 
 
468 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0628  putrescine aminotransferase  35.37 
 
 
429 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3255  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  35.37 
 
 
429 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02892  hypothetical protein  35.37 
 
 
459 aa  217  4e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3409  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  35.17 
 
 
459 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3513  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  35.17 
 
 
459 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000252781 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3479  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  35.17 
 
 
459 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3405  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  35.17 
 
 
459 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3575  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  35.17 
 
 
459 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.328531 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3528  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  35.11 
 
 
459 aa  213  5.999999999999999e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.31743 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1580  aminotransferase class-III  34.74 
 
 
411 aa  206  4e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.118025  normal  0.128058 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0869  aminotransferase class-III  33.78 
 
 
395 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0039218 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2247  putative aminotransferase  31.23 
 
 
410 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0940385  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0321  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  33.33 
 
 
391 aa  195  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  34.05 
 
 
403 aa  194  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1636  aminotransferase class-III  33.79 
 
 
403 aa  194  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1633  aminotransferase  31.96 
 
 
360 aa  193  6e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.300646  hitchhiker  0.00646915 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  34.94 
 
 
397 aa  186  4e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1307  ornithine--oxo-acid transaminase  32.99 
 
 
396 aa  186  6e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0673255  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1256  ornithine--oxo-acid transaminase  32.99 
 
 
396 aa  186  6e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1050  ornithine--oxo-acid transaminase  32.99 
 
 
396 aa  186  6e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0273827  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0433  aminotransferase class-III  33.94 
 
 
403 aa  186  6e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.282694  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1231  ornithine--oxo-acid transaminase  32.99 
 
 
396 aa  186  7e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0686  ornithine--oxo-acid transaminase  30.97 
 
 
398 aa  186  8e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000099191  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1044  ornithine--oxo-acid transaminase  32.99 
 
 
399 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1053  ornithine--oxo-acid transaminase  32.74 
 
 
396 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1052  ornithine--oxo-acid transaminase  32.74 
 
 
396 aa  184  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0029  ornithine aminotransferase  32.82 
 
 
402 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.628841  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1071  ornithine--oxo-acid transaminase  32.74 
 
 
396 aa  182  6e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.953264  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1154  ornithine--oxo-acid transaminase  32.74 
 
 
396 aa  182  6e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0322  ornithine aminotransferase  32.6 
 
 
403 aa  182  9.000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1204  ornithine--oxo-acid transaminase  32.48 
 
 
396 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.957107  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4137  ornithine--oxo-acid transaminase  32.48 
 
 
396 aa  182  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2006  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  31.9 
 
 
450 aa  181  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0869  ornithine--oxo-acid transaminase  32.1 
 
 
396 aa  181  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.523488  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0653  aminotransferase class-III  33.58 
 
 
467 aa  181  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0978357  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0175  ornithine aminotransferase  32.55 
 
 
394 aa  180  4e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0170  ornithine aminotransferase  32.55 
 
 
394 aa  180  4e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1784  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  32.97 
 
 
385 aa  180  4.999999999999999e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.74918  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0659  aminotransferase class-III  30.58 
 
 
428 aa  179  7e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0355565 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0976  ornithine--oxo-acid transaminase  34.2 
 
 
396 aa  179  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0957  ornithine--oxo-acid transaminase  34.2 
 
 
396 aa  179  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.593517  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  32.37 
 
 
395 aa  179  1e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1596  acetylornithine aminotransferase  33.87 
 
 
386 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1660  ornithine aminotransferase  31.69 
 
 
410 aa  178  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.567958 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  31.03 
 
 
396 aa  177  3e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3309  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  31.22 
 
 
393 aa  177  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0313  acetylornithine aminotransferase  32.89 
 
 
380 aa  177  4e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  33.06 
 
 
390 aa  176  5e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  31.32 
 
 
395 aa  176  8e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0348  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  33.15 
 
 
395 aa  176  8e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.276087 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1150  aminotransferase  33.25 
 
 
398 aa  175  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.348536 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0425  aminotransferase class-III  31.93 
 
 
396 aa  175  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1291  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  30.05 
 
 
393 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0338748 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1416  acetylornithine aminotransferase  31.45 
 
 
415 aa  174  2.9999999999999996e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0956406 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5565  aminotransferase class-III  28.93 
 
 
426 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.292492  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17220  ornithine aminotransferase  29.57 
 
 
462 aa  172  6.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  31.3 
 
 
395 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2058  aminotransferase class-III  31 
 
 
475 aa  172  9e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0166657  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  30.97 
 
 
403 aa  172  1e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3146  aminotransferase class-III  33.16 
 
 
408 aa  172  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.733649  normal  0.0499094 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3466  ornithine--oxo-acid transaminase  33.51 
 
 
415 aa  171  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0435653  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1243  aminotransferase class-III  30 
 
 
426 aa  171  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000210523  hitchhiker  0.000012077 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0545  ornithine--oxo-acid transaminase  32.23 
 
 
396 aa  170  3e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3034  aminotransferase  29.92 
 
 
433 aa  170  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4481  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  32.72 
 
 
406 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.593317 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2808  ornithine aminotransferase  30.67 
 
 
412 aa  170  4e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.892113  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  29.95 
 
 
448 aa  170  5e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  34.13 
 
 
402 aa  169  6e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2722  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  32.08 
 
 
389 aa  169  8e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.601213  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0187  aminotransferase  29.29 
 
 
425 aa  169  9e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.200608 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1434  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  32.72 
 
 
406 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.845656 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3986  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  32.98 
 
 
406 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2814  ornithine aminotransferase  34.28 
 
 
412 aa  169  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.53224  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0739  acetylornithine aminotransferase  32.34 
 
 
386 aa  169  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.791606  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3460  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  33.15 
 
 
388 aa  168  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640133 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0198  aminotransferase  29.29 
 
 
425 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02850  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  32.45 
 
 
399 aa  168  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000577952  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0207  aminotransferase  29.29 
 
 
425 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3770  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  32.72 
 
 
406 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0233516 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4200  acetylornithine aminotransferase  32.35 
 
 
386 aa  167  4e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3751  aminotransferase class-III  29.68 
 
 
448 aa  167  4e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2083  ornithine/acetylornithine aminotransferase  33.12 
 
 
458 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.128445  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1168  ornithine aminotransferase  30.53 
 
 
407 aa  166  9e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467281  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3316  ornithine aminotransferase  34.51 
 
 
396 aa  166  9e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271295  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  31.23 
 
 
394 aa  165  1.0000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1822  aminotransferase  31.87 
 
 
402 aa  165  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  29.71 
 
 
394 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>