28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1027 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1027  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 347 aa  723    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0904827  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0711  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.94 
 
 		 334 aa  239  4e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1506  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.44 
 
 		 310 aa  202  5e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0135963  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0006  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.02 
 
 		 499 aa  119  6e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0041  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.73 
 
 		 460 aa  100  4e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.294388  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1247  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.54 
 
 		 437 aa  97.4  3e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1372  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.69 
 
 		 480 aa  94.7  2e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0824  endonuclease/exonuclease/phosphatase, putative  31.82 
 
 		 431 aa  85.1  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0502024  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0605  hypothetical protein  26.39 
 
 		 413 aa  74.3  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.662935 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2587  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  26.89 
 
 		 339 aa  72.8  0.000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.140684  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1021  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.94 
 
 		 342 aa  72  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04510  hypothetical protein  29.7 
 
 		 324 aa  69.3  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1377  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.37 
 
 		 325 aa  68.2  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1180  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.44 
 
 		 347 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.494829  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1431  hypothetical protein  24 
 
 		 331 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1119  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.71 
 
 		 348 aa  63.2  0.000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1102  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.74 
 
 		 341 aa  60.8  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1186  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.9 
 
 		 342 aa  60.1  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.402884  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2783  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.91 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0990816  normal  0.632411 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1196  hypothetical protein  22.97 
 
 		 348 aa  55.1  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0946  hypothetical protein  26.87 
 
 		 342 aa  54.3  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02630  hypothetical protein  28.64 
 
 		 359 aa  53.9  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.249483  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1220  hypothetical protein  24.6 
 
 		 363 aa  50.8  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.133242  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4120  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.39 
 
 		 250 aa  49.3  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1327  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.66 
 
 		 245 aa  45.8  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.51669  hitchhiker  0.00270426 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2945  extracellular nuclease  24.36 
 
 		 865 aa  45.8  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.172583 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3718  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.79 
 
 		 870 aa  43.9  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5450  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.2 
 
 		 257 aa  43.1  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>