More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1042 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  100 
 
 		 570 aa  1154    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  50.38 
 
 		 520 aa  509  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  50.1 
 
 		 520 aa  496  1e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  49.42 
 
 		 521 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  51.07 
 
 		 520 aa  491  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  51.07 
 
 		 514 aa  491  1e-137  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  51.07 
 
 		 520 aa  491  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  46.58 
 
 		 603 aa  488  1e-136  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  45.28 
 
 		 599 aa  486  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  45.28 
 
 		 599 aa  488  1e-136  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  45.28 
 
 		 599 aa  487  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  44.27 
 
 		 871 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  43.42 
 
 		 558 aa  469  1.0000000000000001e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2609  general secretory pathway protein E  43.45 
 
 		 610 aa  459  9.999999999999999e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0938454  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  44.33 
 
 		 558 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  46.03 
 
 		 559 aa  456  1e-127  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  41.9 
 
 		 568 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3937  general secretory pathway protein E  46.99 
 
 		 495 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  42.38 
 
 		 561 aa  450  1e-125  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3071  general secretory pathway protein E  45.98 
 
 		 515 aa  450  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000785682 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  45.69 
 
 		 580 aa  449  1e-125  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3243  type II secretion system protein E  50.81 
 
 		 499 aa  449  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.12 
 
 		 568 aa  449  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4500  putative general secretion pathway protein E  46.31 
 
 		 522 aa  450  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.155561 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.77 
 
 		 568 aa  449  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0106  general secretory pathway protein E  46.4 
 
 		 514 aa  451  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1889  general secretion pathway protein E  45.67 
 
 		 497 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.902732  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0145  general secretory pathway protein E  44.88 
 
 		 523 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2785  general secretion pathway protein E  45.67 
 
 		 497 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254947  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0062  general secretory pathway protein E  46.89 
 
 		 498 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  42.81 
 
 		 561 aa  447  1.0000000000000001e-124  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  44.46 
 
 		 557 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0221  general secretory pathway protein E  45.67 
 
 		 497 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0008  general secretory pathway protein E  45.67 
 
 		 497 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3517  general secretion pathway protein E  45.67 
 
 		 497 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385541  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2663  general secretion pathway protein E  45.67 
 
 		 497 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0008  general secretion pathway protein E  47.88 
 
 		 497 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3618  general secretory pathway protein E  47.8 
 
 		 523 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0080  general secretory pathway protein E  50.81 
 
 		 499 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0009  Type II secretion system gspE  50.81 
 
 		 499 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0008  general secretory pathway protein E  45.67 
 
 		 497 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0051  general secretory pathway protein E  50.58 
 
 		 499 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.582006  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0061  general secretory pathway protein E  50.81 
 
 		 499 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212522  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.59 
 
 		 568 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0170  general secretion pathway protein E  44.47 
 
 		 520 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  45.68 
 
 		 585 aa  443  1e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0167  general secretion pathway protein E  45.78 
 
 		 521 aa  442  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  41.99 
 
 		 566 aa  442  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  40.67 
 
 		 568 aa  443  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4733  general secretory pathway protein E  50.35 
 
 		 523 aa  444  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0457665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  40.87 
 
 		 568 aa  443  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.91 
 
 		 568 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0157  type II secretion system protein E (GspE)  45.03 
 
 		 521 aa  443  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2030  general secretion pathway protein E  50.35 
 
 		 502 aa  443  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0152  type II secretion system protein E (GspE)  45.22 
 
 		 521 aa  444  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23990  general secretion pathway protein E  50 
 
 		 502 aa  443  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.91 
 
 		 568 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  49.02 
 
 		 553 aa  442  1e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0061  general secretory pathway protein E  50.35 
 
 		 499 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3393  type II secretion system protein E  47.7 
 
 		 513 aa  441  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0152  type II secretion system protein E (GspE)  44.44 
 
 		 521 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.203719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  41.8 
 
 		 553 aa  442  9.999999999999999e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  45.05 
 
 		 563 aa  440  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4357  general secretory pathway protein E  45.98 
 
 		 524 aa  436  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.555593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3579  glycoside hydrolase family protein  47.96 
 
 		 503 aa  436  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.666057 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0122  type II secretion system protein E  45.2 
 
 		 514 aa  437  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.766789  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  39.83 
 
 		 565 aa  437  1e-121  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3666  type II secretion system protein E  42.38 
 
 		 566 aa  436  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.65 
 
 		 568 aa  438  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  43.12 
 
 		 787 aa  433  1e-120  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0154  general secretory pathway protein E  45.22 
 
 		 521 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  42.7 
 
 		 556 aa  432  1e-120  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0226  general secretory pathway protein E  46.92 
 
 		 518 aa  433  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4205  general secretory pathway protein E  45.22 
 
 		 521 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.381078  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  40.65 
 
 		 558 aa  435  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3566  general secretion pathway protein E  45.18 
 
 		 521 aa  435  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.294519  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2377  general secretory pathway protein E  45.4 
 
 		 489 aa  434  1e-120  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  42.21 
 
 		 573 aa  432  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0154  general secretory pathway protein E  45.22 
 
 		 521 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.11492 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  42.36 
 
 		 564 aa  434  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.55 
 
 		 568 aa  434  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0150  general secretory pathway protein E  45.22 
 
 		 521 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  41.13 
 
 		 561 aa  431  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  43.55 
 
 		 553 aa  430  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  48.97 
 
 		 503 aa  429  1e-119  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  42.22 
 
 		 570 aa  431  1e-119  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2923  general secretion pathway protein E  47.3 
 
 		 499 aa  429  1e-119  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001891  general secretion pathway protein E  50.61 
 
 		 500 aa  430  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1349  general secretory pathway protein E  50.12 
 
 		 520 aa  429  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00602  general secretory pathway protein E  50.85 
 
 		 501 aa  431  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3230  type II secretion system protein E (GspE)  47.15 
 
 		 491 aa  428  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0114833  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03957  Type II secretory pathway, ATPase PulE-like protein  52.38 
 
 		 519 aa  426  1e-118  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  41.36 
 
 		 577 aa  427  1e-118  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18700  type II secretion system protein E  46.99 
 
 		 514 aa  426  1e-118  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.04 
 
 		 563 aa  428  1e-118  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.53 
 
 		 571 aa  427  1e-118  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  42.27 
 
 		 564 aa  425  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4590  general secretion pathway protein E  50.7 
 
 		 509 aa  424  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4250  general secretory pathway protein E  50.35 
 
 		 494 aa  425  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0196458 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  39.18 
 
 		 571 aa  425  1e-117  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>