144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1053 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1053  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 187 aa  384  1e-106  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2163  carboxymuconolactone decarboxylase  45.95 
 
 		 194 aa  155  3e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175503  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3712  carboxymuconolactone decarboxylase  49.66 
 
 		 193 aa  149  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2440  carboxymuconolactone decarboxylase  52.45 
 
 		 176 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1632  carboxymuconolactone decarboxylase  45.89 
 
 		 190 aa  138  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.543997 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3746  carboxymuconolactone decarboxylase  48.95 
 
 		 176 aa  135  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.444516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3819  carboxymuconolactone decarboxylase  48.95 
 
 		 176 aa  135  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3758  carboxymuconolactone decarboxylase  48.95 
 
 		 176 aa  135  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.284023  normal  0.718458 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4212  carboxymuconolactone decarboxylase  43.09 
 
 		 176 aa  134  5e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0509659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3120  Carboxymuconolactone decarboxylase  38.98 
 
 		 220 aa  132  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.104846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7089  carboxymuconolactone decarboxylase  42.57 
 
 		 190 aa  132  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2473  carboxymuconolactone decarboxylase  37.85 
 
 		 178 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4181  carboxymuconolactone decarboxylase  38.82 
 
 		 173 aa  121  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.917886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2975  alkylhydroperoxidase  37.7 
 
 		 217 aa  119  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3707  carboxymuconolactone decarboxylase  38.95 
 
 		 176 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3780  carboxymuconolactone decarboxylase  38.95 
 
 		 176 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422655  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3720  carboxymuconolactone decarboxylase  38.37 
 
 		 176 aa  115  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4779  carboxymuconolactone decarboxylase  40.85 
 
 		 229 aa  112  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5137  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.45 
 
 		 185 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2839  carboxymuconolactone decarboxylase  36.72 
 
 		 187 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.242216  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5226  alkylhydroperoxidase  41.45 
 
 		 185 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5518  alkylhydroperoxidase  41.45 
 
 		 185 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0757  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.7 
 
 		 178 aa  106  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0319  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.15 
 
 		 186 aa  101  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2330  carboxymuconolactone decarboxylase  31.84 
 
 		 200 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6281  carboxymuconolactone decarboxylase  36.13 
 
 		 179 aa  99  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00558931  normal  0.0302802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3214  carboxymuconolactone decarboxylase  37.25 
 
 		 193 aa  97.4  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0110  carboxymuconolactone decarboxylase  34.25 
 
 		 179 aa  95.1  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.819214  normal  0.0623628 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2405  carboxymuconolactone decarboxylase  34.87 
 
 		 184 aa  93.6  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.315014 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4316  carboxymuconolactone decarboxylase  32.4 
 
 		 229 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1659  carboxymuconolactone decarboxylase  36.36 
 
 		 183 aa  89.4  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6153  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.89 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11564  hypothetical protein  30.46 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.15 
 
 		 180 aa  83.6  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6226  carboxymuconolactone decarboxylase  29.89 
 
 		 184 aa  82.8  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.676342  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0798  carboxymuconolactone decarboxylase  30.9 
 
 		 180 aa  82  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.629789  normal  0.833566 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0111  carboxymuconolactone decarboxylase  34.51 
 
 		 174 aa  81.3  0.000000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.75447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1934  hypothetical protein  29.27 
 
 		 174 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000792468  normal  0.160018 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1801  carboxymuconolactone decarboxylase  29.14 
 
 		 189 aa  80.5  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198722 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0971  hypothetical protein  27.49 
 
 		 170 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000637227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0633  carboxymuconolactone decarboxylase  30.46 
 
 		 178 aa  79.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.934772  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0646  carboxymuconolactone decarboxylase  30.46 
 
 		 178 aa  79.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.825839 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0626  carboxymuconolactone decarboxylase  30.46 
 
 		 178 aa  79.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.459666  normal  0.287262 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3670  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.65 
 
 		 172 aa  78.2  0.00000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0137  carboxymuconolactone decarboxylase  33.78 
 
 		 185 aa  77.8  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7488  carboxymuconolactone decarboxylase  36.97 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4627  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 183 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0960  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 180 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0988  hypothetical protein  28.25 
 
 		 186 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1245  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.31 
 
 		 178 aa  74.3  0.0000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5095  carboxymuconolactone decarboxylase  34.44 
 
 		 190 aa  74.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.468539 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2233  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.15 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2958  carboxymuconolactone decarboxylase  28.19 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0231766 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5304  carboxymuconolactone decarboxylase  28.95 
 
 		 191 aa  72  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.377989  normal  0.661983 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4644  hypothetical protein  30.14 
 
 		 177 aa  70.5  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1193  carboxymuconolactone decarboxylase  28.87 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739413  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  31.29 
 
 		 173 aa  69.3  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0028  carboxymuconolactone decarboxylase  29.55 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3819  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.82 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3226  carboxymuconolactone decarboxylase  26.36 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.732993  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3805  carboxymuconolactone decarboxylase  27.89 
 
 		 179 aa  68.9  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3288  carboxymuconolactone decarboxylase  26.36 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.93763  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3237  carboxymuconolactone decarboxylase  26.36 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0525831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1658  carboxymuconolactone decarboxylase  29.37 
 
 		 187 aa  67  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.565944  normal  0.978426 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10471  hypothetical protein  30.91 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3153  hypothetical protein  27.37 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2386  4-carboxymuconolactone decarboxylase  27.37 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2093  hypothetical protein  27.37 
 
 		 187 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0291682  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1121  hypothetical protein  27.37 
 
 		 187 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1401  hypothetical protein  27.37 
 
 		 187 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0015  carboxymuconolactone decarboxylase  29.29 
 
 		 173 aa  63.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00130633  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1482  hypothetical protein  26.82 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2083  alkylhydroperoxidase  29.41 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3436  hypothetical protein  28.26 
 
 		 184 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1956  hypothetical protein  27.72 
 
 		 184 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0715147  normal  0.617384 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  32.2 
 
 		 177 aa  60.5  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3980  carboxymuconolactone decarboxylase  27.72 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395763  normal  0.33482 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2914  carboxymuconolactone decarboxylase  28.03 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1494  carboxymuconolactone decarboxylase  24.84 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.269396 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3267  hypothetical protein  26.82 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1611  hypothetical protein  29.26 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0145659 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7422  hypothetical protein  28.46 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.752552  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4279  carboxymuconolactone decarboxylase  27.72 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.445226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4087  carboxymuconolactone decarboxylase  27.72 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3973  transposase  26.67 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112408  normal  0.276962 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1168  Carboxymuconolactone decarboxylase  25.28 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0628655  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2075  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.88 
 
 		 180 aa  58.2  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3497  carboxymuconolactone decarboxylase  27.17 
 
 		 184 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0452  alkylhydroperoxidase  31.36 
 
 		 177 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.500905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0886  hypothetical protein  28.68 
 
 		 186 aa  57  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.717688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5467  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.59 
 
 		 184 aa  57  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6700  uncharacterized peroxidase-related enzyme  36.73 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7158  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  25.28 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2478  Carboxymuconolactone decarboxylase  23.84 
 
 		 226 aa  54.7  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00157967  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2949  hypothetical protein  24.16 
 
 		 194 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5881  Carboxymuconolactone decarboxylase  25.3 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3940  alkylhydroperoxidase  24.07 
 
 		 181 aa  53.1  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4499  carboxymuconolactone decarboxylase  24.59 
 
 		 184 aa  53.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.414463  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1176  Carboxymuconolactone decarboxylase  24.28 
 
 		 180 aa  52  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000527304 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0805  carboxymuconolactone decarboxylase  25.29 
 
 		 188 aa  52  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>