More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1030 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0327  peptidase U32  48.78 
 
 
656 aa  642    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1030  peptidase U32  100 
 
 
656 aa  1341    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3248  peptidase U32  51.61 
 
 
654 aa  626  1e-178  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0074  peptidase U32  48.33 
 
 
697 aa  584  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2141  peptidase U32  49.03 
 
 
709 aa  580  1e-164  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0058  U32 family peptidase  47.41 
 
 
748 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0024  peptidase U32  40.38 
 
 
754 aa  333  4e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0664  peptidase U32  33.18 
 
 
696 aa  238  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0317421  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0065  peptidase U32  39.42 
 
 
822 aa  227  4e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3618  peptidase U32  38.05 
 
 
790 aa  213  7.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0024  peptidase U32  36.71 
 
 
792 aa  211  3e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000675639  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3552  peptidase U32  37.46 
 
 
792 aa  209  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3347  U32 family peptidase  36.21 
 
 
790 aa  206  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0040  peptidase U32  36.95 
 
 
790 aa  205  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0370  peptidase U32  36.52 
 
 
818 aa  205  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0064  collagenase-like protease  35.87 
 
 
790 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1861  peptidase U32  39.63 
 
 
810 aa  191  4e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0071  U32 family peptidase  37.93 
 
 
746 aa  189  9e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1511  peptidase family protein U32  36.81 
 
 
886 aa  188  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2495  peptidase U32  35.22 
 
 
413 aa  177  5e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0229  peptidase U32  37.77 
 
 
872 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.277324  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2391  peptidase U32  36 
 
 
848 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.740262  normal  0.817298 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1159  hypothetical protein  38.55 
 
 
783 aa  174  5.999999999999999e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.904079  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1459  peptidase U32  38.93 
 
 
723 aa  173  7.999999999999999e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2047  peptidase U32  38.26 
 
 
783 aa  172  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1637  peptidase U32  39.26 
 
 
847 aa  171  3e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0426  peptidase U32  37.18 
 
 
767 aa  171  4e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1712  peptidase U32  38.18 
 
 
862 aa  171  5e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000390003  normal  0.623925 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0699  peptidase U32  40.39 
 
 
722 aa  169  1e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0153  peptidase U32  38.93 
 
 
805 aa  169  1e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1084  collagenase  35.32 
 
 
548 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.795762  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0176  peptidase U32  39.62 
 
 
835 aa  168  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2165  peptidase U32  33.79 
 
 
420 aa  166  9e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0547  collagenase  35.29 
 
 
422 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2136  U32 family peptidase  36.33 
 
 
783 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1374  peptidase U32  39.55 
 
 
838 aa  165  3e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.466002  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0587  peptidase U32  34.92 
 
 
840 aa  165  3e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.684095  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1848  U32 family peptidase  36.9 
 
 
783 aa  165  3e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2182  peptidase U32  39.76 
 
 
805 aa  164  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0246456  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2502  collagenase-like protein  38.67 
 
 
746 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.503721  normal  0.268664 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0544  peptidase U32  37.63 
 
 
835 aa  164  6e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.814985  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2286  peptidase U32  38.7 
 
 
716 aa  163  9e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3761  peptidase U32  38.23 
 
 
835 aa  161  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0962396  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2268  peptidase U32  35.56 
 
 
826 aa  160  5e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0673  peptidase U32  34.46 
 
 
396 aa  160  7e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1925  peptidase U32  32.89 
 
 
414 aa  159  1e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.984732  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1107  peptidase U32  38.44 
 
 
836 aa  160  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0104488  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2127  peptidase U32  34.03 
 
 
415 aa  159  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00706152 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1336  peptidase U32  32.56 
 
 
817 aa  159  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0126233  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2966  peptidase U32  36.14 
 
 
877 aa  158  3e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.484686  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05840  peptidase U32  32.51 
 
 
406 aa  157  7e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000158903  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02320  collagenase-like protease  36.9 
 
 
828 aa  156  1e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.265597  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0943  peptidase U32  31.73 
 
 
411 aa  156  1e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0296  peptidase U32  38.15 
 
 
837 aa  155  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0294  collagenase  33.82 
 
 
420 aa  155  2e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0022482 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1010  peptidase U32  33.09 
 
 
411 aa  155  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1337  peptidase U32  38.31 
 
 
736 aa  155  2e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1293  peptidase U32  37.74 
 
 
839 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.461857  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1622  proteinase  37.59 
 
 
823 aa  154  5e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0350786 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1741  U32 family peptidase  33.93 
 
 
409 aa  153  8e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1234  peptidase U32  33.21 
 
 
411 aa  153  1e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2024  U32 family peptidase  33.93 
 
 
409 aa  153  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2093  peptidase U32  33.22 
 
 
413 aa  152  1e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1685  peptidase U32  35.07 
 
 
403 aa  153  1e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2086  peptidase U32  32.72 
 
 
839 aa  152  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0228  peptidase U32  35.07 
 
 
403 aa  151  4e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1237  putative peptidase U32 family protein  37.45 
 
 
851 aa  150  5e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0735  peptidase U32  30.06 
 
 
408 aa  150  6e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0327554  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10034  predicted protein  35.85 
 
 
826 aa  150  9e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1796  peptidase U32  33.14 
 
 
629 aa  150  9e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.191326 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10820  collagenase-like protease  32.9 
 
 
471 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08360  collagenase-like protease  31.79 
 
 
825 aa  147  4.0000000000000006e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.593453 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0916  peptidase U32  34.7 
 
 
403 aa  147  5e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.672629  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3218  peptidase U32  36.33 
 
 
757 aa  147  8.000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000467027 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0917  peptidase U32  36.82 
 
 
835 aa  146  9e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1649  peptidase U32  37.36 
 
 
852 aa  146  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1732  peptidase U32  35.28 
 
 
873 aa  146  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2805  peptidase U32  33.65 
 
 
333 aa  145  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1028  peptidase U32  37.41 
 
 
834 aa  145  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001056  peptidase U32  40.73 
 
 
663 aa  145  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1249  U32 family peptidase  33.96 
 
 
333 aa  145  3e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1171  peptidase U32  33.96 
 
 
336 aa  144  4e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2040  peptidase, U32 family  34.44 
 
 
667 aa  144  6e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0020805  hitchhiker  3.90569e-18 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1614  U32 family peptidase  34.44 
 
 
667 aa  144  6e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2224  peptidase U32  34.44 
 
 
667 aa  144  6e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.787396 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1519  U32 family peptidase  34.44 
 
 
667 aa  144  6e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0738  peptidase U32  33.09 
 
 
439 aa  143  8e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3558  peptidase U32  31.72 
 
 
430 aa  143  9e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000993466  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0703  peptidase U32  38.29 
 
 
841 aa  143  9e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01393  predicted peptidase  34.9 
 
 
653 aa  143  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2211  peptidase U32  34.9 
 
 
653 aa  143  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.722535  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1474  peptidase U32  31.62 
 
 
406 aa  143  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00296183  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04781  peptidase  39.27 
 
 
663 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01403  hypothetical protein  34.9 
 
 
653 aa  143  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1061  peptidase U32  32.92 
 
 
333 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1133  peptidase U32  33.33 
 
 
333 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0867416  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3693  peptidase U32  34.31 
 
 
404 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00154214  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2232  peptidase U32  34.41 
 
 
418 aa  142  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.83326 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3202  peptidase U32  33.64 
 
 
336 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2714  peptidase U32  35.29 
 
 
439 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>